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UniProtKB/Swiss-Prot Q9Y2J2 (E41L3_HUMAN)
Last modified
January 19, 2010.
Version 95.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (6) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Band 4.1-like protein 3 Alternative name(s): 4.1B Differentially expressed in adenocarcinoma of the lung protein 1 Short name=DAL-1 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 1087 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Critical growth regulator in the pathogenesis of meningiomas. |
| Subunit structure | Interacts with CADM1. Ref.4 |
| Subcellular location | Cytoplasm › cytoskeleton By similarity. |
| Tissue specificity | Expressed at high levels in brain, with lower levels in kidney, intestine, and testis. |
| Sequence similarities | Contains 1 FERM domain. |
| Sequence caution | The sequence AAC79806.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at positions 29 and 59. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cytoplasm Cytoskeleton |
| Coding sequence diversity | Alternative splicing Polymorphism |
| Ligand | Actin-binding |
| PTM | Acetylation Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | cortical actin cytoskeleton organization Inferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Cellular component | cell-cell junction Ref.4 Inferred from direct assay. Source: HGNC cytoplasmInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW cytoskeletonInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell extrinsic to membraneInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Molecular function | actin binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW structural molecule activityInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| ABL1 | P00519 | 1 | EBI-310986,EBI-375543 | |
| CRK | P46108 | 1 | EBI-310986,EBI-886 | |
| FYN | P06241 | 1 | EBI-310986,EBI-515315 | |
| SMYD2 | Q9NRG4 | 1 | EBI-310986,EBI-1055671 | |
| SRC | P12931 | 1 | EBI-310986,EBI-621482 | |
| YWHAB | P31946 | 1 | EBI-310986,EBI-359815 | |
| YWHAG | P61981 | 1 | EBI-310986,EBI-359832 | |
| YWHAQ | P27348 | 1 | EBI-310986,EBI-359854 | |
| YWHAZ | P63104 | 1 | EBI-310986,EBI-347088 |
Alternative products
| This entry describes 3 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] Note: Additional isoforms seem to exist. | ||||||
| Isoform A (identifier: Q9Y2J2-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform B (identifier: Q9Y2J2-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 446-446: G → GASVNENHEIYMKDSMSAA 503-689: Missing. 708-719: Missing. 784-824: Missing. | ||||||
| Isoform C (identifier: Q9Y2J2-3) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 446-446: G → GASVNENHEIYMKDSMSAA 503-689: Missing. 708-719: Missing. 784-824: Missing. 835-1087: Missing. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 1087 | 1087 | Band 4.1-like protein 3 | PRO_0000219399 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 110 – 391 | 282 | FERM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 394 – 513 | 120 | Hydrophilic | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 514 – 860 | 347 | Spectrin--actin-binding Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 861 – 1083 | 223 | Carboxyl-terminal (CTD) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 1 | 1 | N-acetylmethionine Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 3 | 1 | Phosphothreonine Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 5 | 1 | Phosphoserine Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 7 | 1 | Phosphoserine Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 9 | 1 | Phosphoserine Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 11 | 1 | Phosphoserine Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 88 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 405 | 1 | N6-acetyllysine Ref.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 420 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 443 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 460 | 1 | Phosphoserine Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 462 | 1 | Phosphothreonine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 469 | 1 | Phosphothreonine Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 703 | 1 | Phosphothreonine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 704 | 1 | Phosphothreonine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 708 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 760 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 762 | 1 | Phosphoserine Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 784 | 1 | Phosphothreonine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 787 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 788 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 962 | 1 | Phosphoserine Ref.7 Ref.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 1081 | 1 | Phosphothreonine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 446 | 1 | G → GASVNENHEIYMKDSMSAA in isoform B and isoform C. | VSP_000482 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 503 – 689 | 187 | Missing in isoform B and isoform C. | VSP_000483 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 708 – 719 | 12 | Missing in isoform B and isoform C. | VSP_000484 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 784 – 824 | 41 | Missing in isoform B and isoform C. | VSP_000485 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 835 – 1087 | 253 | Missing in isoform C. | VSP_000486 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 555 | 1 | A → T: dbSNP rs9966357. | VAR_048353 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 575 | 1 | Y → C: dbSNP rs8082898. | VAR_048354 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 859 | 1 | E → Q: dbSNP rs8096452. | VAR_048355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 32 | 1 | Missing in AAC79806. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 498 | 1 | R → Q in AAC79806. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 109 – 115 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 121 – 127 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 132 – 142 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 148 – 150 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 151 – 156 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 162 – 164 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 171 – 174 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 180 – 188 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 193 – 195 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 199 – 214 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 222 – 237 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 242 – 244 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 247 – 252 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 256 – 258 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 261 – 273 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 274 – 276 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 279 – 290 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 294 – 297 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 299 – 304 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 310 – 315 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 317 – 324 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 327 – 333 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 334 – 336 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 339 – 343 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 346 – 351 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 354 – 357 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 361 – 366 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 370 – 388 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||||||||
References
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Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AF069072 mRNA. Translation: AAC79806.1. Frameshift. AB023204 mRNA. Translation: BAA76831.1. Different initiation. BC006141 mRNA. Translation: AAH06141.1. | ||||||||||||||||||
| IPI | IPI00032230. IPI00215716. IPI00215717. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_036439.2. | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.213394 | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| SMR | Q9Y2J2. Positions 107-439. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| DIP | DIP-17035N. | ||||||||||||||||||
| IntAct | Q9Y2J2. 14 interactions. | ||||||||||||||||||
| STRING | Q9Y2J2. | ||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q9Y2J2. | ||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||
| PRIDE | Q9Y2J2. | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000341928; ENSP00000343158; ENSG00000082397; Homo sapiens. [Genome view] ENST00000342933; ENSP00000341138; ENSG00000082397; Homo sapiens. [Genome view] | ||||||||||||||||||
| GeneID | 23136. | ||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:23136. | ||||||||||||||||||
| UCSC | uc002kmt.1. human. uc002kmu.1. human. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CTD | 23136. | ||||||||||||||||||
| GeneCards | GC18M005382. | ||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0014312. | ||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:3380. EPB41L3. | ||||||||||||||||||
| MIM | 605331. gene. | ||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA27813. | ||||||||||||||||||
| HUGE | Search... | ||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| eggNOG | prNOG15711. | ||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG715532. | ||||||||||||||||||
| HOVERGEN | Q9Y2J2. | ||||||||||||||||||
| InParanoid | Q9Y2J2. | ||||||||||||||||||
| OMA | EFIGGVT. | ||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG93FKG9. | ||||||||||||||||||
| PhylomeDB | Q9Y2J2. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q9Y2J2. | ||||||||||||||||||
| Bgee | Q9Y2J2. | ||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_EPB41L3. | ||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q9Y2J2. | ||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000082397. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR008379. Band_4.1_C. IPR019749. Band_41_domain. IPR019750. Band_41_sg. IPR000798. Ez/rad/moesin. IPR014847. FERM-adjacent. IPR014352. FERM/acyl-CoA_bd_prot_3-hlx. IPR019748. FERM_central. IPR019747. FERM_CS. IPR000299. FERM_domain. IPR018979. FERM_N. IPR018980. FERM_PH-like_C. IPR011993. PH_type. IPR007477. SAB. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:1.20.80.10. ACBP. 1 hit. G3DSA:2.30.29.30. PH_type. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF05902. 4_1_CTD. 1 hit. PF08736. FA. 1 hit. PF09380. FERM_C. 1 hit. PF00373. FERM_M. 1 hit. PF09379. FERM_N. 1 hit. PF04382. SAB. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00935. BAND41. PR00661. ERMFAMILY. | ||||||||||||||||||
| SMART | SM00295. B41. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00660. FERM_1. 1 hit. PS00661. FERM_2. 1 hit. PS50057. FERM_3. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||
| NextBio | 44399. | ||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | E41L3_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q9Y2J2 Secondary accession number(s): O95713, Q9BRP5 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
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