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UniProtKB/Swiss-Prot Q9X0X0 (PUR7_THEMA)
Last modified
June 16, 2009.
Version 65.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (3) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase EC=6.3.2.6 Alternative name(s): SAICAR synthetase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Thermotoga maritima [Complete proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 2336 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Thermotogae › Thermotogales › Thermotogaceae › Thermotoga |
Protein attributes
| Sequence length | 230 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | ATP + 5-amino-1-(5-phospho-D-ribosyl)imidazole-4-carboxylate + L-aspartate = ADP + phosphate + (S)-2-(5-amino-1-(5-phospho-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamido)succinate. HAMAP MF_00137 |
| Pathway | Purine metabolism; IMP biosynthesis via de novo pathway; 5-amino-1-(5-phospho-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamide from N(2)-formyl-N(1)-(5-phospho-D-ribosyl)glycinamide: step 4/5. HAMAP MF_00137 |
| Sequence similarities | Belongs to the SAICAR synthetase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Purine biosynthesis |
| Ligand | ATP-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Ligase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | purine nucleotide biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: HAMAP |
| Molecular function | ATP binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase activityInferred from electronic annotation. Source: HAMAP |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 230 | 230 | Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase HAMAP MF_00137 | PRO_0000100891 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 8 – 13 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 16 – 21 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 39 – 56 | 18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 61 – 67 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 68 – 70 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 71 – 74 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 81 – 89 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 92 – 98 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 105 – 115 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 118 – 120 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 127 – 132 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 138 – 160 | 23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 161 – 163 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 164 – 171 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 173 – 175 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 181 – 183 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 189 – 191 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 192 – 196 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 203 – 208 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 209 – 211 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 215 – 227 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Evidence for lateral gene transfer between Archaea and Bacteria from genome sequence of Thermotoga maritima." Nelson K.E., Clayton R.A., Gill S.R., Gwinn M.L., Dodson R.J., Haft D.H., Hickey E.K., Peterson J.D., Nelson W.C., Ketchum K.A., McDonald L.A., Utterback T.R., Malek J.A., Linher K.D., Garrett M.M., Stewart A.M., Cotton M.D., Pratt M.S. Fraser C.M.Nature 399:323-329(1999) [PubMed: 10360571] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 43589 / MSB8 / DSM 3109 / JCM 10099. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AE000512 Genomic DNA. Translation: AAD36318.1. | |||||||||||||
| PIR | E72276. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_229048.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| |||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| GeneID | 898240. | ||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus TM_1243 in contig AE000512_GR. | ||||||||||||
| KEGG | tma:TM1243. | ||||||||||||
| NMPDR | fig|243274.1.peg.1232. | ||||||||||||
| TIGR | TM_1243. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| HOGENOM | Q9X0X0. | ||||||||||||
| OMA | Q9X0X0. TAFNAQK. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | TMAR243274:TM_1243-MON. | ||||||||||||
| BRENDA | 6.3.2.6. 16699. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| HAMAP | MF_00137. [Tree] | ||||||||||||
| InterPro | IPR013816. ATP_grasp_subdomain_2. IPR001636. SAICAR_synt. IPR018236. SAICAR_synthetase_CS. [Graphical view] | ||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.30.470.20. ATP_grasp_subdomain_2. 1 hit. | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR11609. SAICAR_synt. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF01259. SAICAR_synt. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProDom | PD003043. SAICAR_synt. 1 hit. [Graphical view] [Entries sharing at least one domain] | ||||||||||||
| PROSITE | PS01057. SAICAR_SYNTHETASE_1. 1 hit. PS01058. SAICAR_SYNTHETASE_2. False negative. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | PUR7_THEMA | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q9X0X0 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HAMAP (High-quality Automated and Manual Annotation of microbial Proteomes) | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


