Q9X0X0 (PUR7_THEMA) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
January 25, 2012.
Version 81.
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| Protein names | Recommended name: Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase EC=6.3.2.6 Alternative name(s): SAICAR synthetase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Thermotoga maritima | ||||
| Taxonomic identifier | 2336 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Thermotogae › Thermotogales › Thermotogaceae › Thermotoga |
Protein attributes
| Sequence length | 230 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | ATP + 5-amino-1-(5-phospho-D-ribosyl)imidazole-4-carboxylate + L-aspartate = ADP + phosphate + (S)-2-(5-amino-1-(5-phospho-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamido)succinate. HAMAP MF_00137 |
| Pathway | Purine metabolism; IMP biosynthesis via de novo pathway; 5-amino-1-(5-phospho-D-ribosyl)imidazole-4-carboxamide from 5-amino-1-(5-phospho-D-ribosyl)imidazole-4-carboxylate: step 1/2. HAMAP MF_00137 |
| Sequence similarities | Belongs to the SAICAR synthetase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Purine biosynthesis |
| Ligand | ATP-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Ligase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | purine nucleotide biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular function | ATP binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase activityInferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 230 | 230 | Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase HAMAP MF_00137 | PRO_0000100891 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 8 – 13 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 16 – 21 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 39 – 56 | 18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 61 – 67 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 68 – 70 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 71 – 74 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 81 – 89 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 92 – 98 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 105 – 115 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 118 – 120 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 127 – 132 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 138 – 160 | 23 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 161 – 163 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 164 – 171 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 173 – 175 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 181 – 183 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 189 – 191 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 192 – 196 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 203 – 208 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 209 – 211 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 215 – 227 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Evidence for lateral gene transfer between Archaea and Bacteria from genome sequence of Thermotoga maritima." Nelson K.E., Clayton R.A., Gill S.R., Gwinn M.L., Dodson R.J., Haft D.H., Hickey E.K., Peterson J.D., Nelson W.C., Ketchum K.A., McDonald L.A., Utterback T.R., Malek J.A., Linher K.D., Garrett M.M., Stewart A.M., Cotton M.D., Pratt M.S. Fraser C.M.Nature 399:323-329(1999) [PubMed: 10360571] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 43589 / MSB8 / DSM 3109 / JCM 10099. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AE000512 Genomic DNA. Translation: AAD36318.1. | ||||||||||||
| PIR | E72276. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_229048.1. NC_000853.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q9X0X0. | ||||||||||||
| SMR | Q9X0X0. Positions 2-230. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| GeneID | 898240. | ||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus TM_1243 in contig AE000512_GR. | ||||||||||||
| KEGG | tma:TM1243. | ||||||||||||
| NMPDR | fig|243274.1.peg.1232. | ||||||||||||
| PATRIC | 23937426. VBITheMar51294_1259. | ||||||||||||
| TIGR | TM_1243. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| HOGENOM | HBG306070. | ||||||||||||
| OMA | YKDDALG. | ||||||||||||
| PhylomeDB | Q9X0X0. | ||||||||||||
| ProtClustDB | PRK09362. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | TMAR243274:TM_1243-MONOMER. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| HAMAP | MF_00137. SAICAR_synth. [Tree] | ||||||||||||
| InterPro | IPR013816. ATP_grasp_subdomain_2. IPR001636. SAICAR_synth. IPR018236. SAICAR_synthetase_CS. [Graphical view] | ||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.30.470.20. ATP_grasp_subdomain_2. 1 hit. | ||||||||||||
| KO | K01923. | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR11609. SAICAR_synt. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF01259. SAICAR_synt. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PROSITE | PS01057. SAICAR_SYNTHETASE_1. 1 hit. PS01058. SAICAR_SYNTHETASE_2. False negative. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | PUR7_THEMA | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q9X0X0 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with