Q9ULT8 (HECD1_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 29, 2013.
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| Protein names | Recommended name: E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1 EC=6.3.2.- Alternative name(s): E3 ligase for inhibin receptor EULIR HECT domain-containing protein 1 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 2610 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Probable E3 ubiquitin-protein ligase which accepts ubiquitin from an E2 ubiquitin-conjugating enzyme in the form of a thioester and then directly transfers the ubiquitin to targeted substrates. May be required for development of the head mesenchyme and neural tube closure By similarity. |
| Pathway | |
| Subunit structure | Interacts with IGSF1. Ref.7 |
| Sequence similarities | Belongs to the UPL family. K-HECT subfamily. Contains 4 ANK repeats. Contains 1 HECT (E6AP-type E3 ubiquitin-protein ligase) domain. Contains 1 MIB/HERC2 domain. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Ubl conjugation pathway |
| Coding sequence diversity | Polymorphism |
| Domain | ANK repeat Repeat |
| Molecular function | Ligase |
| PTM | Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | neural tube closure Inferred from electronic annotation. Source: Compara protein ubiquitination involved in ubiquitin-dependent protein catabolic processInferred from Biological aspect of Ancestor. Source: RefGenome |
| Cellular_component | cytoplasm Inferred from Biological aspect of Ancestor. Source: RefGenome nucleusInferred from Biological aspect of Ancestor. Source: RefGenome |
| Molecular_function | metal ion binding Inferred from electronic annotation. Source: InterPro ubiquitin-protein ligase activityInferred from Biological aspect of Ancestor. Source: RefGenome |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 2610 | 2610 | E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1 | PRO_0000083945 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 395 – 424 | 30 | ANK 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 426 – 455 | 30 | ANK 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 459 – 491 | 33 | ANK 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 579 – 612 | 34 | ANK 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 1266 – 1338 | 73 | MIB/HERC2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 2151 – 2610 | 460 | HECT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 2029 – 2103 | 75 | K-box | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 1350 – 1649 | 300 | Ser-rich | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 2579 | 1 | Glycyl thioester intermediate By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 631 | 1 | Phosphoserine Ref.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 1390 | 1 | Phosphoserine By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 1488 | 1 | Phosphoserine Ref.8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 656 | 1 | Q → H. Corresponds to variant rs11620816 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_059666 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 2027 | 1 | L → P. Ref.3 Ref.4 Ref.5 Corresponds to variant rs1315794 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_067707 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 561 | 1 | K → Q in AAP13073. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 603 | 1 | L → I in AAP13073. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 611 – 613 | 3 | FLD → YKH in AAP13073. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 653 | 1 | K → Q in AAP13073. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 894 | 1 | E → K in AAP13073. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 927 – 944 | 18 | SMDLD…VERIN → VSIFRATKQKQNEVPKVILS in AAP13073. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 951 | 1 | S → T in AAP13073. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 1281 | 1 | I → T in BAA86445. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1270 – 1272 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1279 – 1282 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 1289 – 1292 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1299 – 1301 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1309 – 1314 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 1315 – 1317 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1319 – 1325 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1326 – 1328 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1332 – 1334 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1883 – 1886 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1896 – 1902 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1905 – 1908 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1910 – 1920 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1923 – 1928 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1935 – 1941 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1944 – 1957 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 1960 – 1962 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AY254380 mRNA. Translation: AAP13073.1. AL121808 Genomic DNA. No translation available. AL136418 Genomic DNA. No translation available. CH471078 Genomic DNA. Translation: EAW65950.1. CH471078 Genomic DNA. Translation: EAW65952.1. AB032957 mRNA. Translation: BAA86445.2. AL110222 mRNA. Translation: CAB53681.1. BC011658 mRNA. Translation: AAH11658.2. BC063686 mRNA. Translation: AAH63686.1. | ||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00328911. | ||||||||||||||||||||||||
| PIR | T14761. | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_056197.2. NM_015382.2. | ||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.708017. | ||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q9ULT8. | ||||||||||||||||||||||||
| SMR | Q9ULT8. Positions 1266-1338, 1879-1966. | ||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-31669N. | ||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q9ULT8. 6 interactions. | ||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-6783566. | ||||||||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000382269. | ||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q9ULT8. | ||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 85682779. | ||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | Q9ULT8. | ||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | Q9ULT8. | ||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q9ULT8. | ||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000399332; ENSP00000382269; ENSG00000092148. ENST00000553700; ENSP00000450697; ENSG00000092148. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 25831. | ||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:25831. | ||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc001wrc.1. human. | ||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||
| CTD | 25831. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC14M031569. | ||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:20157. HECTD1. | ||||||||||||||||||||||||
| HPA | HPA002929. | ||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_Q9ULT8. | ||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA134989284. | ||||||||||||||||||||||||
| HUGE | Search... | ||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG5021. | ||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000018061. | ||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG067533. | ||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | Q9ULT8. | ||||||||||||||||||||||||
| KO | K12231. | ||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||
| UniPathway | UPA00143. | ||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q9ULT8. | ||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q9ULT8. | ||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_HECTD1. | ||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q9ULT8. | ||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000092148. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | 1.25.10.10. 2 hits. 1.25.40.20. 1 hit. 2.60.120.260. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR002110. Ankyrin_rpt. IPR020683. Ankyrin_rpt-contain_dom. IPR011989. ARM-like. IPR016024. ARM-type_fold. IPR008979. Galactose-bd-like. IPR000569. HECT. IPR010606. Mib_Herc2. IPR012919. Sad1_UNC_C. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF12796. Ank_2. 1 hit. PF00632. HECT. 1 hit. PF06701. MIB_HERC2. 1 hit. PF07738. Sad1_UNC. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00248. ANK. 3 hits. SM00119. HECTc. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF48403. ANK. 1 hit. SSF48371. ARM-type_fold. 1 hit. SSF49785. Gal_bind_like. 1 hit. SSF56204. HECT. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50297. ANK_REP_REGION. 1 hit. PS50088. ANK_REPEAT. 2 hits. PS50237. HECT. 1 hit. PS51416. MIB_HERC2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||
| ChiTaRS | HECTD1. human. | ||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q9ULT8. | ||||||||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 25831. | ||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 47125. | ||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | HECD1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q9ULT8 Secondary accession number(s): D3DS86 Q9UFZ7 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 14 Human chromosome 14: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
