Reviewed,
UniProtKB/Swiss-Prot Q9UJY5 (GGA1_HUMAN)
Last modified
June 16, 2009.
Version 102.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (6) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1 Alternative name(s): Golgi-localized, gamma ear-containing, ARF-binding protein 1 Gamma-adaptin-related protein 1 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 639 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Plays a role in protein sorting and trafficking between the trans-Golgi network (TGN) and endosomes. Mediates the ARF-dependent recruitment of clathrin to the TGN and binds ubiquitinated proteins and membrane cargo molecules with a cytosolic acidic cluster-dileucine (AC-LL) motif. Ref.9 |
| Subunit structure | Monomeric. Interacts with NECAP1 By similarity. Interacts with GGA2 and GGA3. Binds to clathrin and activated ARFs. Interacts with RABEP1 and RABGEF1. Interacts with the type-I membrane proteins SORT1, SORL1, LRP3, M6PR/CD-MPR, IGF2R/CI-MPR and BACE1. Binds CCDC91, P200, AP1GBP1, EPN4, NECAP2 and AFTPH/aftiphilin. Interacts with TSG101 and UBC. |
| Subcellular location | Golgi apparatus › trans-Golgi network membrane; Peripheral membrane protein. Endosome membrane; Peripheral membrane protein. Ref.19 Ref.24 |
| Tissue specificity | Ubiquitously expressed. |
| Domain | The VHS domain functions as a recognition module for sorting signals composed of an acidic cluster followed by two leucines (AC-LL motif). The GAT domain is responsible for interaction with ARF-GTP, UBC and RABEP1. Required for recruitment to the TGN it prevents ARF-GTP hydrolysis. The unstructured hinge region contains clathrin-binding but no autoinhibitory (AC-LL) motifs. The GAE domain binds accessory proteins regulating GGAs function. |
| Post-translational modification | Phosphorylated by CK2 and dephosphorylated by PP2A. Phosphorylation of GGA1 allows the internal AC-LL motif to bind the VHS domain and to inhibit the recognition of cargo signals. Phosphorylated upon DNA damage, probably by ATM or ATR. Ref.14 Ref.17 Ref.25 Ubiquitinated By similarity. |
| Sequence similarities | Belongs to the GGA protein family. Contains 1 GAE domain. Contains 1 GAT domain. Contains 1 VHS domain. |
| Caution | It is uncertain whether Met-1 or Met-5 is the initiator. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Protein transport Transport |
| Cellular component | Endosome Golgi apparatus Membrane |
| Coding sequence diversity | Alternative splicing Polymorphism |
| PTM | Phosphoprotein Ubl conjugation |
| Technical term | 3D-structure |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | intracellular protein transport Traceable author statement. Source: UniProtKB vesicle-mediated transportInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Cellular component | Golgi apparatus part Inferred from electronic annotation. Source: InterPro clathrin adaptor complexInferred from electronic annotation. Source: InterPro endosome membraneInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | protein binding Ref.16 Ref.23 Ref.28 Inferred from physical interaction. Source: IntAct |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| Arf2 | Q8BSL7 | 1 | EBI-447141,EBI-931380 | From a different organism. |
| RABEP1 | Q15276 | 4 | EBI-447141,EBI-447043 | |
| RABGEF1 | O18973 | 1 | EBI-447141,EBI-447376 | From a different organism. |
| RPS27A | P62988 | 1 | EBI-447141,EBI-413034 |
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: Q9UJY5-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: Q9UJY5-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 69-101: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 639 | 639 | ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1 | PRO_0000212680 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 17 – 147 | 131 | VHS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 171 – 299 | 129 | GAT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 510 – 631 | 122 | GAE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 114 – 274 | 161 | Interaction with ARF3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 300 – 509 | 210 | Unstructured hinge | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 358 – 362 | 5 | Autoinhibitory | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 236 | 1 | Phosphoserine Ref.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 355 | 1 | Phosphoserine; by CK2 Probable | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 69 – 101 | 33 | Missing in isoform 2. | VSP_001744 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 239 | 1 | G → S in a breast cancer sample; somatic mutation. Ref.30 | VAR_036522 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 484 | 1 | P → A in a breast cancer sample; somatic mutation. Ref.30 | VAR_036523 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 92 | 1 | N → A: Abolishes interaction with IGF2R. Ref.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 182 | 1 | L → A: Abolishes interaction with ARF1, UBC and TSG101. Ref.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 194 | 1 | N → A: Abolishes interaction with ARF1 and RABEP1. Ref.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 197 | 1 | I → A: Abolishes interaction with ARF1, UBC and TSG101. Ref.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 198 | 1 | K → A: Abolishes interaction with ARF1. Ref.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 200 | 1 | M → A: Abolishes interaction with ARF1. Ref.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 204 | 1 | D → A: Abolishes interaction with ARF1. Ref.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 259 | 1 | M → K: Abolishes interaction with RABEP1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 260 | 1 | R → A: No effect on interaction with RABEP1. Ref.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 260 | 1 | R → E: Abolishes interaction with RABEP1 and UBC. Ref.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 264 | 1 | F → A: Abolishes interaction with RABEP1. Ref.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 267 | 1 | A → D: Abolishes interaction with RABEP1 and UBC. Ref.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 277 | 1 | L → A: Abolishes interaction with RABEP1, UBC and TSG101. Ref.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 281 | 1 | L → A: Abolishes interaction with RABEP1. Ref.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 284 | 1 | N → A: Abolishes interaction with RABEP1. Ref.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 284 | 1 | N → S: Abolishes interaction with RABEP1. Ref.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 355 | 1 | S → A: Increased interaction with IGF2R. Reduced phosphorylation. Ref.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 355 | 1 | S → D: Abolishes interaction with IGF2R. Ref.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 356 – 360 | 5 | LLDDE → AADAA: Partial loss of clathrin-binding. Ref.9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 358 | 1 | D → A: Increased interaction with IGF2R. Ref.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 361 – 362 | 2 | LM → AA: Increased interaction with IGF2R. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 563 | 1 | A → D: Abolishes interaction with CCDC91. Ref.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 564 | 1 | V → D: Abolishes interaction with CCDC91. Ref.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 570 | 1 | V → E: Abolishes interaction with CCDC91. Ref.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 572 | 1 | L → E: Abolishes interaction with CCDC91. Ref.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 3 – 5 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 10 – 17 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 27 – 38 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 43 – 55 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 60 – 76 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 78 – 85 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 88 – 98 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 100 – 106 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 109 – 125 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 130 – 141 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 172 – 182 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 187 – 205 | 19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 209 – 234 | 26 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 246 – 257 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 259 – 267 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 274 – 297 | 24 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 298 – 300 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 494 – 497 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 504 – 506 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 515 – 520 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 523 – 531 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 540 – 549 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 555 – 563 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 568 – 572 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 592 – 599 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 608 – 616 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 619 – 627 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 633 – 635 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 636 – 638 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "A family of ADP-ribosylation factor effectors that can alter transport through the trans-Golgi." Boman A.L., Zhang C.-J., Zhu X., Kahn R.A. Mol. Biol. Cell 11:1241-1255(2000) [PubMed: 10749927] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). |
| [2] | "GGAs: a family of ADP ribosylation factor-binding proteins related to adaptors and associated with the Golgi complex." Dell'Angelica E.C., Puertollano R., Mullins C., Aguilar R.C., Vargas J.D., Hartnell L.M., Bonifacino J.S. J. Cell Biol. 149:81-94(2000) [PubMed: 10747089] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). Tissue: Heart. |
| [3] | "A family of proteins with gamma-adaptin and VHS domains that facilitate trafficking between the trans-Golgi network and the vacuole/lysosome." Hirst J., Lui W.W.Y., Bright N.A., Totty N., Seaman M.N.J., Robinson M.S. J. Cell Biol. 149:67-80(2000) [PubMed: 10747088] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). |
| [4] | "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs." Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., Otsuki T., Sugiyama T., Irie R., Wakamatsu A., Hayashi K., Sato H., Nagai K., Kimura K., Makita H., Sekine M., Obayashi M., Nishi T., Shibahara T., Tanaka T., Ishii S. Sugano S.Nat. Genet. 36:40-45(2004) [PubMed: 14702039] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORM 1). |
| [5] | "The DNA sequence of human chromosome 22." Dunham I., Hunt A.R., Collins J.E., Bruskiewich R., Beare D.M., Clamp M., Smink L.J., Ainscough R., Almeida J.P., Babbage A.K., Bagguley C., Bailey J., Barlow K.F., Bates K.N., Beasley O.P., Bird C.P., Blakey S.E., Bridgeman A.M. Wright H.Nature 402:489-495(1999) [PubMed: 10591208] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA] (ISOFORMS 1 AND 2). |
| [6] | "The full-ORF clone resource of the German cDNA consortium." Bechtel S., Rosenfelder H., Duda A., Schmidt C.P., Ernst U., Wellenreuther R., Mehrle A., Schuster C., Bahr A., Blocker H., Heubner D., Hoerlein A., Michel G., Wedler H., Kohrer K., Ottenwalder B., Poustka A., Wiemann S., Schupp I. BMC Genomics 8:399-399(2007) [PubMed: 17974005] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] OF 31-639 (ISOFORM 1). Tissue: Testis. |
| [7] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] OF 275-639. Tissue: Brain. |
| [8] | "Adaptor gamma ear homology domain conserved in gamma-adaptin and GGA proteins that interact with gamma-synergin." Takatsu H., Yoshino K., Nakayama K. Biochem. Biophys. Res. Commun. 271:719-725(2000) [PubMed: 10814529] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH AP1GBP1. |
| [9] | "The GGAs promote ARF-dependent recruitment of clathrin to the TGN." Puertollano R., Randazzo P.A., Presley J.F., Hartnell L.M., Bonifacino J.S. Cell 105:93-102(2001) [PubMed: 11301005] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH CLATHRIN, FUNCTION, MUTAGENESIS OF 356-LEU--GLU-360. |
| [10] | "Golgi-localizing, gamma-adaptin ear homology domain, ADP-ribosylation factor-binding (GGA) proteins interact with acidic dileucine sequences within the cytoplasmic domains of sorting receptors through their Vps27p/Hrs/STAM (VHS) domains." Takatsu H., Katoh Y., Shiba Y., Nakayama K. J. Biol. Chem. 276:28541-28545(2001) [PubMed: 11390366] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH SORT1; LRP3 AND IGF2R. |
| [11] | "Sorting of mannose 6-phosphate receptors mediated by the GGAs." Puertollano R., Aguilar R.C., Gorshkova I., Crouch R.J., Bonifacino J.S. Science 292:1712-1716(2001) [PubMed: 11387475] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH M6PR AND IGF2R. |
| [12] | "GGA proteins associate with Golgi membranes through interaction between their GGAH domains and ADP-ribosylation factors." Takatsu H., Yoshino K., Toda K., Nakayama K. Biochem. J. 365:369-378(2002) [PubMed: 11950392] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH ARF1; ARF5 AND ARF6. |
| [13] | "The sorLA cytoplasmic domain interacts with GGA1 and -2 and defines minimum requirements for GGA binding." Jacobsen L., Madsen P., Nielsen M.S., Geraerts W.P.M., Gliemann J., Smit A.B., Petersen C.M. FEBS Lett. 511:155-158(2002) [PubMed: 11821067] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH SORT1 AND SORL1. |
| [14] | "Autoinhibition of the ligand-binding site of GGA1/3 VHS domains by an internal acidic cluster-dileucine motif." Doray B., Bruns K., Ghosh P., Kornfeld S.A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99:8072-8077(2002) [PubMed: 12060753] [Abstract] Cited for: MUTAGENESIS OF ASN-92; SER-355; ASP-358 AND 361-LEU-MET-362, PHOSPHORYLATION AT SER-355, INTERACTION WITH IGF2R. |
| [15] | "Biochemical and structural characterization of the interaction of memapsin 2 (beta-secretase) cytosolic domain with the VHS domain of GGA proteins." He X., Zhu G., Koelsch G., Rodgers K.K., Zhang X.C., Tang J. Biochemistry 42:12174-12180(2003) [PubMed: 14567678] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH BACE1. |
| [16] | "Divalent interaction of the GGAs with the Rabaptin-5-Rabex-5 complex." Mattera R., Arighi C.N., Lodge R., Zerial M., Bonifacino J.S. EMBO J. 22:78-88(2003) [PubMed: 12505986] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH RABEP1 AND RABGEF1. |
| [17] | "Phosphorylation-induced conformational changes regulate GGAs 1 and 3 function at the trans-Golgi network." Ghosh P., Kornfeld S. J. Biol. Chem. 278:14543-14549(2003) [PubMed: 12578827] [Abstract] Cited for: REGULATION BY PHOSPHORYLATION, DEPHOSPHORYLATION BY PP2A. |
| [18] | "EpsinR: an AP1/clathrin interacting protein involved in vesicle trafficking." Mills I.G., Praefcke G.J.K., Vallis Y., Peter B.J., Olesen L.E., Gallop J.L., Butler P.J.G., Evans P.R., McMahon H.T. J. Cell Biol. 160:213-222(2003) [PubMed: 12538641] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH EPN4. |
| [19] | "Mammalian GGAs act together to sort mannose 6-phosphate receptors." Ghosh P., Griffith J., Geuze H.J., Kornfeld S. J. Cell Biol. 163:755-766(2003) [PubMed: 14638859] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH GGA2 AND GGA3, SUBCELLULAR LOCATION. |
| [20] | "Binding partners for the COOH-terminal appendage domains of the GGAs and gamma-adaptin." Lui W.W.Y., Collins B.M., Hirst J., Motley A., Millar C., Schu P., Owen D.J., Robinson M.S. Mol. Biol. Cell 14:2385-2398(2003) [PubMed: 12808037] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH CCDC91; P200 AND AP1GBP1, MUTAGENESIS OF ALA-563; VAL-564; VAL-570 AND LEU-572. |
| [21] | "GAT (GGA and Tom1) domain responsible for ubiquitin binding and ubiquitination." Shiba Y., Katoh Y., Shiba T., Yoshino K., Takatsu H., Kobayashi H., Shin H.-W., Wakatsuki S., Nakayama K. J. Biol. Chem. 279:7105-7111(2004) [PubMed: 14660606] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH UBC. |
| [22] | "Definition of the consensus motif recognized by gamma-adaptin ear domains." Mattera R., Ritter B., Sidhu S.S., McPherson P.S., Bonifacino J.S. J. Biol. Chem. 279:8018-8028(2004) [PubMed: 14665628] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH NECAP2 AND AFTPH. |
| [23] | "The trihelical bundle subdomain of the GGA proteins interacts with multiple partners through overlapping but distinct sites." Mattera R., Puertollano R., Smith W.J., Bonifacino J.S. J. Biol. Chem. 279:31409-31418(2004) [PubMed: 15143060] [Abstract] Cited for: INTERACTION WITH ARF1; RABEP1; UBC AND TSG101, MUTAGENESIS OF LEU-182; ASN-194; ILE-197; LYS-198; MET-200; ASP-204; ARG-260; PHE-264; ALA-267; LEU-277; LEU-281 AND ASN-284. |
| [24] | "Interactions of GGA3 with the ubiquitin sorting machinery." Puertollano R., Bonifacino J.S. Nat. Cell Biol. 6:244-251(2004) [PubMed: 15039775] [Abstract] Cited for: SUBCELLULAR LOCATION. |
| [25] | "ATM and ATR substrate analysis reveals extensive protein networks responsive to DNA damage." Matsuoka S., Ballif B.A., Smogorzewska A., McDonald E.R. III, Hurov K.E., Luo J., Bakalarski C.E., Zhao Z., Solimini N., Lerenthal Y., Shiloh Y., Gygi S.P., Elledge S.J. Science 316:1160-1166(2007) [PubMed: 17525332] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-236, MASS SPECTROMETRY. |
| [26] | Colinge J., Superti-Furga G., Bennett K.L. Submitted (OCT-2008) to UniProtKB Cited for: IDENTIFICATION [LARGE SCALE ANALYSIS], MASS SPECTROMETRY. |
| [27] | "Structural basis for recognition of acidic-cluster dileucine sequence by GGA1." Shiba T., Takatsu H., Nogi T., Matsugaki N., Kawasaki M., Igarashi N., Suzuki M., Kato R., Earnest T., Nakayama K., Wakatsuki S. Nature 415:937-941(2002) [PubMed: 11859376] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.1 ANGSTROMS) OF 1-147. |
| [28] | "Molecular mechanism of membrane recruitment of GGA by ARF in lysosomal protein transport." Shiba T., Kawasaki M., Takatsu H., Nogi T., Matsugaki N., Igarashi N., Suzuki M., Kato R., Nakayama K., Wakatsuki S. Nat. Struct. Biol. 10:386-393(2003) [PubMed: 12679809] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.6 ANGSTROMS) OF 168-208 IN COMPLEX WITH MOUSE ARF1. |
| [29] | "Structural basis for binding of accessory proteins by the appendage domain of GGAs." Collins B.M., Praefcke G.J., Robinson M.S., Owen D.J. Nat. Struct. Biol. 10:607-613(2003) [PubMed: 12858163] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.5 ANGSTROMS) OF 2-16 IN COMPLEX WITH CCDC91. |
| [30] | "The consensus coding sequences of human breast and colorectal cancers." Sjoeblom T., Jones S., Wood L.D., Parsons D.W., Lin J., Barber T.D., Mandelker D., Leary R.J., Ptak J., Silliman N., Szabo S., Buckhaults P., Farrell C., Meeh P., Markowitz S.D., Willis J., Dawson D., Willson J.K.V. Velculescu V.E.Science 314:268-274(2006) [PubMed: 16959974] [Abstract] Cited for: VARIANTS [LARGE SCALE ANALYSIS] SER-239 AND ALA-484. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AF190862 mRNA. Translation: AAF05707.1. AF218584 mRNA. Translation: AAF42847.1. AF233521 mRNA. Translation: AAF35393.1. AK075256 mRNA. Translation: BAC11501.1. AL035496, Z83844 Genomic DNA. Translation: CAI20951.1. Z83844, AL035496 Genomic DNA. Translation: CAI20369.1. AL110219 mRNA. Translation: CAB53679.1. BC000538 mRNA. Translation: AAH00538.2. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00216337. IPI00744361. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | T14759. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001001560.1. NP_001001561.1. NP_037497.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.499158 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DisProt | DP00314. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q9UJY5. 6 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q9UJY5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q9UJY5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000100083. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 26088. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:26088. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC22P036329. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0016447. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:17842. GGA1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 606004. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA28657. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | Q9UJY5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q9UJY5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q9UJY5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_GGA1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000100083. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR008152. Clathrin_a/b/g-adaptin_app_Ig. IPR008153. Clathrin_g-adaptin_app. IPR008942. ENTH_VHS. IPR004152. GAT. IPR002014. VHS. IPR018205. VHS_subgroup. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:2.60.40.1230. Clathrin_g-adaptin_app. 1 hit. G3DSA:1.25.40.90. ENTH_VHS. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF02883. Alpha_adaptinC2. 1 hit. PF03127. GAT. 1 hit. PF00790. VHS. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProDom | PD021457. Gamma_adaptin_C. 1 hit. PD003686. VHS. 1 hit. [Graphical view] [Entries sharing at least one domain] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00809. Alpha_adaptinC2. 1 hit. SM00288. VHS. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50180. GAE. 1 hit. PS50909. GAT. 1 hit. PS50179. VHS. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 48013. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | GGA1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q9UJY5 Secondary accession number(s): Q5TG07 Q9UGW1 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 22 Human chromosome 22: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


