Q9PM74 (HIS4_CAMJE) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 84.
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| Protein names | Recommended name: 1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5-phosphoribosylamino)methylideneamino] imidazole-4-carboxamide isomerase EC=5.3.1.16 Alternative name(s): Phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribotide isomerase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Campylobacter jejuni subsp. jejuni serotype O:2 (strain NCTC 11168) [Reference proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 192222 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Epsilonproteobacteria › Campylobacterales › Campylobacteraceae › Campylobacter › ![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 243 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | 1-(5-phosphoribosyl)-5-((5-phosphoribosylamino)methylideneamino)imidazole-4-carboxamide = 5-((5-phospho-1-deoxyribulos-1-ylamino)methylideneamino)-1-(5-phosphoribosyl)imidazole-4-carboxamide. HAMAP-Rule MF_01014 |
| Pathway | Amino-acid biosynthesis; L-histidine biosynthesis; L-histidine from 5-phospho-alpha-D-ribose 1-diphosphate: step 4/9. HAMAP-Rule MF_01014 |
| Subcellular location | Cytoplasm By similarity. |
| Sequence similarities | Belongs to the HisA/HisF family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Amino-acid biosynthesis Histidine biosynthesis |
| Cellular component | Cytoplasm |
| Molecular function | Isomerase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | histidine biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: HAMAP |
| Cellular_component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular_function | 1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5-phosphoribosylamino)methylideneamino]imidazole-4-carboxamide isomerase activity Inferred from electronic annotation. Source: HAMAP |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 243 | 243 | 1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5-phosphoribosylamino)methylideneamino] imidazole-4-carboxamide isomerase HAMAP-Rule MF_01014 | PRO_0000141993 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 9 | 1 | Proton acceptor By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 131 | 1 | Proton donor By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 3 – 11 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 14 – 19 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 21 – 23 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 25 – 28 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 33 – 43 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 47 – 52 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 53 – 57 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 59 – 61 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 64 – 73 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 76 – 83 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 87 – 95 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 99 – 103 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 105 – 109 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 111 – 121 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 123 – 125 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 126 – 140 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 153 – 161 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 162 – 164 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 167 – 172 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 184 – 193 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 197 – 203 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 208 – 213 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 214 – 217 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 219 – 223 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 225 – 228 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 234 – 241 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "The genome sequence of the food-borne pathogen Campylobacter jejuni reveals hypervariable sequences." Parkhill J., Wren B.W., Mungall K.L., Ketley J.M., Churcher C.M., Basham D., Chillingworth T., Davies R.M., Feltwell T., Holroyd S., Jagels K., Karlyshev A.V., Moule S., Pallen M.J., Penn C.W., Quail M.A., Rajandream M.A., Rutherford K.M. Barrell B.G.Nature 403:665-668(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: NCTC 11168. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AL111168 Genomic DNA. Translation: CAL35698.1. | ||||||||||||
| PIR | G81255. | ||||||||||||
| RefSeq | YP_002344970.1. NC_002163.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q9PM74. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| STRING | 192222.Cj1601. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| EnsemblBacteria | CAL35698; CAL35698; Cj1601. | ||||||||||||
| GeneID | 904505. | ||||||||||||
| KEGG | cje:Cj1601. | ||||||||||||
| PATRIC | 20060162. VBICamJej33762_1577. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | COG0106. | ||||||||||||
| HOGENOM | HOG000224614. | ||||||||||||
| KO | K01814. | ||||||||||||
| OMA | DGHCVRL. | ||||||||||||
| ProtClustDB | PRK00748. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | CJEJ192222:GJTS-1560-MONOMER. | ||||||||||||
| UniPathway | UPA00031; UER00009. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| Gene3D | 3.20.20.70. 1 hit. | ||||||||||||
| HAMAP | MF_01014. HisA. | ||||||||||||
| InterPro | IPR013785. Aldolase_TIM. IPR006062. His_biosynth. IPR006063. HisA. IPR023016. Isoase_HisA. IPR011060. RibuloseP-bd_barrel. [Graphical view] | ||||||||||||
| Pfam | PF00977. His_biosynth. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| SUPFAM | SSF51366. RibP_bind_barrel. 1 hit. | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00007. TIGR00007. 1 hit. | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | HIS4_CAMJE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q9PM74 Secondary accession number(s): Q0P827 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
