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UniProtKB/Swiss-Prot Q9PM41 (AROC_CAMJE)
Last modified
June 16, 2009.
Version 56.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (3) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Chorismate synthase EC=4.2.3.5 Alternative name(s): 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate phospholyase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Campylobacter jejuni [Complete proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 197 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Epsilonproteobacteria › Campylobacterales › Campylobacteraceae › Campylobacter |
Protein attributes
| Sequence length | 362 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | 5-O-(1-carboxyvinyl)-3-phosphoshikimate = chorismate + phosphate. HAMAP MF_00300 |
| Cofactor | Reduced flavin By similarity. |
| Pathway | Metabolic intermediate biosynthesis; chorismate biosynthesis; chorismate from D-erythrose 4-phosphate and PEP: step 7/7. HAMAP MF_00300 |
| Subunit structure | Homotetramer By similarity. |
| Sequence similarities | Belongs to the chorismate synthase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Amino-acid biosynthesis Aromatic amino acid biosynthesis |
| Molecular function | Lyase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | aromatic amino acid family biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: HAMAP |
| Molecular function | chorismate synthase activity Inferred from electronic annotation. Source: HAMAP protein bindingInferred from physical interaction. Source: IntAct |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| flgE2 | Q0P7Q2 | 1 | EBI-1329003,EBI-1193196 | |
| flgK | Q0P8E9 | 1 | EBI-1329003,EBI-1191246 | |
| flhA | Q0PA15 | 1 | EBI-1329003,EBI-1193184 | |
| fliE | Q9PHY8 | 1 | EBI-1329003,EBI-1191580 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 362 | 362 | Chorismate synthase HAMAP MF_00300 | PRO_0000140568 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 6 – 13 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 16 – 18 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 21 – 26 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 36 – 45 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 62 – 64 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 66 – 69 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 78 – 82 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 128 – 143 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 144 – 146 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 148 – 156 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 165 – 167 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 170 – 175 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 183 – 185 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 186 – 198 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 205 – 213 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 221 – 223 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 226 – 235 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 240 – 245 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 248 – 253 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 256 – 259 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 264 – 267 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 275 – 277 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 280 – 284 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 286 – 292 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 325 – 346 | 22 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 348 – 350 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 352 – 358 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "The genome sequence of the food-borne pathogen Campylobacter jejuni reveals hypervariable sequences." Parkhill J., Wren B.W., Mungall K.L., Ketley J.M., Churcher C.M., Basham D., Chillingworth T., Davies R.M., Feltwell T., Holroyd S., Jagels K., Karlyshev A.V., Moule S., Pallen M.J., Penn C.W., Quail M.A., Rajandream M.A., Rutherford K.M. Barrell B.G.Nature 403:665-668(2000) [PubMed: 10688204] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: NCTC 11168 / Serotype O:2. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AL111168 Genomic DNA. Translation: CAL35731.1. | |||||||||||||
| PIR | H81259. | ||||||||||||
| RefSeq | YP_002345003.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| |||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| IntAct | Q9PM41. 94 interactions. | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| GeneID | 905907. | ||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus Cj1634c in contig AL111168_GR. | ||||||||||||
| KEGG | cje:Cj1634c. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CMR | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| OMA | Q9PM41. SRFTTQR. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | CJEJ192222:CJ1634C-MON. | ||||||||||||
| BRENDA | 4.2.3.5. 255835. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| HAMAP | MF_00300. [Tree] | ||||||||||||
| InterPro | IPR000453. Chorismate_synth. [Graphical view] | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR21085. Chorismate_synth. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF01264. Chorismate_synt. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PIRSF | PIRSF001456. Chorismate_synth. 1 hit. | ||||||||||||
| ProDom | PD002941. Chorismate_synth. 1 hit. [Graphical view] [Entries sharing at least one domain] | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00033. aroC. 1 hit. | ||||||||||||
| PROSITE | PS00787. CHORISMATE_SYNTHASE_1. 1 hit. PS00788. CHORISMATE_SYNTHASE_2. 1 hit. PS00789. CHORISMATE_SYNTHASE_3. False negative. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | AROC_CAMJE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q9PM41 Secondary accession number(s): Q0P7Z4 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HAMAP (High-quality Automated and Manual Annotation of microbial Proteomes) | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


