Q9PIH3 (SERC_CAMJE) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
January 25, 2012.
Version 68.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Phosphoserine aminotransferase EC=2.6.1.52 Alternative name(s): Phosphohydroxythreonine aminotransferase Short name=PSAT | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Campylobacter jejuni | ||||
| Taxonomic identifier | 197 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Epsilonproteobacteria › Campylobacterales › Campylobacteraceae › Campylobacter |
Protein attributes
| Sequence length | 358 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes the reversible conversion of 3-phosphohydroxypyruvate to phosphoserine and of 3-hydroxy-2-oxo-4-phosphonooxybutanoate to phosphohydroxythreonine By similarity. HAMAP MF_00160 |
| Catalytic activity | O-phospho-L-serine + 2-oxoglutarate = 3-phosphonooxypyruvate + L-glutamate. HAMAP MF_00160 4-phosphonooxy-L-threonine + 2-oxoglutarate = (3R)-3-hydroxy-2-oxo-4-phosphonooxybutanoate + L-glutamate. HAMAP MF_00160 |
| Cofactor | Binds 1 pyridoxal phosphate per subunit By similarity. HAMAP MF_00160 |
| Pathway | Amino-acid biosynthesis; L-serine biosynthesis; L-serine from 3-phospho-D-glycerate: step 2/3. HAMAP MF_00160 Cofactor biosynthesis; pyridoxine 5'-phosphate biosynthesis; pyridoxine 5'-phosphate from D-erythrose 4-phosphate: step 3/5. HAMAP MF_00160 |
| Subunit structure | Homodimer By similarity. HAMAP MF_00160 |
| Subcellular location | Cytoplasm By similarity HAMAP MF_00160. |
| Sequence similarities | Belongs to the class-V pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase family. SerC subfamily. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Amino-acid biosynthesis Pyridoxine biosynthesis Serine biosynthesis |
| Cellular component | Cytoplasm |
| Ligand | Pyridoxal phosphate |
| Molecular function | Aminotransferase Transferase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | L-serine biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW pyridoxine biosynthetic processInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Cellular component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | O-phospho-L-serine:2-oxoglutarate aminotransferase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC pyridoxal phosphate bindingInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 358 | 358 | Phosphoserine aminotransferase HAMAP MF_00160 | PRO_0000150161 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 75 – 76 | 2 | Pyridoxal phosphate binding By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 233 – 234 | 2 | Pyridoxal phosphate binding By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 41 | 1 | L-glutamate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 100 | 1 | Pyridoxal phosphate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 148 | 1 | Pyridoxal phosphate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 167 | 1 | Pyridoxal phosphate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 190 | 1 | Pyridoxal phosphate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 191 | 1 | N6-(pyridoxal phosphate)lysine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 15 – 23 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 25 – 27 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 35 – 37 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 40 – 42 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 43 – 49 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 53 – 60 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 66 – 71 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 76 – 86 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 92 – 96 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 100 – 110 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 115 – 120 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 122 – 125 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 138 – 146 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 164 – 167 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 169 – 171 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 182 – 186 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 190 – 192 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 199 – 204 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 205 – 212 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 218 – 220 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 222 – 227 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 228 – 230 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 237 – 251 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 257 – 275 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 287 – 289 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 292 – 301 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 305 – 315 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 331 – 333 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 340 – 353 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "The genome sequence of the food-borne pathogen Campylobacter jejuni reveals hypervariable sequences." Parkhill J., Wren B.W., Mungall K.L., Ketley J.M., Churcher C.M., Basham D., Chillingworth T., Davies R.M., Feltwell T., Holroyd S., Jagels K., Karlyshev A.V., Moule S., Pallen M.J., Penn C.W., Quail M.A., Rajandream M.A., Rutherford K.M. Barrell B.G.Nature 403:665-668(2000) [PubMed: 10688204] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: NCTC 11168 / Serotype O:2. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AL111168 Genomic DNA. Translation: CAL34477.1. | ||||||||||||
| PIR | B81452. | ||||||||||||
| RefSeq | YP_002343764.1. NC_002163.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q9PIH3. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| IntAct | Q9PIH3. 19 interactions. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| GeneID | 904650. | ||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus Cj0326 in contig AL111168_GR. | ||||||||||||
| KEGG | cje:Cj0326. | ||||||||||||
| PATRIC | 20057569. VBICamJej33762_0318. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| HOGENOM | HBG289982. | ||||||||||||
| OMA | YEVLFLQ. | ||||||||||||
| ProtClustDB | PRK05355. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | CJEJ192222:CJ0326-MONOMER. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| HAMAP | MF_00160. SerC_aminotrans_5. [Tree] | ||||||||||||
| InterPro | IPR000192. Aminotrans_V/Cys_dSase. IPR022278. Pser_aminoTfrase. IPR003248. Pser_aminoTfrase_subgr. IPR015424. PyrdxlP-dep_Trfase_major_dom. IPR015421. PyrdxlP-dep_Trfase_major_sub1. IPR015422. PyrdxlP-dep_Trfase_major_sub2. [Graphical view] | ||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.40.640.10. PyrdxlP-dep_Trfase_major_sub1. 1 hit. G3DSA:3.90.1150.10. PyrdxlP-dep_Trfase_major_sub2. 1 hit. | ||||||||||||
| KO | K00831. | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR21152:SF1. PTHR21152:SF1. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF00266. Aminotran_5. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PIRSF | PIRSF000525. SerC. 1 hit. | ||||||||||||
| SUPFAM | SSF53383. PyrdxlP-dep_Trfase_major. 1 hit. | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01364. SerC_1. 1 hit. | ||||||||||||
| PROSITE | PS00595. AA_TRANSFER_CLASS_5. False negative. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | SERC_CAMJE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q9PIH3 Secondary accession number(s): Q0PBI3 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with