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UniProtKB/Swiss-Prot Q9P0U3 (SENP1_HUMAN)
Last modified
June 16, 2009.
Version 65.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (6) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Sentrin-specific protease 1 EC=3.4.22.- Alternative name(s): Sentrin/SUMO-specific protease SENP1 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 644 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Protease that catalyzes two essential functions in the SUMO pathway: processing of full-length SUMO1, SUMO2 and SUMO3 to their mature forms and deconjugation of SUMO1, SUMO2 and SUMO3 from targeted proteins. Deconjugates SUMO1 from HIPK2. Deconjugates SUMO1 from HDAC1, which decreases its transcriptional repression activity. Ref.1 Ref.6 Ref.8 Ref.10 |
| Subcellular location | Nucleus. Cytoplasm. Note: Shuttles between cytoplasm and nucleus. Ref.1 Ref.8 Ref.5 |
| Tissue specificity | Highly expressed in testis. Expressed at lower levels in thymus, pancreas, spleen, liver, ovary and small intestine. Ref.7 |
| Sequence similarities | Belongs to the peptidase C48 family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Ubl conjugation pathway |
| Cellular component | Cytoplasm Nucleus |
| Coding sequence diversity | Alternative splicing Polymorphism |
| Molecular function | Hydrolase Protease Thiol protease |
| PTM | Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | modification-dependent protein catabolic process Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Cellular component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell nucleus Ref.1Traceable author statement. Source: ProtInc |
| Molecular function | cysteine-type peptidase activity Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW endopeptidase activity Ref.1Traceable author statement. Source: ProtInc |
| Complete GO annotation... | |
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: Q9P0U3-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: Q9P0U3-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 593-593: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 644 | 644 | Sentrin-specific protease 1 | PRO_0000101716 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 450 – 613 | 164 | Protease | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 171 – 177 | 7 | Nuclear localization signal Probable | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 574 – 577 | 4 | Nuclear localization signal Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 628 – 634 | 7 | Nuclear localization signal Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motif | 635 – 644 | 10 | Nuclear export signal Probable | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 45 – 170 | 126 | Ser-rich | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 290 – 300 | 11 | His-rich | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 533 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 550 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 603 | 1 | Nucleophile | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 157 | 1 | Phosphoserine Ref.9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 593 | 1 | Missing in isoform 2. | VSP_035777 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 193 | 1 | I → V: dbSNP rs17854369. Ref.4 | VAR_029648 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 280 | 1 | A → T: dbSNP rs35130318. | VAR_047547 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 350 | 1 | D → G: dbSNP rs17854368. Ref.4 | VAR_029649 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 441 | 1 | D → A: No effect on SUMO2 processing and SUMO2 deconjugating activities. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 465 | 1 | W → A: Impairs SUMO2 processing and SUMO2 deconjugating activities. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 468 | 1 | D → A: Slightly impairs SUMO2 processing activity. No effect on SUMO2 deconjugating activity. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 496 | 1 | F → A: Impairs SUMO2 processing activity. No effect on SUMO2 deconjugating activity. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 511 | 1 | R → A: Impairs SUMO2 processing activity. No effect on SUMO2 deconjugating activity. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 512 | 1 | W → A: Impairs SUMO2 processing and SUMO2 deconjugating activities. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 529 | 1 | H → A: Impairs SUMO2 processing activity. No effect on SUMO2 deconjugating activity. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 532 | 1 | V → A: No effect on SUMO2 processing and SUMO2 deconjugating activities. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 533 | 1 | H → A: Abolishes SUMO2 processing and SUMO2 deconjugating activities. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 534 | 1 | W → A: Abolishes SUMO2 processing and SUMO2 deconjugating activities. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 550 | 1 | D → A: Abolishes SUMO2 processing and SUMO2 deconjugating activities. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 597 | 1 | Q → A: Abolishes SUMO2 processing and SUMO2 deconjugating activities. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 603 | 1 | C → A or S: Abolishes SUMO2 processing and SUMO2 deconjugating activities. Ref.10 Ref.5 Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 603 | 1 | C → S: Exclusively nuclear. Ref.10 Ref.5 Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 427 – 435 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 436 – 438 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 443 – 447 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 450 – 453 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 454 – 457 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 458 – 460 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 468 – 481 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 490 – 492 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 496 – 504 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 506 – 509 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 510 – 513 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 518 – 520 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 521 – 530 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 533 – 540 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 541 – 544 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 545 – 549 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 557 – 575 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 585 – 588 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 591 – 593 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 599 – 601 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 602 – 614 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 623 – 625 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 626 – 639 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AF149770 mRNA. Translation: AAF31171.1. AK292060 mRNA. Translation: BAF84749.1. AC074029 Genomic DNA. No translation available. BC045639 mRNA. Translation: AAH45639.2. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00005101. IPI00914975. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_055369.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.371957 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MEROPS | C48.002. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q9P0U3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q9P0U3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000079387. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 29843. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:29843. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC12M046722. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0026344. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:17927. SENP1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | HPA011765. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA134947038. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | Q9P0U3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | Q9P0U3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | ar_tf_pathway. Regulation of Androgen receptor activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q9P0U3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q9P0U3. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_SENP1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000079387. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50600. ULP_PROTEASE. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 52379. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | SENP1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q9P0U3 Secondary accession number(s): A8K7P5, Q86XC8 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 12 Human chromosome 12: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
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