Q9K8V3 (ARGJ_BACHD) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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January 25, 2012.
Version 73.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Arginine biosynthesis bifunctional protein ArgJ Cleaved into the following 2 chains: | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Bacillus halodurans (strain ATCC BAA-125 / DSM 18197 / FERM 7344 / JCM 9153 / C-125) [Complete proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 272558 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Firmicutes › Bacillales › Bacillaceae › Bacillus |
Protein attributes
| Sequence length | 411 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes two activities which are involved in the cyclic version of arginine biosynthesis: the synthesis of acetylglutamate from glutamate and acetyl-CoA, and of ornithine by transacetylation between acetylornithine and glutamate By similarity. HAMAP MF_01106 |
| Catalytic activity | N(2)-acetyl-L-ornithine + L-glutamate = L-ornithine + N-acetyl-L-glutamate. HAMAP MF_01106 Acetyl-CoA + L-glutamate = CoA + N-acetyl-L-glutamate. HAMAP MF_01106 |
| Enzyme regulation | Feedback inhibition by L-arginine By similarity. HAMAP MF_01106 |
| Pathway | Amino-acid biosynthesis; L-arginine biosynthesis; L-ornithine and N-acetyl-L-glutamate from L-glutamate and N(2)-acetyl-L-ornithine (cyclic): step 1/1. HAMAP MF_01106 Amino-acid biosynthesis; L-arginine biosynthesis; N(2)-acetyl-L-ornithine from L-glutamate: step 1/4. HAMAP MF_01106 |
| Subunit structure | Heterotetramer of two alpha and two beta chains By similarity. |
| Subcellular location | Cytoplasm Probable HAMAP MF_01106. |
| Miscellaneous | Some bacteria possess a monofunctional ArgJ, i.e., capable of catalyzing only the fifth step of the arginine biosynthetic pathway. HAMAP MF_01106 |
| Sequence similarities | Belongs to the ArgJ family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Amino-acid biosynthesis Arginine biosynthesis |
| Cellular component | Cytoplasm |
| Molecular function | Acyltransferase Transferase |
| PTM | Autocatalytic cleavage |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Multifunctional enzyme |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | arginine biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Cellular component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | acetyl-CoA:L-glutamate N-acetyltransferase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC glutamate N-acetyltransferase activityInferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 196 | 196 | Arginine biosynthesis bifunctional protein ArgJ alpha chain By similarity | PRO_0000002113 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 197 – 411 | 215 | Arginine biosynthesis bifunctional protein ArgJ beta chain By similarity | PRO_0000002114 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 196 – 197 | 2 | Cleavage; by autolysis By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 18 – 20 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 24 – 29 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 32 – 37 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 40 – 56 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 63 – 75 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 76 – 87 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 93 – 111 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 115 – 117 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 118 – 127 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 132 – 141 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 145 – 147 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 148 – 158 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 167 – 174 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 177 – 186 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 188 – 190 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 199 – 204 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 210 – 223 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 225 – 227 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 230 – 232 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 239 – 244 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 260 – 280 | 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 288 – 298 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 299 – 310 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 313 – 320 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 326 – 335 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 336 – 338 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 346 – 349 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 352 – 356 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 365 – 374 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 376 – 383 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 386 – 396 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 400 – 406 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
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References
| [1] | "Complete genome sequence of the alkaliphilic bacterium Bacillus halodurans and genomic sequence comparison with Bacillus subtilis." Takami H., Nakasone K., Takaki Y., Maeno G., Sasaki R., Masui N., Fuji F., Hirama C., Nakamura Y., Ogasawara N., Kuhara S., Horikoshi K. Nucleic Acids Res. 28:4317-4331(2000) [PubMed: 11058132] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC BAA-125 / DSM 18197 / FERM 7344 / JCM 9153 / C-125. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | BA000004 Genomic DNA. Translation: BAB06618.1. | ||||||||||||||||||
| PIR | C84012. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_243765.1. NC_002570.2. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
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| ProteinModelPortal | Q9K8V3. | ||||||||||||||||||
| SMR | Q9K8V3. Positions 6-409. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||
| MEROPS | T05.001. | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| EnsemblBacteria | EBBACT00000053002; EBBACP00000051641; EBBACG00000052993. | ||||||||||||||||||
| GeneID | 893093. | ||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus BH2899 in contig BA000004_GR. | ||||||||||||||||||
| KEGG | bha:BH2899. | ||||||||||||||||||
| NMPDR | fig|272558.1.peg.2899. | ||||||||||||||||||
| PATRIC | 18943030. VBIBacHal18977_3016. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CMR | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| GeneTree | EBGT00050000002382. | ||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG284202. | ||||||||||||||||||
| OMA | GRDPNWG. | ||||||||||||||||||
| PhylomeDB | Q9K8V3. | ||||||||||||||||||
| ProtClustDB | PRK05388. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| BioCyc | BHAL272558:BH2899-MONOMER. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| HAMAP | MF_01106. ArgJ. [Tree] | ||||||||||||||||||
| InterPro | IPR002813. Arg_biosynth_ArgJ. IPR016117. Pept_S58_DmpA/Arg_biosyn_ArgJ. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| KO | K00620. | ||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR23100. ArgJ. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF01960. ArgJ. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProDom | PD004193. Arg_biosynth_ArgJ. 1 hit. [Graphical view] [Entries sharing at least one domain] | ||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF56266. Pept_S58_DmpA/Arg_biosyn_ArgJ. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00120. ArgJ. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | ARGJ_BACHD | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q9K8V3 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with