Q9I6Y4 (ADE_PSEAE) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 70.
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| Protein names | Recommended name: Adenine deaminase Short name=ADE EC=3.5.4.2 Alternative name(s): Adenine aminohydrolase Short name=AAH | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / PAO1 / 1C / PRS 101 / LMG 12228) [Reference proteome] [HAMAP] | ||
| Taxonomic identifier | 208964 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Gammaproteobacteria › Pseudomonadales › Pseudomonadaceae › Pseudomonas › ![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 316 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes the hydrolytic deamination of adenine to hypoxanthine. Plays an important role in the purine salvage pathway and in nitrogen catabolism By similarity. HAMAP-Rule MF_01962 |
| Catalytic activity | Adenine + H2O = hypoxanthine + NH3. HAMAP-Rule MF_01962 |
| Cofactor | Binds 1 zinc ion per subunit By similarity. |
| Sequence similarities | Belongs to the adenosine and AMP deaminases family. Adenine deaminase type 2 subfamily. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Nucleotide metabolism |
| Ligand | Metal-binding Zinc |
| Molecular function | Hydrolase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | adenine catabolic process Inferred from electronic annotation. Source: HAMAP hypoxanthine salvageInferred from electronic annotation. Source: HAMAP nucleotide metabolic processInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW purine ribonucleoside monophosphate biosynthetic processInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Molecular_function | adenine deaminase activity Inferred from electronic annotation. Source: HAMAP zinc ion bindingInferred from electronic annotation. Source: HAMAP |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 316 | 316 | Adenine deaminase HAMAP-Rule MF_01962 | PRO_0000194377 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 197 | 1 | Proton donor | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 14 | 1 | Zinc; catalytic | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 16 | 1 | Zinc; catalytic | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 194 | 1 | Zinc; catalytic | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 275 | 1 | Zinc; catalytic | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 276 | 1 | Substrate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Site | 218 | 1 | Important for catalytic activity By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 3 – 7 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 10 – 12 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 14 – 16 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 17 – 20 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 23 – 32 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 38 – 41 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 42 – 47 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 54 – 64 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 65 – 67 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 71 – 87 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 90 – 93 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 99 – 103 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 104 – 106 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 109 – 127 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 134 – 138 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 143 – 153 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 154 – 159 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 161 – 167 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 174 – 177 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 178 – 186 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 193 – 199 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 201 – 209 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 214 – 218 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 220 – 224 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 226 – 235 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 239 – 241 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 243 – 248 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 251 – 254 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 255 – 257 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 260 – 266 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 270 – 272 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 277 – 280 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 284 – 295 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 299 – 311 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| [1] | "Complete genome sequence of Pseudomonas aeruginosa PAO1, an opportunistic pathogen." Stover C.K., Pham X.-Q.T., Erwin A.L., Mizoguchi S.D., Warrener P., Hickey M.J., Brinkman F.S.L., Hufnagle W.O., Kowalik D.J., Lagrou M., Garber R.L., Goltry L., Tolentino E., Westbrock-Wadman S., Yuan Y., Brody L.L., Coulter S.N., Folger K.R. Olson M.V.Nature 406:959-964(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 15692 / PAO1 / 1C / PRS 101 / LMG 12228. |
| [2] | "The crystal structure of adenosine deaminase in complex with adenine, chloropurine and hypoxanthine from pseudomonas aeruginosa." New York structural genomix research consortium (NYSGXRC) Submitted (DEC-2010) to the PDB data bank Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.49 ANGSTROMS) OF 2-316 IN COMPLEX WITH ADENINE; CHLOROPURINE AND HYPOXANTHINE. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AE004091 Genomic DNA. Translation: AAG03538.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | H83625. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_248838.1. NC_002516.2. | ||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q9I6Y4. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | Q9I6Y4. Positions 2-315. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | 208964.PA0148. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| DNASU | 879249. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 879249. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | pae:PA0148. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PATRIC | 19834504. VBIPseAer58763_0154. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PseudoCAP | PA0148. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG1816. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000218813. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K01488. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | FTNLQSF. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtClustDB | PRK09358. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| HAMAP | MF_01962. Adenine_deaminase. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR001365. A/AMP_deaminase_dom. IPR006330. Ado/ade_deaminase. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00962. A_deaminase. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01430. aden_deam. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q9I6Y4. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | ADE_PSEAE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q9I6Y4 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
