Q9HW26 (PNCB2_PSEAE) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 29, 2013.
Version 88.
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| Protein names | Recommended name: Nicotinate phosphoribosyltransferase 2 Short name=NAPRTase 2 EC=2.4.2.11 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / PAO1 / 1C / PRS 101 / LMG 12228) [Reference proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 208964 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Gammaproteobacteria › Pseudomonadales › Pseudomonadaceae › Pseudomonas › ![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 398 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | Beta-nicotinate D-ribonucleotide + diphosphate = nicotinate + 5-phospho-alpha-D-ribose 1-diphosphate. HAMAP-Rule MF_00570 |
| Pathway | Cofactor biosynthesis; NAD(+) biosynthesis; nicotinate D-ribonucleotide from nicotinate: step 1/1. HAMAP-Rule MF_00570 |
| Subcellular location | Cytoplasm By similarity HAMAP-Rule MF_00570. |
| Sequence similarities | Belongs to the NAPRTase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Pyridine nucleotide biosynthesis |
| Cellular component | Cytoplasm |
| Molecular function | Glycosyltransferase Transferase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | NAD biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-UniPathway nicotinate nucleotide biosynthetic processInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Cellular_component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular_function | nicotinate phosphoribosyltransferase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating) activityInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 398 | 398 | Nicotinate phosphoribosyltransferase 2 HAMAP-Rule MF_00570 | PRO_0000205838 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 16 – 18 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 19 – 31 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 36 – 43 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 50 – 52 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 53 – 65 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 70 – 77 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 84 – 92 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 97 – 99 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 100 – 105 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 108 – 116 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 117 – 120 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 121 – 123 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 124 – 139 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 145 – 160 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 165 – 168 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 172 – 175 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 184 – 197 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 199 – 207 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 208 – 213 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 224 – 233 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 237 – 239 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 240 – 252 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 258 – 261 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 266 – 272 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 275 – 280 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 283 – 286 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 291 – 305 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 309 – 311 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 312 – 316 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 322 – 332 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 333 – 335 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 336 – 342 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 344 – 347 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 358 – 365 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 386 – 395 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Complete genome sequence of Pseudomonas aeruginosa PAO1, an opportunistic pathogen." Stover C.K., Pham X.-Q.T., Erwin A.L., Mizoguchi S.D., Warrener P., Hickey M.J., Brinkman F.S.L., Hufnagle W.O., Kowalik D.J., Lagrou M., Garber R.L., Goltry L., Tolentino E., Westbrock-Wadman S., Yuan Y., Brody L.L., Coulter S.N., Folger K.R. Olson M.V.Nature 406:959-964(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 15692 / PAO1 / 1C / PRS 101 / LMG 12228. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AE004091 Genomic DNA. Translation: AAG07764.1. | ||||||||||||
| PIR | F83099. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_253066.1. NC_002516.2. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q9HW26. | ||||||||||||
| SMR | Q9HW26. Positions 1-397. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| STRING | 208964.PA4376. | ||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||
| PRIDE | Q9HW26. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| DNASU | 881378. | ||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| GeneID | 881378. | ||||||||||||
| KEGG | pae:PA4376. | ||||||||||||
| PATRIC | 19843473. VBIPseAer58763_4583. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| PseudoCAP | PA4376. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | COG1488. | ||||||||||||
| HOGENOM | HOG000284928. | ||||||||||||
| KO | K00763. | ||||||||||||
| OMA | PERCISI. | ||||||||||||
| ProtClustDB | PRK05321. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| UniPathway | UPA00253; UER00457. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| HAMAP | MF_00570. NAPRTase. | ||||||||||||
| InterPro | IPR006406. Nic_PRibTrfase. IPR015977. Nic_PRibTrfase-like. IPR007229. Nic_PRibTrfase-rel. IPR002638. Quinolinate_PRibosylTrfase_C. [Graphical view] | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR11098:SF1. PTHR11098:SF1. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF04095. NAPRTase. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PIRSF | PIRSF000484. NAPRT. 1 hit. | ||||||||||||
| SUPFAM | SSF51690. Q_phspho_trans. 1 hit. | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01514. NAPRTase. 1 hit. | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other | |||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q9HW26. | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | PNCB2_PSEAE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q9HW26 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
