Q9HU22 (Q9HU22_PSEAE) Unreviewed, UniProtKB/TrEMBL
Last modified
January 25, 2012.
Version 72.
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| Protein names | Submitted name: Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase EMBL AAG08548.1 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / PAO1 / 1C / PRS 101 / LMG 12228) | ||||
| Taxonomic identifier | 208964 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Gammaproteobacteria › Pseudomonadales › Pseudomonadaceae › Pseudomonas |
Protein attributes
| Sequence length | 293 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Molecular function | Transferase EMBL AAG08548.1 |
| Technical term | 3D-structure PDB 1G0R PDB 1G23 PDB 1FZW PDB 1G3L PDB 1G1L PDB 1G2V PDB 1FXO Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | extracellular polysaccharide biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Molecular function | glucose-1-phosphate thymidylyltransferase activity Inferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||
Regions | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Region | 161 – 162 | 2 | Glucose-1-phosphate binding PDB 1G0R PDB 1G23 | ||||||
Sites | |||||||||
| Binding site | 111 | 1 | Glucose-1-phosphate PDB 1G0R PDB 1G23 | ||||||
| Binding site | 146 | 1 | Glucose-1-phosphate; via amide nitrogen PDB 1G0R PDB 1G23 | ||||||
| Binding site | 172 | 1 | Glucose-1-phosphate; via carbonyl oxygen PDB 1G0R PDB 1G23 | ||||||
Sequences
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References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Complete genome sequence of Pseudomonas aeruginosa PAO1, an opportunistic pathogen." Stover C.K., Pham X.Q., Erwin A.L., Mizoguchi S.D., Warrener P., Hickey M.J., Brinkman F.S., Hufnagle W.O., Kowalik D.J., Lagrou M., Garber R.L., Goltry L., Tolentino E., Westbrock-Wadman S., Yuan Y., Brody L.L., Coulter S.N., Folger K.R. Olson M.V.Nature 406:959-964(2000) [PubMed: 10984043] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 15692 / PAO1 / 1C / PRS 101 / LMG 12228. |
| [2] | "The structural basis of the catalytic mechanism and regulation of glucose-1-phosphate thymidylyltransferase (RmlA)." Blankenfeldt W., Asuncion M., Lam J.S., Naismith J.H. EMBO J. 19:6652-6663(2000) [PubMed: 11118200] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.66 ANGSTROMS) IN COMPLEX WITH GLUCOSE-1-PHOSPHATE. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AE004091 Genomic DNA. Translation: AAG08548.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | D83000. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_253850.1. NC_002516.2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q9HU22. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | Q9HU22. Positions 1-293. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 879990. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus PA5163 in contig AE004091_GR. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | pae:PA5163. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NMPDR | fig|208964.1.peg.5160. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PATRIC | 19845169. VBIPseAer58763_5411. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PseudoCAP | PA5163. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG688195. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | EATIFAY. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtClustDB | CLSK2517300. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc | PAER208964:PA5163-MONOMER. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR005907. G1P_thy_trans_s. IPR005835. NTP_transferase. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K00973. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR22572:SF13. PTHR22572:SF13. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00483. NTP_transferase. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01207. RmlA. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | Q9HU22_PSEAE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q9HU22 Secondary accession number(s): Q7AYQ9 | ||||||||
| Entry history |
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| Entry status | Unreviewed (UniProtKB/TrEMBL) | ||||||||

Clusters with