Q9HLA5 (KAE1B_THEAC) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 29, 2013.
Version 85.
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| Protein names | Recommended name: Probable bifunctional tRNA threonylcarbamoyladenosine biosynthesis protein Including the following 2 domains:
| ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Thermoplasma acidophilum (strain ATCC 25905 / DSM 1728 / JCM 9062 / NBRC 15155 / AMRC-C165) [Reference proteome] [HAMAP] | ||
| Taxonomic identifier | 273075 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Archaea › Euryarchaeota › Thermoplasmata › Thermoplasmatales › Thermoplasmataceae › Thermoplasma › ![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 529 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Required for the formation of a threonylcarbamoyl group on adenosine at position 37 (t6A37) in tRNAs that read codons beginning with adenine By similarity. HAMAP-Rule MF_01447 |
| Catalytic activity | ATP + a protein = ADP + a phosphoprotein. HAMAP-Rule MF_01447 |
| Subcellular location | Cytoplasm Potential HAMAP-Rule MF_01447. |
| Sequence similarities | In the N-terminal section; belongs to the KAE1 / YgjD family. In the C-terminal section; belongs to the protein kinase superfamily. Tyr protein kinase family. BUD32 subfamily. Contains 1 protein kinase domain. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | tRNA processing |
| Cellular component | Cytoplasm |
| Ligand | ATP-binding Iron Metal-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Kinase Serine/threonine-protein kinase Transferase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | threonylcarbamoyladenosine biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: HAMAP |
| Cellular_component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular_function | ATP binding Inferred from electronic annotation. Source: HAMAP iron ion bindingInferred from electronic annotation. Source: HAMAP metalloendopeptidase activityInferred from electronic annotation. Source: InterPro protein serine/threonine kinase activityInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW protein serine/threonine/tyrosine kinase activityInferred from electronic annotation. Source: HAMAP zinc ion bindingInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 529 | 529 | Probable bifunctional tRNA threonylcarbamoyladenosine biosynthesis protein HAMAP-Rule MF_01447 | PRO_0000303661 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 329 – 529 | 201 | Protein kinase | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 335 – 342 | 8 | ATP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 1 – 324 | 324 | Kae1 HAMAP-Rule MF_01447 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 447 | 1 | Proton acceptor By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 107 | 1 | Iron By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 111 | 1 | Iron By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 128 | 1 | Iron By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 285 | 1 | Iron By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 355 | 1 | ATP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2 – 7 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 9 – 21 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 25 – 30 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 40 – 62 | 23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 66 – 68 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 71 – 75 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 77 – 79 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 81 – 98 | 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 103 – 105 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 107 – 119 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 125 – 132 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 134 – 139 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 141 – 152 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 155 – 163 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 164 – 167 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 172 – 177 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 178 – 182 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 201 – 212 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 217 – 243 | 27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 246 – 253 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 254 – 256 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 258 – 271 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 273 – 275 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 280 – 283 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 288 – 299 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 306 – 308 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 317 – 319 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
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References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "The genome sequence of the thermoacidophilic scavenger Thermoplasma acidophilum." Ruepp A., Graml W., Santos-Martinez M.-L., Koretke K.K., Volker C., Mewes H.-W., Frishman D., Stocker S., Lupas A.N., Baumeister W. Nature 407:508-513(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 25905 / DSM 1728 / JCM 9062 / NBRC 15155 / AMRC-C165. |
| [2] | "Atomic structure of the KEOPS complex: an ancient protein kinase-containing molecular machine." Mao D.Y., Neculai D., Downey M., Orlicky S., Haffani Y.Z., Ceccarelli D.F., Ho J.S., Szilard R.K., Zhang W., Ho C.S., Wan L., Fares C., Rumpel S., Kurinov I., Arrowsmith C.H., Durocher D., Sicheri F. Mol. Cell 32:259-275(2008) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (3.02 ANGSTROMS) OF 1-329. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AL445064 Genomic DNA. Translation: CAC11469.1. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_393804.1. NC_002578.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q9HLA5. | ||||||||||||
| SMR | Q9HLA5. Positions 1-325. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| STRING | 273075.Ta0324. | ||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||
| PRIDE | Q9HLA5. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| EnsemblBacteria | CAC11469; CAC11469; CAC11469. | ||||||||||||
| GeneID | 1455944. | ||||||||||||
| KEGG | tac:Ta0324. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | COG0533. | ||||||||||||
| HOGENOM | HOG000109569. | ||||||||||||
| KO | K15904. | ||||||||||||
| OMA | GNCLDQF. | ||||||||||||
| ProtClustDB | PRK09605. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| HAMAP | MF_01447. Kae1_Bud32_arch. | ||||||||||||
| InterPro | IPR000905. Gcp-like_dom. IPR022495. Kae1-assoc_kinase_Bud32. IPR017861. KAE1/YgjD. IPR022449. Kae1_arc. IPR011009. Kinase-like_dom. IPR018934. RIO-like_kinase. IPR009220. tRNA_threonyl_synthase/kinase. [Graphical view] | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR11735:SF6. PTHR11735:SF6. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF00814. Peptidase_M22. 1 hit. PF01163. RIO1. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PIRSF | PIRSF036401. Gcp_STYKS. 1 hit. | ||||||||||||
| PRINTS | PR00789. OSIALOPTASE. | ||||||||||||
| SUPFAM | SSF56112. Kinase_like. 1 hit. | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR03724. arch_bud32. 1 hit. TIGR03722. arch_KAE1. 1 hit. TIGR00329. gcp_kae1. 1 hit. | ||||||||||||
| PROSITE | PS01016. GLYCOPROTEASE. False negative. PS00107. PROTEIN_KINASE_ATP. False negative. PS50011. PROTEIN_KINASE_DOM. False negative. PS00109. PROTEIN_KINASE_TYR. False negative. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other | |||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q9HLA5. | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | KAE1B_THEAC | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q9HLA5 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
