Q9HCE7 (SMUF1_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 29, 2013.
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| Protein names | Recommended name: E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1 Short name=hSMURF1 EC=6.3.2.- Alternative name(s): SMAD ubiquitination regulatory factor 1 SMAD-specific E3 ubiquitin-protein ligase 1 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 757 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | E3 ubiquitin-protein ligase that acts as a negative regulator of BMP signaling pathway. Mediates ubiquitination and degradation of SMAD1 and SMAD5, 2 receptor-regulated SMADs specific for the BMP pathway. Promotes ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of TRAF family members and RHOA. Ref.7 Ref.9 Ref.11 |
| Pathway | |
| Subunit structure | Interacts with TRAF4. Interacts (via HECT domain) with FBXL15 (via LRR repeats). Interacts with SMAD7 and TGFBR1; SMAD7 recruits SMURF1 to TGFBR1 and regulates TGF-beta receptor degradation. Ref.8 Ref.9 Ref.10 Ref.11 |
| Subcellular location | Cytoplasm. Cell membrane; Peripheral membrane protein; Cytoplasmic side Ref.10. |
| Domain | The C2 domain mediates membrane localization and substrate selection. Ref.11 |
| Post-translational modification | Ubiquitinated by the SCF(FBXL15) complex at Lys-381 and Lys-383, leading to its degradation by the proteasome. Lys-383 is the primary ubiquitination site. Ref.10 |
| Sequence similarities | Contains 1 C2 domain. Contains 1 HECT (E6AP-type E3 ubiquitin-protein ligase) domain. Contains 2 WW domains. |
| Sequence caution | The sequence BAB13451.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. |
Ontologies
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform Long (identifier: Q9HCE7-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform Short (identifier: Q9HCE7-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 269-294: Missing. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 757 | 757 | E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1 | PRO_0000120326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 1 – 99 | 99 | C2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 234 – 267 | 34 | WW 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 306 – 339 | 34 | WW 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 420 – 757 | 338 | HECT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 725 | 1 | Glycyl thioester intermediate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 381 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 383 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 269 – 294 | 26 | Missing in isoform Short. | VSP_006812 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 466 | 1 | S → Y. Corresponds to variant rs13246077 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_052959 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 28 | 1 | K → A: Fails to ubiquitinate RHOA; when associated with A-85. Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 85 | 1 | K → A: Fails to ubiquitinate RHOA; when associated with A-28. Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 350 | 1 | K → R: Abolishes FBXL15-mediated ubiquitination and degradation; when associated with R-381 and R-381. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 381 | 1 | K → R: Abolishes FBXL15-mediated ubiquitination and degradation; when associated with R-350 and R-383. Abolishes FBXL15-mediated ubiquitination and degradation; when associated with R-383. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 383 | 1 | K → R: Abolishes FBXL15-mediated ubiquitination and degradation; when associated with R-350 and R-381. Abolishes FBXL15-mediated ubiquitination and degradation; when associated with R-381. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 725 | 1 | C → A: Loss of enzyme activity, without abolishing FBXL15-mediated ubiquitination. Ref.9 Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 447 | 1 | W → G in AAI44415. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 697 – 699 | 3 | Missing in AAI36805. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 697 – 699 | 3 | Missing in AAI44415. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 13 – 24 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 36 – 42 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 43 – 45 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 48 – 50 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 61 – 71 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 76 – 82 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 83 – 85 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 90 – 93 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 94 – 100 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 102 – 108 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 114 – 117 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 131 – 139 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 241 – 245 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 246 – 248 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 249 – 254 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 255 – 258 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 259 – 263 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 312 – 317 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 318 – 320 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 321 – 326 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 327 – 330 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 331 – 334 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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| [11] | "Pivotal role of the C2 domain of the Smurf1 ubiquitin ligase in substrate selection." Lu K., Li P., Zhang M., Xing G., Li X., Zhou W., Bartlam M., Zhang L., Rao Z., He F. J. Biol. Chem. 286:16861-16870(2011) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.96 ANGSTROMS) OF 13-140, FUNCTION, DOMAIN C2, INTERACTION WITH RHOA, MUTAGENESIS OF LYS-28 AND LYS-85. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AB046845 mRNA. Translation: BAB13451.1. Different initiation. AC004893 Genomic DNA. Translation: AAC62434.1. AF464850 mRNA. Translation: AAM90910.1. AC073468 Genomic DNA. No translation available. AC114500 Genomic DNA. No translation available. CH236956 Genomic DNA. Translation: EAL23885.1. CH236956 Genomic DNA. Translation: EAL23886.1. CH471091 Genomic DNA. Translation: EAW76687.1. CH471091 Genomic DNA. Translation: EAW76688.1. BC136804 mRNA. Translation: AAI36805.1. BC144414 mRNA. Translation: AAI44415.1. BC152468 mRNA. Translation: AAI52469.1. AF199364 mRNA. Translation: AAF08298.2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00217054. IPI00219332. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001186776.1. NM_001199847.1. NP_065162.1. NM_020429.2. NP_851994.1. NM_181349.2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.189329. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q9HCE7. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-36709N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q9HCE7. 3 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-102628. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000354621. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q9HCE7. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 17865625. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | Q9HCE7. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q9HCE7. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000361125; ENSP00000354621; ENSG00000198742. ENST00000361368; ENSP00000355326; ENSG00000198742. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 57154. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:57154. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc003upt.3. human. uc003upu.2. human. uc003upv.2. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 57154. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC07M098627. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:16807. SMURF1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB013009. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 605568. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_Q9HCE7. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA134987175. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HUGE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG5021. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000208451. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG004134. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | Q9HCE7. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K04678. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | VSCEELG. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG47PX58. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | Q9HCE7. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | bmppathway. BMP receptor signaling. hdac_classi_pathway. Signaling events mediated by HDAC Class I. tgfbrpathway. TGF-beta receptor signaling. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_111102. Signal Transduction. REACT_6900. Immune System. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SignaLink | Q9HCE7. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniPathway | UPA00143. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q9HCE7. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q9HCE7. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_SMURF1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q9HCE7. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000198742. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR000008. C2_Ca-dep. IPR008973. C2_Ca/lipid-bd_dom_CaLB. IPR018029. C2_membr_targeting. IPR024928. E3_ub_ligase_SMURF1. IPR000569. HECT. IPR001202. WW_dom. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00168. C2. 1 hit. PF00632. HECT. 1 hit. PF00397. WW. 2 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIRSF | PIRSF001569. E3_ub_ligase_SMURF1. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00239. C2. 1 hit. SM00119. HECTc. 1 hit. SM00456. WW. 2 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF49562. C2_CaLB. 1 hit. SSF56204. HECT. 1 hit. SSF51045. WW_Rsp5_WWP. 2 hits. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50004. C2. 1 hit. PS50237. HECT. 1 hit. PS01159. WW_DOMAIN_1. 1 hit. PS50020. WW_DOMAIN_2. 2 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChiTaRS | SMURF1. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q9HCE7. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 57154. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 63133. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | SMUF1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q9HCE7 Secondary accession number(s): A4D279 Q9UJT8 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
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