Q9BYW2 (SETD2_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Histone-lysine N-methyltransferase SETD2 EC=2.1.1.43 Alternative name(s): HIF-1 Huntingtin yeast partner B Huntingtin-interacting protein 1 Short name=HIP-1 Huntingtin-interacting protein B Lysine N-methyltransferase 3A SET domain-containing protein 2 Short name=hSET2 p231HBP | ||||||
| Gene names |
| ||||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 2564 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Histone methyltransferase that methylates 'Lys-36' of histone H3. H3 'Lys-36' methylation represents a specific tag for epigenetic transcriptional activation. Probably plays a role in chromatin structure modulation during elongation via its interaction with hyperphosphorylated POLR2A. Binds DNA at promoters. May also act as a transcription activator that binds to promoters. Binds to the promoters of adenovirus 12 E1A gene in case of infection, possibly leading to regulate its expression. Ref.6 |
| Catalytic activity | S-adenosyl-L-methionine + L-lysine-[histone] = S-adenosyl-L-homocysteine + N(6)-methyl-L-lysine-[histone]. |
| Subunit structure | Specifically interacts with hyperphosphorylated C-terminal domain (CTD) of RNA polymerase II large subunit (POLR2A). Binds specifically to CTD heptad repeats doubly phosphorylated on 'Ser-2' and 'Ser-5' of each heptad. Interacts with HTT. Ref.4 Ref.6 Ref.11 Ref.12 Ref.19 |
| Subcellular location | Nucleus Probable. Chromosome Probable. |
| Tissue specificity | Ubiquitously expressed. Ref.4 |
| Domain | The low charge region mediates the transcriptional activation activity. |
| Post-translational modification | May be automethylated. Ref.6 |
| Sequence similarities | Belongs to the histone-lysine methyltransferase family. SET2 subfamily. Contains 1 AWS domain. Contains 1 post-SET domain. Contains 1 SET domain. Contains 1 WW domain. |
| Sequence caution | The sequence AAF29041.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at several positions. The sequence AAH72440.1 differs from that shown. Reason: Erroneous termination at position 463. Translated as Glu. The sequence AAI17163.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. Translation N-terminally extended. The sequence AAI17165.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. Translation N-terminally extended. The sequence AAT77612.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. Translation N-terminally extended. The sequence AAT77613.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. Translation N-terminally extended. The sequence BAB15367.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. Translation N-terminally extended. The sequence BAB15367.1 differs from that shown. Reason: Contaminating sequence. Potential poly-A sequence. The sequence BAC87131.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. Translation N-terminally extended. The sequence CAC28349.1 differs from that shown. Reason: Erroneous termination at position 385. Translated as Arg. The sequence CAD38601.2 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. Translation N-terminally extended. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| SMAD3 | P84022 | 2 | EBI-945869,EBI-347161 |
Alternative products
| This entry describes 3 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: Q9BYW2-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: Q9BYW2-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1715-2564: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. | ||||||
| Isoform 3 (identifier: Q9BYW2-3) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1573-2564: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 2564 | 2564 | Histone-lysine N-methyltransferase SETD2 | PRO_0000252367 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 1494 – 1548 | 55 | AWS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 1549 – 1671 | 123 | SET | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 1674 – 1690 | 17 | Post-SET | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 2389 – 2422 | 34 | WW | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 2137 – 2366 | 230 | Low charge region | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 2457 – 2564 | 108 | Interaction with POLR2A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coiled coil | 2117 – 2146 | 30 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 166 – 247 | 82 | Pro-rich | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 385 – 456 | 72 | Arg-rich | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 2149 – 2232 | 84 | Pro-rich | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 2266 – 2365 | 100 | Gln-rich | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 131 | 1 | Phosphoserine Ref.16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 321 | 1 | Phosphoserine Ref.15 Ref.16 Ref.17 Ref.18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 323 | 1 | Phosphoserine Ref.15 Ref.16 Ref.17 Ref.18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 624 | 1 | Phosphoserine Ref.15 Ref.17 Ref.18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 708 | 1 | Phosphoserine Ref.16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 744 | 1 | Phosphoserine Ref.16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 754 | 1 | Phosphoserine Ref.15 Ref.16 Ref.18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 1228 | 1 | Phosphoserine Ref.14 Ref.15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 1872 | 1 | Phosphothreonine Ref.15 Ref.17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 2080 | 1 | Phosphoserine Ref.15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 2082 | 1 | Phosphoserine Ref.15 Ref.18 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1573 – 2564 | 992 | Missing in isoform 3. | VSP_020914 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1715 – 2564 | 850 | Missing in isoform 2. | VSP_020915 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 768 | 1 | V → L. Corresponds to variant rs9311404 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_027839 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 902 | 1 | E → Q. Corresponds to variant rs58906143 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_061216 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 1868 | 1 | A → D. Corresponds to variant rs11721074 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_027840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 1962 | 1 | P → L. Ref.5 Ref.8 Corresponds to variant rs4082155 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_027841 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 1625 | 1 | R → H: Loss of methyltransferase activity. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 2475 | 1 | R → A: Does not affect interaction with hyperphosphorylated POLR2A. Ref.19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 2476 | 1 | K → A: Does not affect interaction with hyperphosphorylated POLR2A. Ref.19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 2480 | 1 | Q → A: Does not affect interaction with hyperphosphorylated POLR2A. Ref.19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 2481 | 1 | F → A: Does not affect interaction with hyperphosphorylated POLR2A. Ref.19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 2483 | 1 | V → A: Impairs interaction with hyperphosphorylated POLR2A. Ref.19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 2505 | 1 | F → L: Impairs interaction with hyperphosphorylated POLR2A. Ref.19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 2506 | 1 | K → A: Impairs interaction with hyperphosphorylated POLR2A. Ref.19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 2510 | 1 | R → A: Impairs interaction with hyperphosphorylated POLR2A. Ref.19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 2514 | 1 | H → A: Impairs interaction with hyperphosphorylated POLR2A. Ref.19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 2515 | 1 | G → A or T: Does not affect interaction with hyperphosphorylated POLR2A. Ref.19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 2528 | 1 | E → A: Increases interaction with hyperphosphorylated POLR2A; when associated with A-2531. Ref.19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutagenesis | 2531 | 1 | E → A: Increases interaction with hyperphosphorylated POLR2A; when associated with A-2528. Ref.19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 448 | 1 | R → Q in BAD18522. Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 455 | 1 | A → V in CAD38601. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 912 | 1 | L → P in BAB15367. Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 964 | 1 | E → K in CAC28349. Ref.4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 964 | 1 | E → K in AAT77612. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 964 | 1 | E → K in AAT77613. Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 1080 | 1 | M → I in BAC87131. Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 1080 | 1 | M → T in CAD38601. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 1212 | 1 | V → F in BAD18522. Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 1269 | 1 | T → A in CAC28349. Ref.4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 1269 | 1 | T → A in AAT77612. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 1269 | 1 | T → A in AAT77613. Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 1338 | 1 | E → G in BAB15367. Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 1498 | 1 | Q → R in CAD38601. Ref.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 1706 | 1 | K → N in AAF29041. Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 1736 | 1 | L → P in CAC28349. Ref.4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 1736 | 1 | L → P in AAT77612. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1448 – 1450 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1451 – 1455 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1457 – 1465 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1480 – 1482 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1506 – 1511 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1523 – 1525 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1536 – 1538 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 1543 – 1547 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1552 – 1556 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1558 – 1568 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1575 – 1578 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1582 – 1584 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1586 – 1598 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1606 – 1610 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1613 – 1616 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1618 – 1621 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 1623 – 1626 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1634 – 1642 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1645 – 1654 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1661 – 1664 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 1667 – 1669 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1687 – 1689 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 2463 – 2486 | 24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 2487 – 2489 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2495 – 2498 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 2502 – 2524 | 23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 2527 – 2529 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 2534 – 2548 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 2549 – 2551 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 2557 – 2559 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||||||||
References
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AC094020 Genomic DNA. No translation available. AC127430 Genomic DNA. No translation available. AK026125 mRNA. Translation: BAB15367.1. Sequence problems. AK127782 mRNA. Translation: BAC87131.1. Different initiation. AK131371 mRNA. Translation: BAD18522.1. AL713692 mRNA. Translation: CAD28492.1. AL831959 mRNA. Translation: CAD38601.2. Different initiation. AL833394 mRNA. Translation: CAH10589.1. AJ238403 mRNA. Translation: CAC28349.1. Sequence problems. BC072440 mRNA. Translation: AAH72440.1. Sequence problems. BC090954 mRNA. Translation: AAH90954.1. BC117162 mRNA. Translation: AAI17163.1. Different initiation. BC117164 mRNA. Translation: AAI17165.1. Different initiation. AY576987 mRNA. Translation: AAT77612.1. Different initiation. AY576988 mRNA. Translation: AAT77613.1. Different initiation. AB051519 mRNA. Translation: BAB21823.2. AF161554 mRNA. Translation: AAF29041.1. Frameshift. AF049103 mRNA. Translation: AAC26194.1. AF049610 mRNA. Translation: AAC26846.1. | ||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00307733. IPI00442150. IPI00796144. | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_054878.5. NM_014159.6. | ||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.517941. | ||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q9BYW2. | ||||||||||||||||||||||||
| SMR | Q9BYW2. Positions 1447-1691, 2462-2561. | ||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q9BYW2. 8 interactions. | ||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-1537591. | ||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q9BYW2. | ||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 296452963. | ||||||||||||||||||||||||
2D gel databases | |||||||||||||||||||||||||
| OGP | Q9BYW2. | ||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | Q9BYW2. | ||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q9BYW2. | ||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000409792; ENSP00000386759; ENSG00000181555. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 29072. | ||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:29072. | ||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc003cqs.3. human. | ||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||
| CTD | 29072. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC03M047033. | ||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0021942. HIX0163343. | ||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:18420. SETD2. | ||||||||||||||||||||||||
| HPA | HPA042451. | ||||||||||||||||||||||||
| MIM | 612778. gene. | ||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_Q9BYW2. | ||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA143485612. | ||||||||||||||||||||||||
| HUGE | Search... | ||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG2940. | ||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG093939. | ||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | Q9BYW2. | ||||||||||||||||||||||||
| KO | K11423. | ||||||||||||||||||||||||
| OMA | VMDDFRD. | ||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q9BYW2. | ||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q9BYW2. | ||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_SETD2. | ||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q9BYW2. | ||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000181555. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR006560. AWS. IPR009078. Ferritin-like_SF. IPR003616. Post-SET_dom. IPR001214. SET_dom. IPR013257. SRI. IPR001202. WW_dom. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00856. SET. 1 hit. PF08236. SRI. 1 hit. PF00397. WW. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00570. AWS. 1 hit. SM00508. PostSET. 1 hit. SM00317. SET. 1 hit. SM00456. WW. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF47240. Ferritin/RR_like. 1 hit. SSF51045. WW_Rsp5_WWP. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS51215. AWS. 1 hit. PS50868. POST_SET. 1 hit. PS50280. SET. 1 hit. PS01159. WW_DOMAIN_1. 1 hit. PS50020. WW_DOMAIN_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||
| ChiTaRS | SETD2. human. | ||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q9BYW2. | ||||||||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 29072. | ||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 52031. | ||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | SETD2_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q9BYW2 Secondary accession number(s): O75397 Q9NZW9 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 3 Human chromosome 3: entries, gene names and cross-references to MIM |
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| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
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