Q9BVG8 (KIFC3_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Kinesin-like protein KIFC3 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 833 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Minus-end microtubule-dependent motor protein. Involved in apically targeted transport By similarity. Required for zonula adherens maintenance. Ref.7 |
| Subcellular location | Cell junction › adherens junction. Cytoplasm › cytoskeleton › centrosome. Cytoplasmic vesicle membrane; Peripheral membrane protein By similarity. Note: Apical cell membrane. On membrane organelles immediately beneath the apical plasma membrane of renal tubular epithelial cells. Localized in the distal tubules and loops of Henle in the kidney, but not in the proximal tubules or the glomeruli, with stronger staining in the apical area of these epithelial cells By similarity. Localizes along zonula adherens only at mature cell-cell contacts. Ref.7 |
| Sequence similarities | Belongs to the kinesin-like protein family. Contains 1 kinesin-motor domain. |
| Sequence caution | The sequence AAH34234.1 differs from that shown. Reason: Intron retention. The sequence AAH41132.1 differs from that shown. Reason: Intron retention. The sequence AAH47051.1 differs from that shown. Reason: Intron retention. The sequence BAD92527.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. |
Ontologies
Alternative products
| This entry describes 4 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: Q9BVG8-3) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: Q9BVG8-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 826-833: GKSRPLPV → A | ||||||
| Isoform 3 (identifier: Q9BVG8-4) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 626-637: FEFGHTNRTTEF → WRREPLTTATLL 638-833: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. May be produced at very low levels due to a premature stop codon in the mRNA, leading to nonsense-mediated mRNA decay. | ||||||
| Isoform 4 (identifier: Q9BVG8-5) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-139: Missing. 826-833: GKSRPLPV → A | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 833 | 833 | Kinesin-like protein KIFC3 | PRO_0000125431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 442 – 699 | 258 | Kinesin-motor | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 528 – 535 | 8 | ATP | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coiled coil | 102 – 362 | 261 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coiled coil | 395 – 432 | 38 | Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 139 | 139 | Missing in isoform 4. | VSP_043724 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 626 – 637 | 12 | FEFGH…RTTEF → WRREPLTTATLL in isoform 3. | VSP_022361 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 638 – 833 | 196 | Missing in isoform 3. | VSP_022362 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 826 – 833 | 8 | GKSRPLPV → A in isoform 2 and isoform 4. | VSP_021018 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 391 | 1 | G → V. Ref.5 Corresponds to variant rs17854089 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_028114 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 150 | 1 | M → L in AAC24153. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 185 | 1 | S → P in AAH34234. Ref.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 281 | 1 | H → S in AAH08014. Ref.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 736 | 1 | D → G in AAH34234. Ref.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 446 – 452 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 457 – 459 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 463 – 465 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 469 – 471 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 478 – 483 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 486 – 491 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 493 – 496 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 502 – 506 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 507 – 509 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 510 – 517 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 522 – 529 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 534 – 538 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 542 – 545 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 547 – 560 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 566 – 578 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 581 – 584 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 614 – 616 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 619 – 632 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 644 – 646 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 647 – 659 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 660 – 662 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 665 – 674 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 689 – 712 | 24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 720 – 722 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 724 – 728 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 730 – 733 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 738 – 745 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 749 – 751 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 752 – 765 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AK291737 mRNA. Translation: BAF84426.1. AB209290 mRNA. Translation: BAD92527.1. Different initiation. AC092118 Genomic DNA. No translation available. CH471092 Genomic DNA. Translation: EAW82955.1. BC001211 mRNA. Translation: AAH01211.2. BC008014 mRNA. Translation: AAH08014.1. BC034234 mRNA. Translation: AAH34234.1. Different initiation. BC041132 mRNA. Translation: AAH41132.1. Different initiation. BC047051 mRNA. Translation: AAH47051.1. Sequence problems. AF004426 mRNA. Translation: AAC24153.1. | ||||||||||||
| IPI | IPI00151119. IPI00867631. IPI00909341. IPI01015611. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_001123571.1. NM_001130099.1. NP_001123572.1. NM_001130100.1. NP_005541.3. NM_005550.3. | ||||||||||||
| UniGene | Hs.23131. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q9BVG8. | ||||||||||||
| SMR | Q9BVG8. Positions 445-766. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| IntAct | Q9BVG8. 8 interactions. | ||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000368976. | ||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||
| PhosphoSite | Q9BVG8. | ||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||
| DMDM | 124056471. | ||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||
| PaxDb | Q9BVG8. | ||||||||||||
| PRIDE | Q9BVG8. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| DNASU | 3801. | ||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| Ensembl | ENST00000379655; ENSP00000368976; ENSG00000140859. ENST00000421376; ENSP00000396399; ENSG00000140859. ENST00000445690; ENSP00000401696; ENSG00000140859. ENST00000465878; ENSP00000454659; ENSG00000140859. ENST00000562903; ENSP00000456239; ENSG00000140859. ENST00000564136; ENSP00000458009; ENSG00000140859. ENST00000593285; ENSP00000469595; ENSG00000269180. ENST00000594074; ENSP00000472587; ENSG00000269180. ENST00000597902; ENSP00000469179; ENSG00000269180. ENST00000599270; ENSP00000470797; ENSG00000269180. ENST00000600009; ENSP00000472239; ENSG00000269180. ENST00000601710; ENSP00000469004; ENSG00000269180. | ||||||||||||
| GeneID | 3801. | ||||||||||||
| KEGG | hsa:3801. | ||||||||||||
| UCSC | uc002emm.3. human. uc002emp.3. human. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CTD | 3801. | ||||||||||||
| GeneCards | GC16M057792. | ||||||||||||
| HGNC | HGNC:6326. KIFC3. | ||||||||||||
| HPA | HPA021240. | ||||||||||||
| MIM | 604535. gene. | ||||||||||||
| neXtProt | NX_Q9BVG8. | ||||||||||||
| PharmGKB | PA30112. | ||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | COG5059. | ||||||||||||
| HOGENOM | HOG000116164. | ||||||||||||
| HOVERGEN | HBG052259. | ||||||||||||
| InParanoid | Q9BVG8. | ||||||||||||
| KO | K10406. | ||||||||||||
| OrthoDB | EOG4HHP28. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| Reactome | REACT_17015. Metabolism of proteins. | ||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||
| ArrayExpress | Q9BVG8. | ||||||||||||
| Bgee | Q9BVG8. | ||||||||||||
| CleanEx | HS_KIFC3. | ||||||||||||
| Genevestigator | Q9BVG8. | ||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000140859. Homo sapiens. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| Gene3D | 3.40.850.10. 1 hit. | ||||||||||||
| InterPro | IPR027325. KIFC3. IPR019821. Kinesin_motor_CS. IPR001752. Kinesin_motor_dom. [Graphical view] | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR24115:SF173. PTHR24115:SF173. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF00225. Kinesin. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PRINTS | PR00380. KINESINHEAVY. | ||||||||||||
| SMART | SM00129. KISc. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PROSITE | PS00411. KINESIN_MOTOR_DOMAIN1. 1 hit. PS50067. KINESIN_MOTOR_DOMAIN2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other | |||||||||||||
| ChEMBL | CHEMBL1075119. | ||||||||||||
| ChiTaRS | KIFC3. human. | ||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q9BVG8. | ||||||||||||
| GenomeRNAi | 3801. | ||||||||||||
| NextBio | 14931. | ||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | KIFC3_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q9BVG8 Secondary accession number(s): A8K6S2 Q96HW6 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
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