Q9A1B7 (MURI_STRP1) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 29, 2013.
Version 80.
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| Protein names | Recommended name: Glutamate racemase EC=5.1.1.3 | ||||||
| Gene names |
| ||||||
| Organism | Streptococcus pyogenes serotype M1 [Complete proteome] [HAMAP] | ||||||
| Taxonomic identifier | 301447 [NCBI] | ||||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Firmicutes › Bacilli › Lactobacillales › Streptococcaceae › Streptococcus › ![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 264 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Provides the (R)-glutamate required for cell wall biosynthesis By similarity. HAMAP-Rule MF_00258 |
| Catalytic activity | L-glutamate = D-glutamate. HAMAP-Rule MF_00258 |
| Pathway | Cell wall biogenesis; peptidoglycan biosynthesis. HAMAP-Rule MF_00258 |
| Sequence similarities | Belongs to the aspartate/glutamate racemases family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Cell shape Cell wall biogenesis/degradation Peptidoglycan synthesis |
| Molecular function | Isomerase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | peptidoglycan biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: HAMAP regulation of cell shapeInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular_function | glutamate racemase activity Inferred from electronic annotation. Source: HAMAP |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 264 | 264 | Glutamate racemase HAMAP-Rule MF_00258 | PRO_0000095521 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 6 – 13 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 16 – 25 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 31 – 35 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 37 – 39 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 47 – 62 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 63 – 65 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 67 – 71 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 74 – 87 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 92 – 95 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 96 – 106 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 108 – 116 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 118 – 123 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 125 – 133 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 137 – 143 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 147 – 151 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 159 – 169 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 170 – 174 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 177 – 181 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 186 – 189 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 190 – 197 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 201 – 205 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 206 – 220 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 235 – 240 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 242 – 252 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 259 – 261 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Complete genome sequence of an M1 strain of Streptococcus pyogenes." Ferretti J.J., McShan W.M., Ajdic D.J., Savic D.J., Savic G., Lyon K., Primeaux C., Sezate S., Suvorov A.N., Kenton S., Lai H.S., Lin S.P., Qian Y., Jia H.G., Najar F.Z., Ren Q., Zhu H., Song L. McLaughlin R.E.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98:4658-4663(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 700294 / SF370 / Serotype M1. |
| [2] | "Evolutionary origin and emergence of a highly successful clone of serotype M1 group A Streptococcus involved multiple horizontal gene transfer events." Sumby P., Porcella S.F., Madrigal A.G., Barbian K.D., Virtaneva K., Ricklefs S.M., Sturdevant D.E., Graham M.R., Vuopio-Varkila J., Hoe N.P., Musser J.M. J. Infect. Dis. 192:771-782(2005) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC BAA-947 / MGAS5005 / Serotype M1. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AE004092 Genomic DNA. Translation: AAK33406.1. CP000017 Genomic DNA. Translation: AAZ50922.1. | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_268685.1. NC_002737.1. YP_281667.1. NC_007297.1. | ||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q9A1B7. | ||||||||||||||||||||||||
| SMR | Q9A1B7. Positions 1-264. | ||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||
| STRING | 160490.SPy_0361. | ||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||
| EnsemblBacteria | AAK33406; AAK33406; SPy_0361. AAZ50922; AAZ50922; M5005_Spy0303. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 3572593. 900634. | ||||||||||||||||||||||||
| KEGG | spy:SPy_0361. spz:M5005_Spy_0303. | ||||||||||||||||||||||||
| PATRIC | 19714487. VBIStrPyo79812_0312. | ||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||
| CMR | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG0796. | ||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000262396. | ||||||||||||||||||||||||
| KO | K01776. | ||||||||||||||||||||||||
| OMA | VIMACNT. | ||||||||||||||||||||||||
| ProtClustDB | PRK00865. | ||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||
| BioCyc | SPYO160490:GJ81-319-MONOMER. SPYO293653:GHFC-359-MONOMER. | ||||||||||||||||||||||||
| SABIO-RK | Q9A1B7. | ||||||||||||||||||||||||
| UniPathway | UPA00219. | ||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | 3.40.50.1860. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| HAMAP | MF_00258. Glu_racemase. | ||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR015942. Asp/Glu/hydantoin_racemase. IPR001920. Asp/Glu_race. IPR018187. Asp/Glu_racemase_AS. IPR004391. Glu_race. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR21198. PTHR21198. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF01177. Asp_Glu_race. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF53681. Asp/Glu_race. 2 hits. | ||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00067. glut_race. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00923. ASP_GLU_RACEMASE_1. False negative. PS00924. ASP_GLU_RACEMASE_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q9A1B7. | ||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | MURI_STRP1 | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q9A1B7 Secondary accession number(s): Q490P6 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
