Q99728 (BARD1_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 142.
History...
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Interactions·Sequence annotation·Sequences·References·Web links·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize order
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Interactions·Sequence annotation·Sequences·References·Web links·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: BRCA1-associated RING domain protein 1 Short name=BARD-1 EC=6.3.2.- | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 777 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Probable E3 ubiquitin-protein ligase. The BRCA1-BARD1 heterodimer specifically mediates the formation of 'Lys-6'-linked polyubiquitin chains and coordinates a diverse range of cellular pathways such as DNA damage repair, ubiquitination and transcriptional regulation to maintain genomic stability. Plays a central role in the control of the cell cycle in response to DNA damage. Acts by mediating ubiquitin E3 ligase activity that is required for its tumor suppressor function. Also forms a heterodimer with CSTF1/CSTF-50 to modulate mRNA processing and RNAP II stability by inhibiting pre-mRNA 3' cleavage. Ref.6 Ref.7 Ref.8 Ref.14 |
| Pathway | |
| Subunit structure | Homo- and heterodimer. Heterodimer (RING-type zinc finger) with BRCA1. Heterodimer (via ANK repeats and BRCT domains) with CSTF1/CSTF-50. Component of the BRCA1-A complex, at least composed of the BRCA1, BARD1, UIMC1/RAP80, FAM175A/Abraxas, BRCC3/BRCC36, BRE/BRCC45 and BABAM1/NBA1. Interacts with UBXN1. Ref.7 Ref.8 Ref.9 Ref.12 Ref.14 Ref.15 Ref.17 |
| Subcellular location | Nucleus. Note: During S phase of the cell cycle, colocalizes with BRCA1 into discrete subnuclear foci. Can translocate to the cytoplasm. Localizes at sites of DNA damage at double-strand breaks (DSBs); recruitment to DNA damage sites is mediated by the BRCA1-A complex. |
| Post-translational modification | Processed during apoptosis. The homodimer is more susceptible to proteolytic cleavage than the BARD1/BRCA1 heterodimer. |
| Sequence similarities | Contains 4 ANK repeats. Contains 2 BRCT domains. Contains 1 RING-type zinc finger. |
| Caution | It is uncertain whether Met-1 or Met-26 is the initiator. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| BRCA1 | P38398 | 8 | EBI-473181,EBI-349905 | |
| CHD3 | Q12873 | 2 | EBI-473181,EBI-523590 | |
| CSTF1 | Q05048 | 4 | EBI-473181,EBI-1789619 | |
| CSTF2 | P33240 | 5 | EBI-473181,EBI-711360 | |
| GIT1 | Q9Y2X7 | 2 | EBI-473181,EBI-466061 | |
| KAT7 | O95251 | 2 | EBI-473181,EBI-473199 | |
| KIAA1377 | Q9P2H0 | 2 | EBI-473181,EBI-473176 | |
| TCERG1 | O14776 | 2 | EBI-473181,EBI-473271 |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 777 | 777 | BRCA1-associated RING domain protein 1 | PRO_0000055819 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 427 – 459 | 33 | ANK 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 460 – 492 | 33 | ANK 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 493 – 525 | 33 | ANK 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 526 – 546 | 21 | ANK 4; degenerate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 560 – 653 | 94 | BRCT 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 667 – 777 | 111 | BRCT 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Zinc finger | 50 – 87 | 38 | RING-type | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 26 – 119 | 94 | Interaction with BRCA1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 554 – 558 | 5 | Flexible linker | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 400 – 403 | 4 | Poly-Ser | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 542 – 545 | 4 | Poly-Leu | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 391 | 1 | Phosphoserine Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 394 | 1 | Phosphothreonine Ref.11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cross-link | 423 | Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin) Ref.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 24 | 1 | P → S Common polymorphism in Caucasians; less frequent in Africans. Ref.2 Corresponds to variant rs1048108 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_010354 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 153 | 1 | K → E. Ref.2 | VAR_010355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 186 | 1 | S → G. Corresponds to variant rs16852741 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_038371 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 241 | 1 | S → C. Corresponds to variant rs3738885 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_020109 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 378 | 1 | R → S. Ref.2 Corresponds to variant rs2229571 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_024611 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 507 | 1 | V → M. Ref.2 Corresponds to variant rs2070094 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_010356 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 557 | 1 | C → S Rare polymorphism in Caucasians. Ref.2 Corresponds to variant rs28997576 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_010357 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 564 | 1 | Q → H in an ovarian clear cell adenocarcinoma. Ref.2 | VAR_010358 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 645 | 1 | C → R. Corresponds to variant rs34744268 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_038372 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 658 | 1 | R → C Rare polymorphism in Caucasians; absent in Africans. Ref.2 Corresponds to variant rs3738888 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_010359 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 695 | 1 | V → L in a breast cancer sample; somatic mutation. Ref.2 | VAR_010360 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 728 | 1 | S → F. Corresponds to variant rs13389423 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_028309 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 761 | 1 | S → N in an uterine cancer sample; somatic mutation. Ref.2 | VAR_010361 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 406 | 1 | R → Q in AAB38316. Ref.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 35 – 46 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 51 – 53 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 65 – 67 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 72 – 74 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 75 – 78 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 79 – 81 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 84 – 86 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 99 – 116 | 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 431 – 438 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 441 – 449 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 464 – 470 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 474 – 482 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 492 – 494 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 497 – 503 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 507 – 515 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 530 – 533 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 537 – 543 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 571 – 576 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 579 – 591 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 595 – 599 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 606 – 613 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 618 – 625 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 629 – 632 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 634 – 642 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 648 – 650 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 656 – 665 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 671 – 674 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 676 – 679 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 684 – 686 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 688 – 697 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 701 – 705 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 709 – 711 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 713 – 715 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 729 – 731 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 735 – 739 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 750 – 752 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 755 – 759 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 760 – 769 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Identification of a RING protein that can interact in vivo with the BRCA1 gene product." Wu L.C., Wang Z.W., Tsan J.T., Spillman M.A., Phung A., Xu X.L., Yang M.-C.W., Hwang L.-Y., Bowcock A.M., Baer R. Nat. Genet. 14:430-440(1996) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], CHARACTERIZATION. Tissue: B-cell. |
| [2] | "Mutations in the BRCA1-associated RING domain (BARD1) gene in primary breast, ovarian and uterine cancers." Thai T.H., Du F., Tsan J.T., Jin Y., Phung A., Spillman M.A., Massa H.F., Muller C.Y., Ashfaq R., Mathis J.M., Miller D.S., Trask B.J., Baer R., Bowcock A.M. Hum. Mol. Genet. 7:195-202(1998) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA], VARIANTS SER-24; GLU-153; SER-378; MET-507; SER-557; HIS-564; CYS-658; LEU-695 AND ASN-761. |
| [3] | "Generation and annotation of the DNA sequences of human chromosomes 2 and 4." Hillier L.W., Graves T.A., Fulton R.S., Fulton L.A., Pepin K.H., Minx P., Wagner-McPherson C., Layman D., Wylie K., Sekhon M., Becker M.C., Fewell G.A., Delehaunty K.D., Miner T.L., Nash W.E., Kremitzki C., Oddy L., Du H. Wilson R.K.Nature 434:724-731(2005) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [4] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Brain. |
| [5] | "Mapping the functional domains of BRCA1. Interaction of the ring finger domains of BRCA1 and BARD1." Meza J.E., Brzovic P.S., King M.-C., Klevit R.E. J. Biol. Chem. 274:5659-5665(1999) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: DOMAINS. |
| [6] | "Functional interaction of BRCA1-associated BARD1 with polyadenylation factor CstF-50." Kleiman F.E., Manley J.L. Science 285:1576-1579(1999) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: POSSIBLE FUNCTION. |
| [7] | "The BRCA1/BARD1 heterodimer assembles polyubiquitin chains through an unconventional linkage involving lysine residue K6 of ubiquitin." Wu-Baer F., Lagrazon K., Yuan W., Baer R. J. Biol. Chem. 278:34743-34746(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: FUNCTION, INTERACTION WITH BRCA1. |
| [8] | "BRCA1:BARD1 induces the formation of conjugated ubiquitin structures, dependent on K6 of ubiquitin, in cells during DNA replication and repair." Morris J.R., Solomon E. Hum. Mol. Genet. 13:807-817(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: FUNCTION, INTERACTION WITH BARD1. |
| [9] | "CCDC98 is a BRCA1-BRCT domain-binding protein involved in the DNA damage response." Kim H., Huang J., Chen J. Nat. Struct. Mol. Biol. 14:710-715(2007) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION IN THE BRCA1-A COMPLEX. |
| [10] | "Tryptic digestion of ubiquitin standards reveals an improved strategy for identifying ubiquitinated proteins by mass spectrometry." Denis N.J., Vasilescu J., Lambert J.-P., Smith J.C., Figeys D. Proteomics 7:868-874(2007) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: UBIQUITINATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT LYS-423, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Mammary cancer. |
| [11] | "A quantitative atlas of mitotic phosphorylation." Dephoure N., Zhou C., Villen J., Beausoleil S.A., Bakalarski C.E., Elledge S.J., Gygi S.P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105:10762-10767(2008) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-391 AND THR-394, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Cervix carcinoma. |
| [12] | "NBA1, a new player in the Brca1 A complex, is required for DNA damage resistance and checkpoint control." Wang B., Hurov K., Hofmann K., Elledge S.J. Genes Dev. 23:729-739(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION IN THE BRCA1-A COMPLEX. |
| [13] | "Quantitative phosphoproteomic analysis of T cell receptor signaling reveals system-wide modulation of protein-protein interactions." Mayya V., Lundgren D.H., Hwang S.-I., Rezaul K., Wu L., Eng J.K., Rodionov V., Han D.K. Sci. Signal. 2:RA46-RA46(2009) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION BY MASS SPECTROMETRY [LARGE SCALE ANALYSIS]. Tissue: Leukemic T-cell. |
| [14] | "The UBXN1 protein associates with autoubiquitinated forms of the BRCA1 tumor suppressor and inhibits its enzymatic function." Wu-Baer F., Ludwig T., Baer R. Mol. Cell. Biol. 30:2787-2798(2010) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: FUNCTION, INTERACTION WITH BRCA1. |
| [15] | "Structure of a BRCA1-BARD1 heterodimeric RING-RING complex." Brzovic P.S., Rajagopal P., Hoyt D.W., King M.C., Klevit R.E. Nat. Struct. Biol. 8:833-837(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: STRUCTURE BY NMR OF 26-140 IN COMPLEX WITH BRCA1 AND ZINC IONS, SUBUNIT. |
| [16] | "Crystal structure of the BARD1 BRCT domains." Birrane G., Varma A.K., Soni A., Ladias J.A. Biochemistry 46:7706-7712(2007) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.9 ANGSTROMS) OF 568-777. |
| [17] | "The BARD1 C-terminal domain structure and interactions with polyadenylation factor CstF-50." Edwards R.A., Lee M.S., Tsutakawa S.E., Williams R.S., Nazeer I., Kleiman F.E., Tainer J.A., Glover J.N. Biochemistry 47:11446-11456(2008) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.1 ANGSTROMS) OF 569-777, INTERACTION WITH CSTF1, DOMAIN STRUCTURE, MASS SPECTROMETRY. |
| [18] | "Crystal structure of the BARD1 ankyrin repeat domain and its functional consequences." Fox D. III, Le Trong I., Rajagopal P., Brzovic P.S., Stenkamp R.E., Klevit R.E. J. Biol. Chem. 283:21179-21186(2008) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.0 ANGSTROMS) OF 425-555, MASS SPECTROMETRY, DOMAINS ANK REPEATS, DOMAIN STRUCTURE. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | U76638 mRNA. Translation: AAB38316.1. AF038042 AF038041 Genomic DNA. Translation: AAB99978.1.AC016708 Genomic DNA. Translation: AAX93130.1. BC126426 mRNA. Translation: AAI26427.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00017746. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_000456.2. NM_000465.2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.591642. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q99728. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-5972N. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q99728. 28 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-207047. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000260947. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q99728. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 116241265. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | Q99728. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | Q99728. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q99728. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000260947; ENSP00000260947; ENSG00000138376. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 580. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:580. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc002veu.2. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 580. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC02M215556. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0030010. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:952. BARD1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB034106. HPA044864. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 601593. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_Q99728. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orphanet | 145. Hereditary breast and ovarian cancer syndrome. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA25256. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG0666. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000237306. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG050662. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | Q99728. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K10683. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | KKNSIKM. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4FFD1B. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | Q99728. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | bard1pathway. BARD1 signaling events. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniPathway | UPA00143. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q99728. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q99728. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_BARD1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q99728. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000138376. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | 1.25.40.20. 1 hit. 3.30.40.10. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR002110. Ankyrin_rpt. IPR020683. Ankyrin_rpt-contain_dom. IPR001357. BRCT_dom. IPR001841. Znf_RING. IPR013083. Znf_RING/FYVE/PHD. IPR017907. Znf_RING_CS. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00023. Ank. 3 hits. PF00533. BRCT. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR01415. ANKYRIN. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00248. ANK. 3 hits. SM00292. BRCT. 2 hits. SM00184. RING. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF48403. ANK. 1 hit. SSF52113. BRCT. 2 hits. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50297. ANK_REP_REGION. 1 hit. PS50088. ANK_REPEAT. 3 hits. PS50172. BRCT. 2 hits. PS00518. ZF_RING_1. 1 hit. PS50089. ZF_RING_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BindingDB | Q99728. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEMBL | CHEMBL1741211. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChiTaRS | BARD1. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q99728. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 580. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 2367. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | BARD1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q99728 Secondary accession number(s): O43574, Q53SS5 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 2 Human chromosome 2: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
