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UniProtKB/Swiss-Prot Q99584 (S10AD_HUMAN)
Last modified
June 16, 2009.
Version 77.
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Documents (4) |
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Names and origin · Protein attributes · General annotation (Comments) · Ontologies · Sequence annotation (Features) · Sequences · References · Cross-references · Entry information · Relevant documents
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Protein S100-A13 Alternative name(s): S100 calcium-binding protein A13 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 98 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Tissue specificity | Expressed in heart and skeletal muscle. |
| Sequence similarities | Belongs to the S-100 family. Contains 2 EF-hand domains. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Domain | Repeat |
| Ligand | Calcium |
| Technical term | 3D-structure |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | cell differentiation Non-traceable author statement. Source: UniProtKB |
| Molecular function | calcium ion binding Ref.1 Traceable author statement. Source: UniProtKB |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 98 | 98 | Protein S100-A13 | PRO_0000144019 | |||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||
| Domain | 18 – 53 | 36 | EF-hand 1 | ||||||||||||||||||||
| Calcium binding | 24 – 37 | 14 | 1; low affinity By similarity | ||||||||||||||||||||
| Calcium binding | 64 – 75 | 12 | 2; high affinity By similarity | ||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||
| Helix | 1 – 3 | 3 | |||||||||||||||||||||
| Helix | 8 – 24 | 17 | |||||||||||||||||||||
| Beta strand | 26 – 28 | 3 | |||||||||||||||||||||
| Helix | 35 – 45 | 11 | |||||||||||||||||||||
| Turn | 47 – 52 | 6 | |||||||||||||||||||||
| Helix | 56 – 63 | 8 | |||||||||||||||||||||
| Beta strand | 67 – 72 | 6 | |||||||||||||||||||||
| Helix | 73 – 88 | 16 | |||||||||||||||||||||
Sequences
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Characterization of the human and mouse cDNAs coding for S100A13, a new member of the S100 protein family." Wicki R., Schaefer B.W., Erne P., Heizmann C.W. Biochem. Biophys. Res. Commun. 227:594-599(1996) [PubMed: 8878558] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. |
| [2] | "Cloning of human full open reading frames in Gateway(TM) system entry vector (pDONR201)." Halleck A., Ebert L., Mkoundinya M., Schick M., Eisenstein S., Neubert P., Kstrang K., Schatten R., Shen B., Henze S., Mar W., Korn B., Zuo D., Hu Y., LaBaer J. Submitted (JUN-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. |
| [3] | "Cloning of human full-length CDSs in BD Creator(TM) system donor vector." Kalnine N., Chen X., Rolfs A., Halleck A., Hines L., Eisenstein S., Koundinya M., Raphael J., Moreira D., Kelley T., LaBaer J., Lin Y., Phelan M., Farmer A. Submitted (OCT-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. |
| [4] | "The DNA sequence and biological annotation of human chromosome 1." Gregory S.G., Barlow K.F., McLay K.E., Kaul R., Swarbreck D., Dunham A., Scott C.E., Howe K.L., Woodfine K., Spencer C.C.A., Jones M.C., Gillson C., Searle S., Zhou Y., Kokocinski F., McDonald L., Evans R., Phillips K. Bentley D.R.Nature 441:315-321(2006) [PubMed: 16710414] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [5] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Tissue: Eye and Skin. |
| [6] | Wen G.B., Yang J., Cao R.X., Liu J.H., Peng Z.L. Submitted (MAR-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 2-98. Tissue: Thyroid. |
| [7] | Colinge J., Superti-Furga G., Bennett K.L. Submitted (OCT-2008) to UniProtKB Cited for: IDENTIFICATION [LARGE SCALE ANALYSIS], MASS SPECTROMETRY. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| X99920 mRNA. Translation: CAA68188.1. CR542149 mRNA. Translation: CAG46946.1. BT006724 mRNA. Translation: AAP35370.1. BX470102 Genomic DNA. Translation: CAI14760.1. BC000632 mRNA. Translation: AAH00632.1. BC068064 mRNA. Translation: AAH68064.1. BC070291 mRNA. Translation: AAH70291.1. AY987392 mRNA. Translation: AAX89402.1. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00016179. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | JC5064. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001019381.1. NP_001019382.1. NP_001019383.1. NP_001019384.1. NP_005970.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.516505 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q99584. 1 interaction. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q99584. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | Q99584. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q99584. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000189171. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 6284. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:6284. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NMPDR | fig|9606.3.peg.2109. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC01M151857. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0001084. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:10490. S100A13. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MIM | 601989. gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA34902. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | Q99584. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | Q99584. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | Q99584. FTFAGRE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q99584. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q99584. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_S100A13. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000189171. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR011992. EF-Hand_type. IPR018247. EF_HAND_1. IPR001751. S100_Ca_bd. IPR013787. S100_Ca_bd_sub. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:1.10.238.10. EF-Hand_type. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF01023. S_100. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProDom | PD003407. CaBP_S100. 1 hit. PD000012. EF-hand. 1 hit. [Graphical view] [Entries sharing at least one domain] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00018. EF_HAND_1. False negative. PS50222. EF_HAND_2. False negative. PS00303. S100_CABP. False negative. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank | DB01025. Amlexanox. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 24393. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | S10AD_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q99584 Secondary accession number(s): Q52PI9, Q6FGF8 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 1 Human chromosome 1: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


