Q99259 (DCE1_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Glutamate decarboxylase 1 EC=4.1.1.15 Alternative name(s): 67 kDa glutamic acid decarboxylase Short name=GAD-67 Glutamate decarboxylase 67 kDa isoform | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 594 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes the production of GABA. |
| Catalytic activity | L-glutamate = 4-aminobutanoate + CO2. |
| Cofactor | Pyridoxal phosphate. Ref.15 |
| Subunit structure | Homodimer. Ref.15 |
| Tissue specificity | Isoform 3 is expressed in pancreatic islets, testis, adrenal cortex, and perhaps other endocrine tissues, but not in brain. Ref.8 |
| Involvement in disease | Cerebral palsy, spastic quadriplegic 1 (CPSQ1) [MIM:603513]: A non-progressive disorder of movement and/or posture resulting from defects in the developing central nervous system. Affected individuals manifest symmetrical, non-progressive spasticity and no adverse perinatal history or obvious underlying alternative diagnosis. Developmental delay, mental retardation and sometimes epilepsy can be part of the clinical picture. |
| Sequence similarities | Belongs to the group II decarboxylase family. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| NCK1 | P16333 | 2 | EBI-743184,EBI-389883 |
Alternative products
| This entry describes 3 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: Q99259-1) Also known as: GAD67; This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: Q99259-2) The sequence of this isoform is not available. | ||||||
| Isoform 3 (identifier: Q99259-3) Also known as: GAD25; The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 214-224: FTYEIAPVFVL → PSDMRECWLLR 225-594: Missing. | ||||||
| Note: Lacks enzymatic activity. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 594 | 594 | Glutamate decarboxylase 1 | PRO_0000146963 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 190 – 192 | 3 | Substrate binding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 567 | 1 | Substrate | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 405 | 1 | N6-(pyridoxal phosphate)lysine | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 214 – 224 | 11 | FTYEIAPVFVL → PSDMRECWLLR in isoform 3. | VSP_009123 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 225 – 594 | 370 | Missing in isoform 3. | VSP_009124 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 12 | 1 | S → C in CPSQ1. Ref.16 | VAR_031021 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 228 | 1 | I → L. Ref.9 Corresponds to variant rs45566933 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_018861 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 474 | 1 | V → G. Corresponds to variant rs769403 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_011882 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 532 | 1 | R → Q. Ref.9 Corresponds to variant rs769402 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_011883 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 565 | 1 | F → L. Corresponds to variant rs1049736 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_011884 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 9 | 1 | Missing in AAA35900. Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 16 – 17 | 2 | GA → EP in AAB59427. Ref.4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 16 – 17 | 2 | GA → EP in CAA80435. Ref.4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 17 | 1 | A → Q in AAA35900. Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 18 | 1 | D → N in AAB26938. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 31 | 1 | T → N in AAB26938. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 68 | 1 | K → R in AAA62368. Ref.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 116 | 1 | F → L in AAB26938. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 136 | 1 | T → A in AAA35900. Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 140 | 1 | D → E in AAA35900. Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 142 | 1 | H → R in AAA35900. Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 155 | 1 | N → T in AAB26938. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 206 | 1 | T → N in AAB59427. Ref.4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 206 | 1 | T → N in CAA80435. Ref.4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 302 | 1 | G → C in AAB26938. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 436 | 1 | F → L in AAB26937. Ref.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 477 | 1 | E → G in AAB26938. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 492 | 1 | A → G in AAB26938. Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 512 | 1 | N → S in AAB26937. Ref.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 94 – 97 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 100 – 102 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 110 – 131 | 22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 144 – 149 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 165 – 177 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 187 – 192 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 197 – 209 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 212 – 214 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 216 – 218 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 220 – 237 | 18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 241 – 243 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 245 – 251 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 252 – 267 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 270 – 274 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 276 – 278 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 282 – 287 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 293 – 300 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 305 – 307 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 308 – 311 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 321 – 333 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 337 – 346 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 348 – 350 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 356 – 366 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 369 – 374 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 377 – 382 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 384 – 386 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 387 – 390 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 393 – 395 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 397 – 401 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 414 – 420 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 423 – 428 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 433 – 435 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 444 – 446 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 449 – 451 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 461 – 495 | 35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 500 – 506 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 509 – 511 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 513 – 517 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 520 – 522 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 529 – 549 | 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 553 – 559 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 562 – 568 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 577 – 591 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Two human glutamate decarboxylases, 65-kDa GAD and 67-kDa GAD, are each encoded by a single gene." Bu D.-F., Erlander M.G., Hitz B.C., Tillakaratne N.J., Kaufman D.L., Wagner-Mcpherson C.B., Evans G.A., Tobin A.J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89:2115-2119(1992) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). Tissue: Brain. |
| [2] | "The exon-intron organization of the genes (GAD1 and GAD2) encoding two human glutamate decarboxylases (GAD67 and GAD65) suggests that they derive from a common ancestral GAD." Bu D.-F., Tobin A.J. Genomics 21:222-228(1994) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). |
| [3] | "Cloning of large isoform of human brain glutamic acid decarboxylase." Kelly C.D., Carter N.D., Johnstone A.P., Nussey S.S. Lancet 338:1468-1469(1991) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). |
| [4] | "Nucleotide sequence and chromosomal assignment of a cDNA encoding the large isoform of human glutamate decarboxylase." Kelly C.D., Edwards Y., Johnstone A.P., Harfst E., Nogradi A., Nussey S.S., Povey S., Carter N.D. Ann. Hum. Genet. 56:255-265(1992) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). Tissue: Brain. |
| [5] | "Molecular cloning of full-length glutamic acid decarboxylase 67 from human pancreas and islets." Yamashita K., Cram D.S., Harrison L.C. Biochem. Biophys. Res. Commun. 192:1347-1352(1993) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). |
| [6] | "Cloning and expression of large isoform of glutamic acid decarboxylase from human pancreatic islet." Kawasaki E., Moriuchi R., Watanabe M., Saitoh K., Brunicardi F.C., Watt P.C., Yamaguchi T., Mullen Y., Akazawa S., Miyamoto T. Biochem. Biophys. Res. Commun. 192:1353-1359(1993) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). Tissue: Pancreatic islet. |
| [7] | "Sequence of glutamic acid decarboxylase transcripts in human pancreatic islets and brain." Giorda R., Peakman M., Vergani D., Trucco M. Submitted (MAR-1992) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. |
| [8] | "Alternative splicing of GAD67 results in the synthesis of a third form of glutamic-acid decarboxylase in human islets and other non-neural tissues." Chessler S.D., Lernmark A. J. Biol. Chem. 275:5188-5192(2000) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 3), TISSUE SPECIFICITY. Tissue: Pancreatic islet and Testis. |
| [9] | NIEHS SNPs program Submitted (JUL-2003) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA], VARIANTS LEU-228 AND GLN-532. |
| [10] | "Generation and annotation of the DNA sequences of human chromosomes 2 and 4." Hillier L.W., Graves T.A., Fulton R.S., Fulton L.A., Pepin K.H., Minx P., Wagner-McPherson C., Layman D., Wylie K., Sekhon M., Becker M.C., Fewell G.A., Delehaunty K.D., Miner T.L., Nash W.E., Kremitzki C., Oddy L., Du H. Wilson R.K.Nature 434:724-731(2005) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [11] | Mural R.J., Istrail S., Sutton G.G., Florea L., Halpern A.L., Mobarry C.M., Lippert R., Walenz B., Shatkay H., Dew I., Miller J.R., Flanigan M.J., Edwards N.J., Bolanos R., Fasulo D., Halldorsson B.V., Hannenhalli S., Turner R. Venter J.C.Submitted (JUL-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [12] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORMS 1 AND 3). Tissue: Brain. |
| [13] | "Cloning and partial nucleotide sequence of human glutamic acid decarboxylase cDNA from brain and pancreatic islets." Cram D.S., Barnett L.D., Joseph J.L., Harrison L.C. Biochem. Biophys. Res. Commun. 176:1239-1244(1991) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 218-397. Tissue: Brain. |
| [14] | "Expression of the neurotransmitter-synthesizing enzyme glutamic acid decarboxylase in male germ cells." Persson H., Pelto-Huikko M., Metsis M., Soeder O., Brene S., Skog S., Hoekfelt T., Ritzen E.M. Mol. Cell. Biol. 10:4701-4711(1990) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] OF 527-594. Tissue: Testis. |
| [15] | "GABA production by glutamic acid decarboxylase is regulated by a dynamic catalytic loop." Fenalti G., Law R.H.P., Buckle A.M., Langendorf C., Tuck K., Rosado C.J., Faux N.G., Mahmood K., Hampe C.S., Banga J.P., Wilce M., Schmidberger J., Rossjohn J., El-Kabbani O., Pike R.N., Smith A.I., Mackay I.R., Rowley M.J., Whisstock J.C. Nat. Struct. Mol. Biol. 14:280-286(2007) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.3 ANGSTROMS) OF 93-594 IN COMPLEX WITH SUBSTRATE ANALOG, SUBUNIT, COFACTOR. |
| [16] | "Homozygosity for a missense mutation in the 67 kDa isoform of glutamate decarboxylase in a family with autosomal recessive spastic cerebral palsy: parallels with Stiff-Person Syndrome and other movement disorders." Lynex C.N., Carr I.M., Leek J.P., Achuthan R., Mitchell S., Maher E.R., Woods C.G., Bonthon D.T., Markham A.F. BMC Neurol. 4:20-20(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANT CPSQ1 CYS-12. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Web resources
| NIEHS-SNPs |
| Wikipedia Glutamate decarboxylase entry |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | M81883 mRNA. Translation: AAA62368.1. L16888 mRNA. Translation: AAB59427.1. Z22750 mRNA. Translation: CAA80435.1. S61897 mRNA. Translation: AAB26937.1. S61898 mRNA. Translation: AAB26938.1. M86522 Genomic DNA. Translation: AAA35900.1. AF178853 mRNA. Translation: AAF18390.2. AY337516 Genomic DNA. Translation: AAP88035.1. AC007405 Genomic DNA. Translation: AAY24237.1. CH471058 Genomic DNA. Translation: EAX11228.1. CH471058 Genomic DNA. Translation: EAX11229.1. BC002815 mRNA. Translation: AAH02815.1. BC026349 mRNA. Translation: AAH26349.1. M70434 mRNA. Translation: AAA52512.1. M55574 mRNA. Translation: AAA72938.1. | ||||||||||||||||||
| IPI | IPI00292646. IPI00844138. | ||||||||||||||||||
| PIR | B41935. S48135. S51775. S51776. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_000808.2. NM_000817.2. NP_038473.2. NM_013445.3. | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.420036. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q99259. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| DIP | DIP-29292N. | ||||||||||||||||||
| IntAct | Q99259. 6 interactions. | ||||||||||||||||||
| MINT | MINT-3058814. | ||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000350928. | ||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q99259. | ||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||
| DMDM | 1352213. | ||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||
| PaxDb | Q99259. | ||||||||||||||||||
| PRIDE | Q99259. | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| DNASU | 2571. | ||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000344257; ENSP00000341167; ENSG00000128683. ENST00000358196; ENSP00000350928; ENSG00000128683. ENST00000375272; ENSP00000364421; ENSG00000128683. | ||||||||||||||||||
| GeneID | 2571. | ||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:2571. | ||||||||||||||||||
| UCSC | uc002ugh.3. human. uc002ugi.3. human. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CTD | 2571. | ||||||||||||||||||
| GeneCards | GC02P171669. | ||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:4092. GAD1. | ||||||||||||||||||
| HPA | CAB004415. | ||||||||||||||||||
| MIM | 603513. phenotype. 605363. gene. | ||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_Q99259. | ||||||||||||||||||
| Orphanet | 210141. Inherited congenital spastic tetraplegia. | ||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA28507. | ||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| eggNOG | COG0076. | ||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000005382. | ||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG004980. | ||||||||||||||||||
| InParanoid | Q99259. | ||||||||||||||||||
| KO | K01580. | ||||||||||||||||||
| OMA | ISMAGEW. | ||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4QJRMS. | ||||||||||||||||||
| PhylomeDB | Q99259. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| BioCyc | MetaCyc:HS05215-MONOMER. | ||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_13685. Neuronal System. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q99259. | ||||||||||||||||||
| Bgee | Q99259. | ||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_GAD1. | ||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q99259. | ||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000128683. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| Gene3D | 3.40.640.10. 1 hit. 3.90.1150.10. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| InterPro | IPR002129. PyrdxlP-dep_de-COase. IPR015424. PyrdxlP-dep_Trfase. IPR015421. PyrdxlP-dep_Trfase_major_sub1. IPR015422. PyrdxlP-dep_Trfase_major_sub2. IPR021115. Pyridoxal-P_BS. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00282. Pyridoxal_deC. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF53383. PyrdxlP-dep_Trfase_major. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00392. DDC_GAD_HDC_YDC. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||
| BindingDB | Q99259. | ||||||||||||||||||
| ChEMBL | CHEMBL2614. | ||||||||||||||||||
| ChiTaRS | GAD1. human. | ||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00142. L-Glutamic Acid. DB00114. Pyridoxal Phosphate. | ||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q99259. | ||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 2571. | ||||||||||||||||||
| NextBio | 10169. | ||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | DCE1_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q99259 Secondary accession number(s): Q53TQ7, Q9BU91, Q9UHH4 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
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