Q97PK6 (KCY_STRPN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
January 25, 2012.
Version 68.
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| Protein names | Recommended name: Cytidylate kinase Short name=CK EC=2.7.4.25 Alternative name(s): Cytidine monophosphate kinase Short name=CMP kinase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Streptococcus pneumoniae [Complete proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 1313 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Firmicutes › Lactobacillales › Streptococcaceae › Streptococcus |
Protein attributes
| Sequence length | 223 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | ATP + (d)CMP = ADP + (d)CDP. HAMAP MF_00238 |
| Subcellular location | Cytoplasm By similarity HAMAP MF_00238. |
| Sequence similarities | Belongs to the cytidylate kinase family. Type 1 subfamily. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cytoplasm |
| Ligand | ATP-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Kinase Transferase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Cellular component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | ATP binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW cytidylate kinase activityInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 223 | 223 | Cytidylate kinase HAMAP MF_00238 | PRO_0000131985 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 10 – 18 | 9 | ATP By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 5 – 9 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 16 – 27 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 30 – 33 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 34 – 47 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 55 – 64 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 68 – 72 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 73 – 75 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 76 – 81 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 84 – 90 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 93 – 103 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 106 – 120 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 125 – 128 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 133 – 136 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 137 – 139 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 141 – 147 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 150 – 163 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 170 – 184 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 188 – 190 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 199 – 202 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 208 – 222 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Complete genome sequence of a virulent isolate of Streptococcus pneumoniae." Tettelin H., Nelson K.E., Paulsen I.T., Eisen J.A., Read T.D., Peterson S.N., Heidelberg J.F., DeBoy R.T., Haft D.H., Dodson R.J., Durkin A.S., Gwinn M.L., Kolonay J.F., Nelson W.C., Peterson J.D., Umayam L.A., White O., Salzberg S.L. Fraser C.M.Science 293:498-506(2001) [PubMed: 11463916] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC BAA-334 / TIGR4. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AE005672 Genomic DNA. Translation: AAK75687.1. | ||||||||||||
| PIR | F95186. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_346047.1. NC_003028.3. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q97PK6. | ||||||||||||
| SMR | Q97PK6. Positions 1-223. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| EnsemblBacteria | EBSTRT00000026153; EBSTRP00000025245; EBSTRG00000026153. | ||||||||||||
| GeneID | 931235. | ||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus SP_1603 in contig AE005672_GR. | ||||||||||||
| KEGG | spn:SP_1603. | ||||||||||||
| PATRIC | 19707633. VBIStrPne105772_1658. | ||||||||||||
| TIGR | SP_1603. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| GeneTree | EBGT00050000027971. | ||||||||||||
| HOGENOM | HBG354377. | ||||||||||||
| OMA | DIGTVIC. | ||||||||||||
| ProtClustDB | PRK00023. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | SPNE170187-1:SP_1603-MONOMER. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| HAMAP | MF_00238. Cytidyl_kinase_type1. [Tree] | ||||||||||||
| InterPro | IPR003136. Cytidylate_kin. IPR011994. Cytidylate_kinase_dom. [Graphical view] | ||||||||||||
| KO | K00945. | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR21299:SF2. Cytidylate_kin. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF02224. Cytidylate_kin. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00017. Cmk. 1 hit. | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | KCY_STRPN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q97PK6 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with