Q96PU4 (UHRF2_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2 EC=6.3.2.- Alternative name(s): Np95/ICBP90-like RING finger protein Short name=Np95-like RING finger protein Nuclear protein 97 Nuclear zinc finger protein Np97 RING finger protein 107 Ubiquitin-like PHD and RING finger domain-containing protein 2 Ubiquitin-like-containing PHD and RING finger domains protein 2 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 802 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | E3 ubiquitin-protein ligase that is an intermolecular hub protein in the cell cycle network. Through cooperative DNA and histone binding, may contribute to a tighter epigenetic control of gene expression in differentiated cells. Ubiquitinates cyclins, CCND1 and CCNE1, in an apparently phosphorylation-independent manner and induces G1 arrest. Also ubiquitinates PCNP leading to its degradation by the proteasome. Appears to contribute to tumorigenesis. Ref.1 Ref.6 Ref.7 Ref.8 Ref.11 |
| Pathway | |
| Subunit structure | Homodimer; disulfide-linked. Binds methylated CpG containing oligonucleotides. Interacts with H3: the interaction has a preference for the 'Lys-9' trimethylated form of H3 (H3K9me3) By similarity. Interacts with PCNP, HDAC1 and CDK2 (inactive form). Component of a complex at least composed of UHRF2, CDK2 and CCNE1. Interacts directly with CCNE1; the interaction ubiquitinates CCNE1 and appears independent of CCNE1 phosphorylation. Interacts with CCND1; the interaction ubiquitinates CCND1 and appears independent of CCND1 phosphorylation. Interacts with p53/TP53 and RB1. Ref.1 Ref.6 Ref.7 Ref.8 Ref.11 Ref.14 |
| Subcellular location | Nucleus. Note: Enriched at pericentric heterochromatin (PH). This localization is dependent on the interaction with H3K9me3 By similarity. Ref.1 |
| Induction | Up-regulated in proliferating fetal lung fibroblasts and in U-937 myeloid leukemia cells. Down-regulated in these cells by growth arrest and differentiation. In other cell types which cannot leave the cell cycle, such as tumoral HT-1080 and Hep-G2, levels are consistently up-regulated. Ref.1 |
| Post-translational modification | May be autoubiquitinated; which may lead to proteasomal degradation. Phosphorylated. Phosphorylation may be mediated by CDK2. Ref.6 |
| Involvement in disease | Associated with various cancers. DNA copy number loss is found in multiple kinds of malignancies originating from the brain, breast, stomach, kidney, hematopoietic tissue and lung. |
| Sequence similarities | Contains 1 PHD-type zinc finger. Contains 1 RING-type zinc finger. Contains 1 ubiquitin-like domain. Contains 1 YDG domain. |
| Sequence caution | The sequence CAH74120.1 differs from that shown. Reason: Erroneous gene model prediction. The sequence CAI13295.1 differs from that shown. Reason: Erroneous gene model prediction. |
Ontologies
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| CCNA2 | P20248 | 2 | EBI-625304,EBI-457097 | |
| CCNB1 | P14635 | 2 | EBI-625304,EBI-495332 | |
| CCND1 | P24385 | 4 | EBI-625304,EBI-375001 | |
| CCNE1 | P24864 | 4 | EBI-625304,EBI-519526 | |
| CDK2 | P24941 | 5 | EBI-625304,EBI-375096 | |
| RB1 | P06400 | 4 | EBI-625304,EBI-491274 | |
| TP53 | P04637 | 3 | EBI-625304,EBI-366083 |
Alternative products
| This entry describes 2 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: Q96PU4-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: Q96PU4-2) Also known as: a; The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 500-503: DRGD → LTEL 504-802: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 802 | 802 | E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2 | PRO_0000056147 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 1 – 78 | 78 | Ubiquitin-like | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 448 – 612 | 165 | YDG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Zinc finger | 344 – 395 | 52 | PHD-type | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Zinc finger | 733 – 772 | 40 | RING-type | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 117 – 311 | 195 | Required for interaction with histone H3 By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 194 – 288 | 95 | Interaction with PCNP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 414 – 644 | 231 | Methyl-CpG binding and interaction with HDAC1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 667 | 1 | Phosphoserine Ref.9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 704 | Interchain Ref.14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 500 – 503 | 4 | DRGD → LTEL in isoform 2. | VSP_013874 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 504 – 802 | 299 | Missing in isoform 2. | VSP_013875 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 87 | 1 | I → N in a colorectal cancer sample; somatic mutation. Ref.15 | VAR_035961 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 287 | 1 | L → M in AAH28397. Ref.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 329 | 1 | P → T in AAH28397. Ref.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 416 | 1 | P → Q in AAH28397. Ref.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 1 – 7 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 13 – 19 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 25 – 35 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 40 – 42 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 43 – 47 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 54 – 57 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 58 – 61 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 68 – 73 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 332 – 334 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 338 – 340 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 343 – 346 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 348 – 350 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 359 – 361 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 363 – 365 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 368 – 370 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 373 – 376 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 390 – 392 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 458 – 461 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 462 – 467 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 477 – 481 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 482 – 484 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 485 – 493 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 502 – 508 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 532 – 540 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 541 – 543 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 547 – 549 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 556 – 558 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 562 – 567 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 568 – 570 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 571 – 573 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 579 – 597 | 19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 599 – 601 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 604 – 612 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 622 – 630 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 694 – 702 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 704 – 706 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 707 – 713 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 714 – 722 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 723 – 730 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 734 – 736 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 737 – 739 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 741 – 745 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 751 – 753 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 754 – 762 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 769 – 771 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 785 – 794 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 796 – 801 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "NIRF, a novel RING finger protein, is involved in cell-cycle regulation." Mori T., Li Y., Hata H., Ono K., Kochi H. Biochem. Biophys. Res. Commun. 296:530-536(2002) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1), SUBCELLULAR LOCATION, INDUCTION, FUNCTION, INTERACTION WITH PCNP. Tissue: Fetal brain. |
| [2] | "LMO2-induced T cell leukemias overexpress a novel gene, Uhr1, containing RING and PHD zinc fingers and an ubiquitin-like domain." Davenport J.W., Fernandes E.R., Neale G.A.M., Goorha R.M. Submitted (JUN-2000) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1). |
| [3] | "DNA sequence and analysis of human chromosome 9." Humphray S.J., Oliver K., Hunt A.R., Plumb R.W., Loveland J.E., Howe K.L., Andrews T.D., Searle S., Hunt S.E., Scott C.E., Jones M.C., Ainscough R., Almeida J.P., Ambrose K.D., Ashwell R.I.S., Babbage A.K., Babbage S., Bagguley C.L. Dunham I.Nature 429:369-374(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [4] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORM 2). Tissue: Brain. |
| [5] | "The full-ORF clone resource of the German cDNA consortium." Bechtel S., Rosenfelder H., Duda A., Schmidt C.P., Ernst U., Wellenreuther R., Mehrle A., Schuster C., Bahr A., Bloecker H., Heubner D., Hoerlein A., Michel G., Wedler H., Koehrer K., Ottenwaelder B., Poustka A., Wiemann S., Schupp I. BMC Genomics 8:399-399(2007) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] OF 636-802 (ISOFORM 1). Tissue: Testis. |
| [6] | "NIRF induces G1 arrest and associates with Cdk2." Li Y., Mori T., Hata H., Homma Y., Kochi H. Biochem. Biophys. Res. Commun. 319:464-468(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: FUNCTION IN CELL CYCLE, PHOSPHORYLATION, INTERACTION WITH CDK2, IDENTIFICATION IN A COMPLEX WITH CDK2 AND CCNE1. |
| [7] | "NIRF is a ubiquitin ligase that is capable of ubiquitinating PCNP, a PEST-containing nuclear protein." Mori T., Li Y., Hata H., Kochi H. FEBS Lett. 557:209-214(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: UBIQUITINATION, INTERACTION WITH PCNP, FUNCTION. |
| [8] | "ICBP90, an E2F-1 target, recruits HDAC1 and binds to methyl-CpG through its SRA domain." Unoki M., Nishidate T., Nakamura Y. Oncogene 23:7601-7610(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: FUNCTION, INTERACTION WITH HDAC1. |
| [9] | "A quantitative atlas of mitotic phosphorylation." Dephoure N., Zhou C., Villen J., Beausoleil S.A., Bakalarski C.E., Elledge S.J., Gygi S.P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105:10762-10767(2008) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-667, MASS SPECTROMETRY. Tissue: Cervix carcinoma. |
| [10] | "Initial characterization of the human central proteome." Burkard T.R., Planyavsky M., Kaupe I., Breitwieser F.P., Buerckstuemmer T., Bennett K.L., Superti-Furga G., Colinge J. BMC Syst. Biol. 5:17-17(2011) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: IDENTIFICATION BY MASS SPECTROMETRY [LARGE SCALE ANALYSIS]. |
| [11] | "NIRF constitutes a nodal point in the cell cycle network and is a candidate tumor suppressor." Mori T., Ikeda D.D., Fukushima T., Takenoshita S., Kochi H. Cell Cycle 10:3284-3299(2011) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: FUNCTION, INTERACTION WITH CCDN1; CCNE1; TP53 AND RB1, ASSOCIATION WITH TUMORIGENESIS. |
| [12] | "Solution structure of the N-terminal ubiquitin-like domain in human NP95/ICBP90-like RING finger protein (NIRF)." RIKEN structural genomics initiative (RSGI) Submitted (AUG-2005) to the PDB data bank Cited for: STRUCTURE BY NMR OF 1-76. |
| [13] | "2.1 Angstrom crystal structure of the human ubiquitin ligase NIRF." Structural genomics consortium (SGC) Submitted (JAN-2006) to the PDB data bank Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.1 ANGSTROMS) OF 672-802 IN COMPLEX WITH ZINC IONS. |
| [14] | "2.1 Angstrom crystal structure of the human ubiquitin ligase NIRF." Structural genomics consortium (SGC) Submitted (FEB-2009) to the PDB data bank Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.1 ANGSTROMS) OF 672-802, SUBUNIT, DISULFIDE BOND. |
| [15] | "The consensus coding sequences of human breast and colorectal cancers." Sjoeblom T., Jones S., Wood L.D., Parsons D.W., Lin J., Barber T.D., Mandelker D., Leary R.J., Ptak J., Silliman N., Szabo S., Buckhaults P., Farrell C., Meeh P., Markowitz S.D., Willis J., Dawson D., Willson J.K.V. Velculescu V.E.Science 314:268-274(2006) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: VARIANT [LARGE SCALE ANALYSIS] ASN-87. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AB071698 mRNA. Translation: BAB68317.1. AF274049 mRNA. Translation: AAM33799.1. AL353718, AL133480 Genomic DNA. Translation: CAH74119.1. AL133480, AL353718 Genomic DNA. Translation: CAI13293.1. AL353718, AL133480 Genomic DNA. Translation: CAH74120.1. Sequence problems. AL133480, AL353718 Genomic DNA. Translation: CAI13295.1. Sequence problems. BC028397 mRNA. Translation: AAH28397.1. AL137728 mRNA. Translation: CAH56383.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00044681. IPI00395464. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_690856.1. NM_152896.2. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.493401. | ||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q96PU4. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q96PU4. 36 interactions. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| MINT | MINT-1196856. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000276893. | ||||||||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q96PU4. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 67462076. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | Q96PU4. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | Q96PU4. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q96PU4. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| DNASU | 115426. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000276893; ENSP00000276893; ENSG00000147854. ENST00000450508; ENSP00000399217; ENSG00000147854. ENST00000468435; ENSP00000434182; ENSG00000147854. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 115426. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:115426. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc003zjy.3. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 115426. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC09P006405. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:12557. UHRF2. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HPA | HPA026633. HPA026697. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_Q96PU4. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA37197. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG3440. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000124662. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG059298. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | Q96PU4. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K15713. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | VNHNSKE. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG408N7M. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| UniPathway | UPA00143. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q96PU4. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q96PU4. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_UHRF2. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q96PU4. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000147854. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | 2.30.280.10. 1 hit. 2.30.30.30. 1 hit. 3.30.40.10. 2 hits. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR021991. DUF3590. IPR014722. Rib_L2_dom2. IPR003105. SRA_YDG. IPR000626. Ubiquitin. IPR019955. Ubiquitin_supergroup. IPR011011. Znf_FYVE_PHD. IPR001965. Znf_PHD. IPR019787. Znf_PHD-finger. IPR001841. Znf_RING. IPR013083. Znf_RING/FYVE/PHD. IPR017907. Znf_RING_CS. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF12148. DUF3590. 1 hit. PF00628. PHD. 1 hit. PF00240. ubiquitin. 1 hit. PF02182. YDG_SRA. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00249. PHD. 1 hit. SM00184. RING. 2 hits. SM00466. SRA. 1 hit. SM00213. UBQ. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF57903. FYVE_PHD_ZnF. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00299. UBIQUITIN_1. False negative. PS50053. UBIQUITIN_2. 1 hit. PS51015. YDG. 1 hit. PS01359. ZF_PHD_1. 1 hit. PS50016. ZF_PHD_2. 1 hit. PS00518. ZF_RING_1. 1 hit. PS50089. ZF_RING_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||
| ChiTaRS | UHRF2. human. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q96PU4. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 115426. | ||||||||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 79598. | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | UHRF2_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q96PU4 Secondary accession number(s): Q5VYR1 Q8TAG7 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
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