Q96HN2 (SAHH3_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Putative adenosylhomocysteinase 3 Short name=AdoHcyase 3 EC=3.3.1.1 Alternative name(s): S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase 3 S-adenosylhomocysteine hydrolase-like protein 2 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 611 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | S-adenosyl-L-homocysteine + H2O = L-homocysteine + adenosine. |
| Cofactor | Binds 1 NAD per subunit. |
| Pathway | |
| Subunit structure | Homotetramer Probable. Ref.7 |
| Sequence similarities | Belongs to the adenosylhomocysteinase family. |
| Sequence caution | The sequence BAA74851.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. Translation N-terminally shortened. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | One-carbon metabolism |
| Coding sequence diversity | Alternative splicing |
| Ligand | NAD |
| Molecular function | Hydrolase |
| PTM | Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | one-carbon metabolic process Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular_function | adenosylhomocysteinase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC nucleotide bindingInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Alternative products
| This entry describes 4 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: Q96HN2-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: Q96HN2-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 122-122: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. | ||||||
| Isoform 3 (identifier: Q96HN2-3) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-18: MSVQVVSAAAAAKVPEVE → MLGSKKKYIVNGNSGIKA 19-121: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. | ||||||
| Isoform 4 (identifier: Q96HN2-4) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-19: MSVQVVSAAAAAKVPEVEL → MEKWDGNEGTSAFHMPEWM 20-122: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 611 | 611 | Putative adenosylhomocysteinase 3 | PRO_0000116909 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 336 – 338 | 3 | NAD By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 401 – 406 | 6 | NAD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 478 – 479 | 2 | NAD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 236 | 1 | Substrate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 310 | 1 | Substrate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 335 | 1 | Substrate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 365 | 1 | Substrate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 369 | 1 | Substrate By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 370 | 1 | NAD By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 422 | 1 | NAD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 457 | 1 | NAD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 525 | 1 | NAD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 107 | 1 | Phosphoserine Ref.5 Ref.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 19 | 19 | MSVQV…PEVEL → MEKWDGNEGTSAFHMPEWM in isoform 4. | VSP_046278 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 18 | 18 | MSVQV…VPEVE → MLGSKKKYIVNGNSGIKA in isoform 3. | VSP_043185 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 19 – 121 | 103 | Missing in isoform 3. | VSP_043186 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 20 – 122 | 103 | Missing in isoform 4. | VSP_046279 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 122 | 1 | Missing in isoform 2. | VSP_040095 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 191 – 193 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 194 – 206 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 209 – 218 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 223 – 226 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 228 – 233 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 237 – 248 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 252 – 261 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 265 – 274 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 286 – 297 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 305 – 312 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 313 – 321 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 323 – 327 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 331 – 334 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 337 – 343 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 356 – 358 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 363 – 369 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 371 – 386 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 394 – 398 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 402 – 413 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 417 – 421 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 425 – 433 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 441 – 444 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 445 – 447 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 449 – 453 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 463 – 468 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 473 – 477 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 481 – 484 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 487 – 490 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 496 – 501 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 504 – 508 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 514 – 518 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 519 – 521 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 524 – 528 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 533 – 552 | 20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 555 – 557 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 560 – 564 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 567 – 577 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 578 – 581 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 590 – 596 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro." Nagase T., Ishikawa K., Suyama M., Kikuno R., Hirosawa M., Miyajima N., Tanaka A., Kotani H., Nomura N., Ohara O. DNA Res. 5:355-364(1998) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORM 2). Tissue: Brain. |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AB020635 mRNA. Translation: BAA74851.1. Different initiation. AK025372 mRNA. No translation available. AK295851 mRNA. Translation: BAG58657.1. AK316073 mRNA. Translation: BAH14444.1. AC009244 Genomic DNA. No translation available. AC011005 Genomic DNA. No translation available. AC083866 Genomic DNA. No translation available. AC093149 Genomic DNA. No translation available. BC008349 mRNA. Translation: AAH08349.1. BC024325 mRNA. Translation: AAH24325.1. | ||||||||||||
| IPI | IPI00101645. IPI00908473. IPI00910338. IPI00945758. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_001124192.1. NM_001130720.2. NP_001124194.2. NM_001130722.2. NP_001124195.1. NM_001130723.2. NP_056143.1. NM_015328.3. | ||||||||||||
| UniGene | Hs.600789. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q96HN2. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| IntAct | Q96HN2. 6 interactions. | ||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000315931. | ||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||
| PhosphoSite | Q96HN2. | ||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||
| DMDM | 21759427. | ||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||
| PaxDb | Q96HN2. | ||||||||||||
| PRIDE | Q96HN2. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| Ensembl | ENST00000325006; ENSP00000315931; ENSG00000158467. ENST00000446544; ENSP00000413639; ENSG00000158467. ENST00000474594; ENSP00000420459; ENSG00000158467. ENST00000490911; ENSP00000420801; ENSG00000158467. | ||||||||||||
| GeneID | 23382. | ||||||||||||
| KEGG | hsa:23382. | ||||||||||||
| UCSC | uc003vot.3. human. uc011kov.2. human. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CTD | 23382. | ||||||||||||
| GeneCards | GC07P128865. | ||||||||||||
| HGNC | HGNC:22204. AHCYL2. | ||||||||||||
| HPA | HPA053128. | ||||||||||||
| neXtProt | NX_Q96HN2. | ||||||||||||
| PharmGKB | PA162376046. | ||||||||||||
| HUGE | Search... | ||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | COG0499. | ||||||||||||
| HOGENOM | HOG000227986. | ||||||||||||
| HOVERGEN | HBG005041. | ||||||||||||
| InParanoid | Q96HN2. | ||||||||||||
| KO | K01251. | ||||||||||||
| OMA | NWQPNMI. | ||||||||||||
| OrthoDB | EOG4GMTWR. | ||||||||||||
| PhylomeDB | Q96HN2. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| UniPathway | UPA00314; UER00076. | ||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||
| ArrayExpress | Q96HN2. | ||||||||||||
| Bgee | Q96HN2. | ||||||||||||
| CleanEx | HS_AHCYL2. | ||||||||||||
| Genevestigator | Q96HN2. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| Gene3D | 3.40.50.720. 1 hit. | ||||||||||||
| InterPro | IPR000043. Adenosylhomocysteinase. IPR015878. Ado_hCys_hydrolase_NAD-bd. IPR016040. NAD(P)-bd_dom. IPR020082. S-Ado-L-homoCys_hydrolase_CS. [Graphical view] | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR23420. PTHR23420. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF05221. AdoHcyase. 1 hit. PF00670. AdoHcyase_NAD. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PIRSF | PIRSF001109. Ad_hcy_hydrolase. 1 hit. | ||||||||||||
| SMART | SM00996. AdoHcyase. 1 hit. SM00997. AdoHcyase_NAD. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00936. ahcY. 1 hit. | ||||||||||||
| PROSITE | PS00738. ADOHCYASE_1. 1 hit. PS00739. ADOHCYASE_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other | |||||||||||||
| ChiTaRS | AHCYL2. human. | ||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q96HN2. | ||||||||||||
| GenomeRNAi | 23382. | ||||||||||||
| NextBio | 45489. | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | SAHH3_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q96HN2 Secondary accession number(s): B4DIZ5, D9N155, O94917 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 7 Human chromosome 7: entries, gene names and cross-references to MIM |
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
