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UniProtKB/Swiss-Prot Q969H0 (FBXW7_HUMAN)
Last modified
February 9, 2010.
Version 81.
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90%,
50% identity |
Documents (6) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: F-box/WD repeat-containing protein 7 Alternative name(s): F-box and WD-40 domain-containing protein 7 F-box protein FBX30 Short name=hCdc4 Archipelago homolog Short name=hAgo SEL-10 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 707 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Substrate recognition component of a SCF (SKP1-CUL1-F-box protein) E3 ubiquitin-protein ligase complex which mediates the ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of target proteins. Probably recognizes and binds to phosphorylated target proteins. Involved in the degradation of cyclin E, NOTCH1 released notch intracellular domain (NICD), and probably PSEN1. Ref.3 Ref.8 |
| Subunit structure | Component of the SCF(FBXW7) complex consisting of CUL1, RBX1, SKP1A and FBXW7. Interacts with PSEN1, cyclin E, NOTCH1 NICD, NOTCH4 NICD and SKP1A. Ref.3 Ref.8 Ref.4 |
| Subcellular location | Nucleus By similarity. |
| Tissue specificity | Isoform 1 is widely expressed. Isoform 4 is expressed in brain. Ref.4 |
| Post-translational modification | Phosphorylated upon DNA damage, probably by ATM or ATR. Ref.9 |
| Sequence similarities | Contains 1 F-box domain. Contains 7 WD repeats. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Ubl conjugation pathway |
| Cellular component | Nucleus |
| Coding sequence diversity | Alternative splicing Polymorphism |
| Domain | Repeat WD repeat |
| PTM | Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | modification-dependent protein catabolic process Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW protein ubiquitination Ref.4Inferred from direct assay. Source: MGI |
| Cellular component | nucleus Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | protein binding Ref.4 Inferred from physical interaction. Source: IntAct |
| Complete GO annotation... | |
Binary interactions
With | Entry | #Exp. | IntAct | Notes |
|---|---|---|---|---|
| MYC | P01106 | 1 | EBI-359574,EBI-447544 | |
| SKP1 | P63208 | 1 | EBI-359574,EBI-307486 |
Alternative products
| This entry describes 4 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: Q969H0-1) Also known as: Archipelago alpha; 110K; common; This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: Q969H0-2) Also known as: Archipelago beta; 69K; The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-80: Missing. 81-166: NNRFISVDED...LSSPFYTKTT → MCVPRSGLIL...FYGTLKMIFY | ||||||
| Isoform 3 (identifier: Q969H0-3) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-166: MNQELLSVGS...LSSPFYTKTT → VLILSCICLY...FYGTLKMIFY | ||||||
| Note: Incomplete sequence. | ||||||
| Isoform 4 (identifier: Q969H0-4) Also known as: Hippocampal; The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-118: Missing. 119-167: DQESDDFDQS...SSPFYTKTTK → MSKPGKPTLN...AQGLPFCRRR |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 707 | 707 | F-box/WD repeat-containing protein 7 | PRO_0000050994 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 278 – 324 | 47 | F-box | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 378 – 418 | 41 | WD 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 420 – 456 | 37 | WD 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 459 – 498 | 40 | WD 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 500 – 536 | 37 | WD 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 539 – 578 | 40 | WD 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 580 – 618 | 39 | WD 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 622 – 659 | 38 | WD 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 26 | 1 | Phosphoserine Ref.9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 166 | 166 | MNQEL…YTKTT → VLILSCICLYCGVLLPVLLP NLPFLTCLSMSTLESVTYLP EKGLYCQRLPSSRTHGGTES LKGKNTENMGFYGTLKMIFY in isoform 3. | VSP_009481 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 118 | 118 | Missing in isoform 4. | VSP_009482 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 80 | 80 | Missing in isoform 2. | VSP_009483 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 81 – 166 | 86 | NNRFI…YTKTT → MCVPRSGLILSCICLYCGVL LPVLLPNLPFLTCLSMSTLE SVTYLPEKGLYCQRLPSSRT HGGTESLKGKNTENMGFYGT LKMIFY in isoform 2. | VSP_009484 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 119 – 167 | 49 | DQESD…TKTTK → MSKPGKPTLNHGLVPVDLKS AKEPLPHQTVMKIFSISIIA QGLPFCRRR in isoform 4. | VSP_009485 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 115 | 1 | E → K: dbSNP rs6816935. | VAR_017812 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 117 | 1 | E → K in a breast cancer sample; somatic mutation. Ref.11 | VAR_033030 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 133 | 1 | R → G: dbSNP rs6842544. | VAR_017813 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 144 | 1 | T → R: dbSNP rs7660281. | VAR_017814 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 465 | 1 | R → C in a acute lymphoblastic leukemia cell line. Ref.2 | VAR_017815 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 465 | 1 | R → H in a colorectal cancer sample; somatic mutation. Ref.10 | VAR_035880 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 505 | 1 | R → L in an ovarian cancer cell line. Ref.2 Ref.10 | VAR_017816 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 582 | 1 | S → L in a colorectal cancer sample; somatic mutation. Ref.10 | VAR_035881 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 668 | 1 | S → G: dbSNP rs7679116. | VAR_017817 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 344 | 1 | P → L in AAH37320. Ref.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 377 | 1 | K → N in AAH37320. Ref.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 508 | 1 | Q → R in AAH37320. Ref.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 265 – 272 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 280 – 283 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 286 – 293 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 298 – 305 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 309 – 315 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 318 – 327 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 350 – 366 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 374 – 377 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 384 – 390 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 393 – 401 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 403 – 407 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 408 – 410 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 413 – 416 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 424 – 438 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 441 – 447 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 448 – 450 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 453 – 458 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 466 – 470 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 473 – 477 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 481 – 487 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 488 – 490 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 495 – 498 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 504 – 509 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 514 – 518 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 523 – 527 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 528 – 530 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 532 – 537 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 544 – 549 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 551 – 558 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 563 – 567 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 568 – 570 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 573 – 577 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 584 – 590 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 593 – 598 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 603 – 607 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 608 – 611 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 612 – 617 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 627 – 632 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 634 – 641 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 644 – 650 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 651 – 653 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 656 – 662 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 664 – 669 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 671 – 677 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 679 – 687 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 696 – 701 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References
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| [1] | "A family of mammalian F-box proteins." Winston J.T., Koepp D.M., Zhu C., Elledge S.J., Harper J.W. Curr. Biol. 9:1180-1182(1999) [PubMed: 10531037] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORMS 2 AND 3). |
| [2] | "Archipelago regulates cyclin E levels in Drosophila and is mutated in human cancer cell lines." Moberg K.H., Bell D.W., Wahrer D.C.R., Haber D.A., Hariharan I.K. Nature 413:311-316(2001) [PubMed: 11565033] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORMS 1 AND 2), VARIANTS CYS-465 AND LEU-505. |
| [3] | "Human F-box protein hCdc4 targets cyclin E for proteolysis and is mutated in a breast cancer cell line." Strohmaier H., Spruck C.H., Kaiser P., Won K.-A., Sangfelt O., Reed S.I. Nature 413:316-322(2001) [PubMed: 11565034] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1), FUNCTION, IDENTIFICATION IN SCF COMPLEX, INTERACTION WITH CYCLIN E. |
| [4] | "SEL-10 interacts with presenilin 1, facilitates its ubiquitination, and alters A-beta peptide production." Li J., Pauley A.M., Myers R.L., Shuang R., Brashler J.R., Yan R., Buhl A.E., Ruble C., Gurney M.E. J. Neurochem. 82:1540-1548(2002) [PubMed: 12354302] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 4), TISSUE SPECIFICITY, INTERACTION WITH PSEN1. |
| [5] | "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs." Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., Otsuki T., Sugiyama T., Irie R., Wakamatsu A., Hayashi K., Sato H., Nagai K., Kimura K., Makita H., Sekine M., Obayashi M., Nishi T., Shibahara T., Tanaka T., Ishii S. Sugano S.Nat. Genet. 36:40-45(2004) [PubMed: 14702039] [Abstract] Cited for: PARTIAL NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORM 3). Tissue: Placenta. |
| [6] | "The full-ORF clone resource of the German cDNA consortium." Bechtel S., Rosenfelder H., Duda A., Schmidt C.P., Ernst U., Wellenreuther R., Mehrle A., Schuster C., Bahr A., Bloecker H., Heubner D., Hoerlein A., Michel G., Wedler H., Koehrer K., Ottenwaelder B., Poustka A., Wiemann S., Schupp I. BMC Genomics 8:399-399(2007) [PubMed: 17974005] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORM 1). Tissue: Salivary gland. |
| [7] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA] (ISOFORMS 1 AND 3). Tissue: Brain. |
| [8] | "SEL-10 is an inhibitor of notch signaling that targets notch for ubiquitin-mediated protein degradation." Wu G., Lyapina S., Das I., Li J., Gurney M., Pauley A., Chui I., Deshaies R.J., Kitajewski J. Mol. Cell. Biol. 21:7403-7415(2001) [PubMed: 11585921] [Abstract] Cited for: FUNCTION, INTERACTION WITH NOTCH1; NOTCH4 AND SKP1A. |
| [9] | "ATM and ATR substrate analysis reveals extensive protein networks responsive to DNA damage." Matsuoka S., Ballif B.A., Smogorzewska A., McDonald E.R. III, Hurov K.E., Luo J., Bakalarski C.E., Zhao Z., Solimini N., Lerenthal Y., Shiloh Y., Gygi S.P., Elledge S.J. Science 316:1160-1166(2007) [PubMed: 17525332] [Abstract] Cited for: PHOSPHORYLATION [LARGE SCALE ANALYSIS] AT SER-26, MASS SPECTROMETRY. |
| [10] | "The consensus coding sequences of human breast and colorectal cancers." Sjoeblom T., Jones S., Wood L.D., Parsons D.W., Lin J., Barber T.D., Mandelker D., Leary R.J., Ptak J., Silliman N., Szabo S., Buckhaults P., Farrell C., Meeh P., Markowitz S.D., Willis J., Dawson D., Willson J.K.V. Velculescu V.E.Science 314:268-274(2006) [PubMed: 16959974] [Abstract] Cited for: VARIANTS [LARGE SCALE ANALYSIS] HIS-465; LEU-505 AND LEU-582. |
| [11] | "Somatic sequence alterations in twenty-one genes selected by expression profile analysis of breast carcinomas." Chanock S.J., Burdett L., Yeager M., Llaca V., Langeroed A., Presswalla S., Kaaresen R., Strausberg R.L., Gerhard D.S., Kristensen V., Perou C.M., Boerresen-Dale A.-L. Breast Cancer Res. 9:R5-R5(2007) [PubMed: 17224074] [Abstract] Cited for: VARIANT LYS-117. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AY033553 mRNA. Translation: AAK57547.1. AF383178 mRNA. Translation: AAK60269.1. AY008274 mRNA. Translation: AAG16640.1. AF411971 mRNA. Translation: AAL06290.1. AF411972 mRNA. Translation: AAL06291.1. AY049984 mRNA. Translation: AAL07271.1. AK001933 mRNA. Translation: BAA91986.1. Different initiation. CR749305 mRNA. Translation: CAH18160.1. BC037320 mRNA. Translation: AAH37320.1. BC117244 mRNA. Translation: AAI17245.1. BC117246 mRNA. Translation: AAI17247.1. BC143944 mRNA. Translation: AAI43945.1. | ||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00056349. IPI00059165. IPI00075075. IPI00402151. | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001013433.1. NP_060785.2. NP_361014.1. | ||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.679796 | ||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||
| DIP | DIP-27613N. | ||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q969H0. 9 interactions. | ||||||||||||||||||||||||
| STRING | Q969H0. | ||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q969H0. | ||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q969H0. | ||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000281708; ENSP00000281708; ENSG00000109670; Homo sapiens. [Genome view] ENST00000393956; ENSP00000377528; ENSG00000109670; Homo sapiens. [Genome view] | ||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 55294. | ||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:55294. | ||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc003imr.1. human. uc003ims.1. human. | ||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||
| CTD | 55294. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC04M153461. | ||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0004570. | ||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:16712. FBXW7. | ||||||||||||||||||||||||
| HPA | CAB013793. | ||||||||||||||||||||||||
| MIM | 606278. gene. | ||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA28054. | ||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG627825. | ||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | Q969H0. | ||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | Q969H0. | ||||||||||||||||||||||||
| OMA | SSQIDEE. | ||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG9XWJH9. | ||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | Q969H0. | ||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_17015. Metabolism of proteins. | ||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q969H0. | ||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q969H0. | ||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_FBXW7. | ||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q969H0. | ||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000109670. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR001810. F-box. IPR020472. G-protein_beta_WD-40_rep_reg. IPR015943. WD40/YVTN_repeat-like_dom. IPR001680. WD40_repeat. IPR011046. WD40_repeat-like_dom. IPR019782. WD40_repeat_2. IPR019775. WD40_repeat_CS. IPR017986. WD40_repeat_dom. IPR019781. WD40_repeat_sg. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:2.130.10.10. WD40/YVTN_repeat-like. 2 hits. | ||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00646. F-box. 1 hit. PF00400. WD40. 7 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00320. GPROTEINBRPT. | ||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00256. FBOX. 1 hit. SM00320. WD40. 8 hits. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50181. FBOX. 1 hit. PS00678. WD_REPEATS_1. 5 hits. PS50082. WD_REPEATS_2. 7 hits. PS50294. WD_REPEATS_REGION. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 59488. | ||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | FBXW7_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q969H0 Secondary accession number(s): B7ZLP9 Q9NUX6 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
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