Q93SX0 (UCRIA_NOSS1) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 83.
History...
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize order
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit 1 EC=1.10.9.1 Alternative name(s): Plastohydroquinone:plastocyanin oxidoreductase iron-sulfur protein 1 Short name=ISP 1 Short name=RISP 1 Rieske iron-sulfur protein 1 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Nostoc sp. (strain PCC 7120 / UTEX 2576) [Complete proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 103690 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Cyanobacteria › Nostocales › Nostocaceae › Nostoc![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 179 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Component of the cytochrome b6-f complex, which mediates electron transfer between photosystem II (PSII) and photosystem I (PSI), cyclic electron flow around PSI, and state transitions By similarity. HAMAP-Rule MF_01335 |
| Catalytic activity | Plastoquinol + 2 oxidized plastocyanin + 2 H+(Side 1) = plastoquinone + 2 reduced plastocyanin + 2 H+(Side 2). HAMAP-Rule MF_01335 |
| Cofactor | Binds 1 2Fe-2S cluster per subunit By similarity. |
| Subunit structure | The 4 large subunits of the cytochrome b6-f complex are cytochrome b6, subunit IV (17 kDa polypeptide, PetD), cytochrome f and the Rieske protein, while the 4 small subunits are PetG, PetL, PetM and PetN. The complex functions as a dimer By similarity. |
| Subcellular location | Cellular thylakoid membrane; Single-pass membrane protein By similarity. Note: The transmembrane helix obliquely spans the membrane in one monomer, and its extrinsic C-terminal domain is part of the other monomer By similarity. HAMAP-Rule MF_01335 |
| Miscellaneous | The Rieske iron-sulfur protein is a high potential 2Fe-2S protein. HAMAP-Rule MF_01335 |
| Sequence similarities | Contains 1 Rieske domain. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 179 | 179 | Cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit 1 HAMAP-Rule MF_01335 | PRO_0000127767 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 21 – 43 | 23 | Helical; Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 61 – 162 | 102 | Rieske | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 108 | 1 | Iron-sulfur (2Fe-2S) By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 110 | 1 | Iron-sulfur (2Fe-2S); via pros nitrogen By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 126 | 1 | Iron-sulfur (2Fe-2S) By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 129 | 1 | Iron-sulfur (2Fe-2S); via pros nitrogen By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 113 ↔ 128 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 13 – 42 | 30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 50 – 52 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 66 – 71 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 79 – 82 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 84 – 86 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 88 – 91 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 101 – 105 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 109 – 111 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 119 – 122 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 123 – 125 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 127 – 129 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 141 – 143 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 150 – 156 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 159 – 164 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 170 – 172 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "b6f complex of Anabaena sp; possible function of alternative Rieske-FeS proteins." Arnold M. Submitted (MAY-2001) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. |
| [2] | "Complete genomic sequence of the filamentous nitrogen-fixing cyanobacterium Anabaena sp. strain PCC 7120." Kaneko T., Nakamura Y., Wolk C.P., Kuritz T., Sasamoto S., Watanabe A., Iriguchi M., Ishikawa A., Kawashima K., Kimura T., Kishida Y., Kohara M., Matsumoto M., Matsuno A., Muraki A., Nakazaki N., Shimpo S., Sugimoto M. Tabata S.DNA Res. 8:205-213(2001) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: PCC 7120 / UTEX 2576. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AJ319646 Genomic DNA. Translation: CAC39604.1. BA000019 Genomic DNA. Translation: BAB74152.1. | ||||||||||||||||||
| PIR | AF2112. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_486493.1. NC_003272.1. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q93SX0. | ||||||||||||||||||
| SMR | Q93SX0. Positions 9-178. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| STRING | 103690.all2453. | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| EnsemblBacteria | BAB74152; BAB74152; BAB74152. | ||||||||||||||||||
| GeneID | 1106050. | ||||||||||||||||||
| KEGG | ana:all2453. | ||||||||||||||||||
| PATRIC | 22775100. VBINosSp37423_3016. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CMR | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| eggNOG | COG0723. | ||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000255192. | ||||||||||||||||||
| KO | K02636. | ||||||||||||||||||
| OMA | GDPTYIV. | ||||||||||||||||||
| ProtClustDB | PRK13474. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| Gene3D | 2.102.10.10. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| HAMAP | MF_01335. Cytb6_f_Rieske. | ||||||||||||||||||
| InterPro | IPR014909. Cyt_b6-f_cplx_Fe-S_su. IPR023960. Cyt_b6_f_Rieske. IPR017941. Rieske_2Fe-2S. IPR014349. Rieske_Fe-S_prot. IPR005805. Rieske_Fe-S_prot_C. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR10134. PTHR10134. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF08802. CytB6-F_Fe-S. 1 hit. PF00355. Rieske. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00162. RIESKE. | ||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF50022. Rieske_dom. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS51296. RIESKE. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q93SX0. | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | UCRIA_NOSS1 | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q93SX0 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
