Q93092 (TALDO_MOUSE) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
November 16, 2011.
Version 108.
History...
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize order
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Transaldolase EC=2.2.1.2 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Mus musculus (Mouse) | ||||
| Taxonomic identifier | 10090 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Glires › Rodentia › Sciurognathi › Muroidea › Muridae › Murinae › Mus › Mus |
Protein attributes
| Sequence length | 337 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Transaldolase is important for the balance of metabolites in the pentose-phosphate pathway By similarity. |
| Catalytic activity | Sedoheptulose 7-phosphate + D-glyceraldehyde 3-phosphate = D-erythrose 4-phosphate + D-fructose 6-phosphate. |
| Pathway | |
| Subcellular location | Cytoplasm Probable. |
| Sequence similarities | Belongs to the transaldolase family. Type 1 subfamily. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Pentose shunt |
| Cellular component | Cytoplasm |
| Molecular function | Transferase |
| PTM | Acetylation Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Molecular function | sedoheptulose-7-phosphate:D-glyceraldehyde-3-phosphate glyceronetransferase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 337 | 337 | Transaldolase | PRO_0000173565 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 142 | 1 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 4 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 219 | 1 | N6-acetyllysine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 237 | 1 | Phosphoserine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 269 | 1 | N6-acetyllysine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 286 | 1 | N6-acetyllysine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 321 | 1 | N6-acetyllysine By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 14 – 18 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 19 – 21 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 22 – 27 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 31 – 33 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 35 – 37 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 40 – 43 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 46 – 53 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 56 – 58 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 59 – 72 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 76 – 96 | 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 103 – 106 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 109 – 111 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 115 – 131 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 136 – 138 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 139 – 144 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 147 – 160 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 164 – 169 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 172 – 181 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 184 – 190 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 191 – 200 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 208 – 210 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 212 – 226 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 232 – 236 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 241 – 245 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 246 – 249 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 250 – 255 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 257 – 265 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 276 – 279 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 291 – 299 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 302 – 330 | 29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Cloning and chromosomal localization of a paralog and a mouse homolog of the human transaldolase gene." Kusuda J., Hirai M., Toyoda A., Tanuma R., Nomura-Kitabayashi A., Hashimoto K. Gene 209:13-21(1998) [PubMed: 9524206] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA]. Tissue: Brain. |
| [2] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed: 15489334] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Strain: FVB/N and FVB/N-3. Tissue: Mammary gland. |
| [3] | Lubec G., Klug S., Yang J.W., Zigmond M., Sunyer B., Chen W.-Q. Submitted (JAN-2009) to UniProtKB Cited for: PROTEIN SEQUENCE OF 87-97 AND 259-265, MASS SPECTROMETRY. Strain: OF1. Tissue: Brain and Hippocampus. |
| [4] | "Crystal structure of mouse transaldolase." RIKEN structural genomics initiative (RSGI) Submitted (DEC-2005) to the PDB data bank Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.1 ANGSTROMS) OF 13-337. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | U67611 mRNA. Translation: AAB83955.1. U63158 mRNA. Translation: AAB08722.1. Sequence problems. U63159 mRNA. Translation: AAB08723.1. Sequence problems. BC004754 mRNA. Translation: AAH04754.1. BC094277 mRNA. Translation: AAH94277.1. | ||||||||||||||||||
| IPI | IPI00124692. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_035658.1. NM_011528.4. | ||||||||||||||||||
| UniGene | Mm.29182. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q93092. | ||||||||||||||||||
| SMR | Q93092. Positions 11-331. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| IntAct | Q93092. 1 interaction. | ||||||||||||||||||
| STRING | Q93092. | ||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q93092. | ||||||||||||||||||
2D gel databases | |||||||||||||||||||
| REPRODUCTION-2DPAGE | IPI00124692. Q93092. | ||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||
| PRIDE | Q93092. | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSMUST00000026576; ENSMUSP00000026576; ENSMUSG00000025503. | ||||||||||||||||||
| GeneID | 21351. | ||||||||||||||||||
| KEGG | mmu:21351. | ||||||||||||||||||
| UCSC | uc009kkv.2. mouse. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CTD | 6888. | ||||||||||||||||||
| MGI | MGI:1274789. Taldo1. | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| eggNOG | roNOG07008. | ||||||||||||||||||
| GeneTree | ENSGT00390000017361. | ||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG286747. | ||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG054014. | ||||||||||||||||||
| InParanoid | Q93092. | ||||||||||||||||||
| OMA | DTGDFHA. | ||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4GQQ5B. | ||||||||||||||||||
| PhylomeDB | Q93092. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q93092. | ||||||||||||||||||
| Bgee | Q93092. | ||||||||||||||||||
| CleanEx | MM_TALDO1. | ||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q93092. | ||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSMUSG00000025503. Mus musculus. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR013785. Aldolase_TIM. IPR001585. Transaldolase. IPR004730. Transaldolase_1. IPR018225. Transaldolase_AS. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.20.20.70. Aldolase_TIM. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| KO | K00616. | ||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR10683. Transaldolase. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00923. Transaldolase. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00874. TalAB. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS01054. TRANSALDOLASE_1. 1 hit. PS00958. TRANSALDOLASE_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||
| NextBio | 300544. | ||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | TALDO_MOUSE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q93092 Secondary accession number(s): P70358, P70703, Q52KM4 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| MGD cross-references Mouse Genome Database (MGD) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with