Q8Y8D7 (PPNK1_LISMO) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
January 25, 2012.
Version 57.
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| Protein names | Recommended name: Probable inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase 1 Short name=Poly(P)/ATP NAD kinase 1 EC=2.7.1.23 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Listeria monocytogenes | ||||
| Taxonomic identifier | 1639 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Firmicutes › Bacillales › Listeriaceae › Listeria |
Protein attributes
| Sequence length | 264 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes the phosphorylation of NAD to NADP. Utilizes ATP and other nucleoside triphosphates as well as inorganic polyphosphate as a source of phosphorus By similarity. HAMAP MF_00361 |
| Catalytic activity | ATP + NAD+ = ADP + NADP+. HAMAP MF_00361 |
| Cofactor | Divalent metal ions By similarity. HAMAP MF_00361 |
| Subcellular location | Cytoplasm By similarity HAMAP MF_00361. |
| Sequence similarities | Belongs to the NAD kinase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cytoplasm |
| Ligand | ATP-binding NAD NADP Nucleotide-binding |
| Molecular function | Kinase Transferase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Cellular component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | ATP binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW NAD+ kinase activityInferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 264 | 264 | Probable inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase 1 HAMAP MF_00361 | PRO_0000120632 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2 – 7 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 11 – 21 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 33 – 35 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 37 – 42 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 48 – 54 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 56 – 58 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 59 – 61 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 63 – 65 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 80 – 82 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 83 – 91 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 96 – 108 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 115 – 128 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 135 – 139 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 142 – 147 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 153 – 155 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 163 – 166 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 178 – 182 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 189 – 191 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 199 – 202 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 207 – 213 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 217 – 221 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 224 – 228 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 232 – 247 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 253 – 261 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Comparative genomics of Listeria species." Glaser P., Frangeul L., Buchrieser C., Rusniok C., Amend A., Baquero F., Berche P., Bloecker H., Brandt P., Chakraborty T., Charbit A., Chetouani F., Couve E., de Daruvar A., Dehoux P., Domann E., Dominguez-Bernal G., Duchaud E. Cossart P.Science 294:849-852(2001) [PubMed: 11679669] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC BAA-679 / EGD-e / Serovar 1/2a. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AL591977 Genomic DNA. Translation: CAC99046.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | AH1195. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_464493.1. NC_003210.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q8Y8D7. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | Q8Y8D7. Positions 1-264. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 986453. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus lmo0968 in contig AL591824_GR. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | lmo:lmo0968. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PATRIC | 20311034. VBILisMon69206_0995. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenoList | LMO0968. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG314020. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | TISFANC. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtClustDB | PRK04885. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc | LMON169963:LMO0968-MONOMER. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HAMAP | MF_00361. NAD_kinase. [Tree] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR016064. ATP-NAD_kinase_PpnK-typ. IPR017438. ATP-NAD_kinase_PpnK-typ_a/b. IPR017437. ATP-NAD_kinase_PpnK-typ_all-b. IPR002504. polyP/ATP_NADK_prd. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:2.60.200.30. ATP-NAD_kinase_PpnK-typ. 1 hit. G3DSA:3.40.50.10330. ATP-NAD_kinase_PpnK-typ_a/b. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K00858. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR20275. ATP_NADK. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF01513. NAD_kinase. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF111331. ATP-NAD_kinase_PpnK-typ. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | PPNK1_LISMO | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q8Y8D7 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with