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UniProtKB/Swiss-Prot Q8U192 (THIE_PYRFU)
Last modified
February 9, 2010.
Version 56.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (3) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Thiamine-phosphate pyrophosphorylase Short name=TMP pyrophosphorylase Short name=TMP-PPase EC=2.5.1.3 Alternative name(s): Thiamine-phosphate synthase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Pyrococcus furiosus [Complete proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 2261 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Archaea › Euryarchaeota › Thermococci › Thermococcales › Thermococcaceae › Pyrococcus |
Protein attributes
| Sequence length | 207 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Condenses 4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate (THZ-P) and 2-methyl-4-amino-5-hydroxymethyl pyrimidine pyrophosphate (HMP-PP) to form thiamine monophosphate (TMP) By similarity. HAMAP MF_00097 |
| Catalytic activity | 2-methyl-4-amino-5-hydroxymethylpyrimidine diphosphate + 4-methyl-5-(2-phosphono-oxyethyl)thiazole = diphosphate + thiamine phosphate. HAMAP MF_00097 |
| Cofactor | Binds 1 magnesium ion per subunit By similarity. HAMAP MF_00097 |
| Pathway | Cofactor biosynthesis; thiamine diphosphate biosynthesis; thiamine phosphate from 4-amino-2-methyl-5-diphosphomethylpyrimidine and 4-methyl-5-(2-phosphoethyl)-thiazole: step 1/1. HAMAP MF_00097 |
| Sequence similarities | Belongs to the TMP-PPase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Thiamine biosynthesis |
| Ligand | Magnesium Metal-binding |
| Molecular function | Transferase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | thiamin biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: HAMAP |
| Molecular function | magnesium ion binding Inferred from electronic annotation. Source: HAMAP thiamin-phosphate diphosphorylase activityInferred from electronic annotation. Source: HAMAP |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 207 | 207 | Thiamine-phosphate pyrophosphorylase HAMAP MF_00097 | PRO_0000157074 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 69 | 1 | Magnesium By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 88 | 1 | Magnesium By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 3 – 6 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 8 – 12 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 15 – 17 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 20 – 29 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 33 – 37 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 44 – 60 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 64 – 69 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 71 – 77 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 80 – 84 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 91 – 97 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 101 – 109 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 110 – 119 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 122 – 127 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 142 – 152 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 157 – 162 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 165 – 167 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 168 – 172 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 173 – 175 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 177 – 182 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 183 – 186 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 188 – 190 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 191 – 206 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "The complete sequence of the Pyrococcus furiosus genome." Weiss R.B., Dunn D.M., Robb F.T., Brown J.R. Submitted (FEB-2002) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 43587 / DSM 3638 / JCM 8422 / Vc1. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AE009950 Genomic DNA. Translation: AAL81458.1. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_579063.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| GeneID | 1469209. | ||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus PF1334 in contig AE009950_GR. | ||||||||||||
| KEGG | pfu:PF1334. | ||||||||||||
| NMPDR | fig|186497.1.peg.1380. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CMR | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| HOGENOM | HBG754477. | ||||||||||||
| OMA | IMGSNNC. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BRENDA | 2.5.1.3. 321. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| HAMAP | MF_00097. TMP-PPase. [Tree] | ||||||||||||
| InterPro | IPR013785. Aldolase_TIM. IPR003733. TMP_synthase. [Graphical view] | ||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.20.20.70. Aldolase_TIM. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF02581. TMP-TENI. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00693. thiE. 1 hit. | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | THIE_PYRFU | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q8U192 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HAMAP (High-quality Automated and Manual Annotation of microbial Proteomes) | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


