Q8U192 (THIE_PYRFU) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
January 25, 2012.
Version 67.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Thiamine-phosphate synthase Short name=TP synthase Short name=TPS EC=2.5.1.3 Alternative name(s): Thiamine-phosphate pyrophosphorylase Short name=TMP pyrophosphorylase Short name=TMP-PPase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Pyrococcus furiosus (strain ATCC 43587 / DSM 3638 / JCM 8422 / Vc1) | ||||
| Taxonomic identifier | 186497 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Archaea › Euryarchaeota › Thermococci › Thermococcales › Thermococcaceae › Pyrococcus |
Protein attributes
| Sequence length | 207 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Condenses 4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate (THZ-P) and 2-methyl-4-amino-5-hydroxymethyl pyrimidine pyrophosphate (HMP-PP) to form thiamine monophosphate (TMP) By similarity. HAMAP MF_00097 |
| Catalytic activity | 2-methyl-4-amino-5-hydroxymethylpyrimidine diphosphate + 4-methyl-5-(2-phosphono-oxyethyl)thiazole = diphosphate + thiamine phosphate. HAMAP MF_00097 |
| Cofactor | Binds 1 magnesium ion per subunit By similarity. HAMAP MF_00097 |
| Pathway | Cofactor biosynthesis; thiamine diphosphate biosynthesis; thiamine phosphate from 4-amino-2-methyl-5-diphosphomethylpyrimidine and 4-methyl-5-(2-phosphoethyl)-thiazole: step 1/1. HAMAP MF_00097 |
| Sequence similarities | Belongs to the thiamine-phosphate synthase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Thiamine biosynthesis |
| Ligand | Magnesium Metal-binding |
| Molecular function | Transferase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | thiamine biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular function | metal ion binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW thiamine-phosphate diphosphorylase activityInferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 207 | 207 | Thiamine-phosphate synthase | PRO_0000157074 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 36 – 40 | 5 | HMP-PP binding By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 132 – 134 | 3 | THZ-P binding By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 182 – 183 | 2 | THZ-P binding By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 69 | 1 | Magnesium By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 88 | 1 | Magnesium By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 68 | 1 | HMP-PP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 106 | 1 | HMP-PP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 135 | 1 | HMP-PP By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 162 | 1 | THZ-P; via amide nitrogen By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 3 – 6 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 8 – 12 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 15 – 17 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 20 – 29 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 33 – 37 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 44 – 60 | 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 64 – 69 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 71 – 77 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 80 – 84 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 91 – 97 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 101 – 109 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 110 – 119 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 122 – 127 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 142 – 152 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 157 – 162 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 165 – 167 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 168 – 172 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 173 – 175 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 177 – 182 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 183 – 186 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 188 – 190 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 191 – 206 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Divergence of the hyperthermophilic archaea Pyrococcus furiosus and P. horikoshii inferred from complete genomic sequences." Maeder D.L., Weiss R.B., Dunn D.M., Cherry J.L., Gonzalez J.M., DiRuggiero J., Robb F.T. Genetics 152:1299-1305(1999) [PubMed: 10430560] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 43587 / DSM 3638 / JCM 8422 / Vc1. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AE009950 Genomic DNA. Translation: AAL81458.1. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_579063.1. NC_003413.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q8U192. | ||||||||||||
| SMR | Q8U192. Positions 2-207. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| EnsemblBacteria | EBPYRT00000004326; EBPYRP00000004187; EBPYRG00000004326. | ||||||||||||
| GeneID | 1469209. | ||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus PF1334 in contig AE009950_GR. | ||||||||||||
| KEGG | pfu:PF1334. | ||||||||||||
| NMPDR | fig|186497.1.peg.1380. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| GeneTree | EBGT00050000022349. | ||||||||||||
| HOGENOM | HBG754477. | ||||||||||||
| OMA | VSAICHA. | ||||||||||||
| PhylomeDB | Q8U192. | ||||||||||||
| ProtClustDB | PRK00043. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| HAMAP | MF_00097. TMP_synthase. [Tree] | ||||||||||||
| InterPro | IPR013785. Aldolase_TIM. IPR022998. ThiaminP_synth_SF. IPR003733. TMP_synthase. [Graphical view] | ||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.20.20.70. Aldolase_TIM. 1 hit. | ||||||||||||
| KO | K00788. | ||||||||||||
| Pfam | PF02581. TMP-TENI. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| SUPFAM | SSF51391. TMP_synthase. 1 hit. | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00693. ThiE. 1 hit. | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | THIE_PYRFU | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q8U192 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with