Q8TDY4 (ASAP3_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Arf-GAP with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 3 Alternative name(s): Development and differentiation-enhancing factor-like 1 Protein up-regulated in liver cancer 1 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 903 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Promotes cell proliferation. Ref.1 |
| Subcellular location | |
| Tissue specificity | Highly expressed in primary hepatocarcinoma. Detected in lung, liver and blood leukocytes. Ref.1 |
| Sequence similarities | Contains 2 ANK repeats. Contains 1 Arf-GAP domain. Contains 1 PH domain. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cytoplasm |
| Coding sequence diversity | Alternative splicing Polymorphism |
| Domain | ANK repeat Coiled coil Repeat Zinc-finger |
| Ligand | Metal-binding Zinc |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | regulation of ARF GTPase activity Inferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Cellular_component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular_function | ARF GTPase activator activity Inferred from electronic annotation. Source: InterPro phospholipid bindingInferred from electronic annotation. Source: InterPro zinc ion bindingInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Alternative products
| This entry describes 3 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: Q8TDY4-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: Q8TDY4-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-496: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. | ||||||
| Isoform 3 (identifier: Q8TDY4-3) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 142-158: DSKKQLEKAWKDYEAKM → ASLSLGSR | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 903 | 903 | Arf-GAP with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 3 | PRO_0000232887 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 302 – 394 | 93 | PH | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 426 – 551 | 126 | Arf-GAP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 585 – 617 | 33 | ANK 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 621 – 650 | 30 | ANK 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Zinc finger | 441 – 464 | 24 | C4-type | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coiled coil | 141 – 172 | 32 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coiled coil | 248 – 275 | 28 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 798 – 801 | 4 | Poly-Ser | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 496 | 496 | Missing in isoform 2. | VSP_018013 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 142 – 158 | 17 | DSKKQ…YEAKM → ASLSLGSR in isoform 3. | VSP_039827 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 377 | 1 | E → A. Corresponds to variant rs16828486 [ dbSNP | Ensembl ]. | VAR_048295 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 617 | 1 | A → T in a colorectal cancer sample; somatic mutation. Ref.7 | VAR_035612 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 319 | 1 | V → A in AAH60786. Ref.5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 521 | 1 | E → G in BAA91008. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 596 | 1 | V → D in BAA91008. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 802 | 1 | L → V in BAA91008. Ref.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 424 – 433 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 436 – 439 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 442 – 444 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 451 – 453 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 454 – 456 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 462 – 471 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 473 – 475 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 478 – 480 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 481 – 483 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 488 – 496 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 499 – 506 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 507 – 509 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 512 – 514 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 524 – 535 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 548 – 556 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 560 – 568 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 573 – 575 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 580 – 582 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 589 – 595 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 599 – 601 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 602 – 611 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 620 – 622 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 625 – 631 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 635 – 643 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 658 – 665 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 668 – 680 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Isolation of development and differentiation enhancing factor-like 1 (DDEFL1) as a drug target for hepatocellular carcinomas." Okabe H., Furukawa Y., Kato T., Hasegawa S., Yamaoka Y., Nakamura Y. Int. J. Oncol. 24:43-48(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA] (ISOFORM 1), FUNCTION, SUBCELLULAR LOCATION, TISSUE SPECIFICITY. Tissue: Liver. |
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| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AB056749 mRNA. Translation: BAB85677.1. AK000206 mRNA. Translation: BAA91008.1. AK092291 mRNA. Translation: BAG52522.1. AK295100 mRNA. Translation: BAG58136.1. AL021154, AL357134 Genomic DNA. Translation: CAI19596.1. AL357134, AL021154 Genomic DNA. Translation: CAI22177.1. CH471134 Genomic DNA. Translation: EAW95050.1. BC052305 mRNA. Translation: AAH52305.1. BC060786 mRNA. Translation: AAH60786.1. | ||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00152667. IPI00744916. IPI00970963. | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001137250.1. NM_001143778.1. NP_060177.2. NM_017707.3. | ||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.437379. | ||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q8TDY4. | ||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q8TDY4. 1 interaction. | ||||||||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000338769. | ||||||||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q8TDY4. | ||||||||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||||||||
| DMDM | 74751433. | ||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| PaxDb | Q8TDY4. | ||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | Q8TDY4. | ||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q8TDY4. | ||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000336689; ENSP00000338769; ENSG00000088280. ENST00000437606; ENSP00000408826; ENSG00000088280. ENST00000495646; ENSP00000436150; ENSG00000088280. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 55616. | ||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:55616. | ||||||||||||||||||||||||
| UCSC | uc001bgy.1. human. uc001bha.2. human. uc010oea.1. human. | ||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||
| CTD | 55616. | ||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC01M023755. | ||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0000247. | ||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:14987. ASAP3. | ||||||||||||||||||||||||
| HPA | HPA020537. HPA020546. | ||||||||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_Q8TDY4. | ||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA164716179. | ||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG5347. | ||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000230570. | ||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG051327. | ||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | Q8TDY4. | ||||||||||||||||||||||||
| KO | K12488. | ||||||||||||||||||||||||
| OMA | VAKYVEH. | ||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4G7BXT. | ||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | Q8TDY4. | ||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q8TDY4. | ||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q8TDY4. | ||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_ASAP3. | ||||||||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q8TDY4. | ||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000088280. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | 1.20.1270.60. 1 hit. 1.25.40.20. 1 hit. 2.30.29.30. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR027267. AH/BAR-dom. IPR002110. Ankyrin_rpt. IPR020683. Ankyrin_rpt-contain_dom. IPR001164. ArfGAP. IPR011993. PH_like_dom. IPR001849. Pleckstrin_homology. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF12796. Ank_2. 1 hit. PF01412. ArfGap. 1 hit. PF00169. PH. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00405. REVINTRACTNG. | ||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00248. ANK. 2 hits. SM00105. ArfGap. 1 hit. SM00233. PH. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF48403. ANK. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50297. ANK_REP_REGION. 1 hit. PS50088. ANK_REPEAT. 1 hit. PS50115. ARFGAP. 1 hit. PS50003. PH_DOMAIN. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||
| ChiTaRS | ASAP3. human. | ||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q8TDY4. | ||||||||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 55616. | ||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 60208. | ||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | ASAP3_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q8TDY4 Secondary accession number(s): B3KRW0 Q9NXK2 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 1 Human chromosome 1: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

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