Q8NWQ6 (EBH_STAAW) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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January 25, 2012.
Version 61.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Extracellular matrix-binding protein ebh Alternative name(s): ECM-binding protein homolog | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Staphylococcus aureus (strain MW2) [Complete proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 196620 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Firmicutes › Bacillales › Staphylococcus |
Protein attributes
| Sequence length | 9904 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Subcellular location | Cell membrane; Single-pass membrane protein Potential. |
| Sequence similarities | Contains 53 FIVAR domains. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cell membrane Membrane |
| Domain | Repeat Signal Transmembrane Transmembrane helix |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | pathogenesis Inferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Cellular component | integral to membrane Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW plasma membraneInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 39 | 39 | Potential | ||||||||||||||||||||||
| Chain | 40 – 9904 | 9865 | Extracellular matrix-binding protein ebh | PRO_0000345982 | |||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 9710 – 9730 | 21 | Helical; Potential | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 2524 – 2580 | 57 | FIVAR 1 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 2610 – 2666 | 57 | FIVAR 2 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 2687 – 2750 | 64 | FIVAR 3 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 2780 – 2836 | 57 | FIVAR 4 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 2864 – 2919 | 56 | FIVAR 5 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 2947 – 3002 | 56 | FIVAR 6 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 3030 – 3085 | 56 | FIVAR 7 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 3154 – 3212 | 59 | FIVAR 8 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 3280 – 3339 | 60 | FIVAR 9 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 3407 – 3465 | 59 | FIVAR 10 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 3533 – 3591 | 59 | FIVAR 11 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 3659 – 3717 | 59 | FIVAR 12 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 3785 – 3843 | 59 | FIVAR 13 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 3911 – 3969 | 59 | FIVAR 14 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 4037 – 4095 | 59 | FIVAR 15 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 4160 – 4208 | 49 | FIVAR 16 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 4276 – 4334 | 59 | FIVAR 17 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 4402 – 4460 | 59 | FIVAR 18 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 4528 – 4586 | 59 | FIVAR 19 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 4654 – 4712 | 59 | FIVAR 20 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 4780 – 4838 | 59 | FIVAR 21 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 4906 – 4964 | 59 | FIVAR 22 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 5032 – 5090 | 59 | FIVAR 23 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 5158 – 5216 | 59 | FIVAR 24 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 5284 – 5342 | 59 | FIVAR 25 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 5410 – 5468 | 59 | FIVAR 26 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 5536 – 5593 | 58 | FIVAR 27 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 5661 – 5719 | 59 | FIVAR 28 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 5787 – 5845 | 59 | FIVAR 29 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 5913 – 5971 | 59 | FIVAR 30 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 6039 – 6097 | 59 | FIVAR 31 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 6175 – 6223 | 49 | FIVAR 32 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 6291 – 6349 | 59 | FIVAR 33 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 6417 – 6475 | 59 | FIVAR 34 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 6543 – 6601 | 59 | FIVAR 35 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 6669 – 6727 | 59 | FIVAR 36 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 6795 – 6853 | 59 | FIVAR 37 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 6921 – 6979 | 59 | FIVAR 38 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 7047 – 7105 | 59 | FIVAR 39 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 7173 – 7231 | 59 | FIVAR 40 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 7299 – 7357 | 59 | FIVAR 41 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 7425 – 7486 | 62 | FIVAR 42 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 7551 – 7609 | 59 | FIVAR 43 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 7677 – 7735 | 59 | FIVAR 44 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 7803 – 7860 | 58 | FIVAR 45 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 7928 – 7986 | 59 | FIVAR 46 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 8054 – 8112 | 59 | FIVAR 47 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 8180 – 8238 | 59 | FIVAR 48 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 8306 – 8364 | 59 | FIVAR 49 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 8432 – 8490 | 59 | FIVAR 50 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 8558 – 8612 | 55 | FIVAR 51 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 8680 – 8739 | 60 | FIVAR 52 | ||||||||||||||||||||||
| Domain | 8934 – 8990 | 57 | FIVAR 53 | ||||||||||||||||||||||
| Compositional bias | 9867 – 9904 | 38 | Lys-rich | ||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||
| Helix | 3912 – 3920 | 9 | |||||||||||||||||||||||
| Helix | 3922 – 3926 | 5 | |||||||||||||||||||||||
| Helix | 3929 – 3932 | 4 | |||||||||||||||||||||||
| Helix | 3936 – 3953 | 18 | |||||||||||||||||||||||
| Helix | 3963 – 3979 | 17 | |||||||||||||||||||||||
| Helix | 3982 – 3998 | 17 | |||||||||||||||||||||||
| Helix | 4005 – 4016 | 12 | |||||||||||||||||||||||
| Helix | 4021 – 4035 | 15 | |||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Genome and virulence determinants of high virulence community-acquired MRSA." Baba T., Takeuchi F., Kuroda M., Yuzawa H., Aoki K., Oguchi A., Nagai Y., Iwama N., Asano K., Naimi T., Kuroda H., Cui L., Yamamoto K., Hiramatsu K. Lancet 359:1819-1827(2002) [PubMed: 12044378] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: MW2. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | BA000033 Genomic DNA. Translation: BAB95189.1. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_646141.1. NC_003923.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q8NWQ6. | ||||||||||||
| SMR | Q8NWQ6. Positions 3912-4271, 4654-4897. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| STRING | Q8NWQ6. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| EnsemblBacteria | EBSTAT00000027145; EBSTAP00000026184; EBSTAG00000027144. | ||||||||||||
| GeneID | 1003436. | ||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus MW1324 in contig BA000033_GR. | ||||||||||||
| KEGG | sam:MW1324. | ||||||||||||
| PATRIC | 19569252. VBIStaAur44266_1387. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CMR | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | NOG114574. | ||||||||||||
| GeneTree | EBGT00050000023685. | ||||||||||||
| HOGENOM | HBG693128. | ||||||||||||
| OMA | NQDSGDD. | ||||||||||||
| PhylomeDB | Q8NWQ6. | ||||||||||||
| ProtClustDB | CLSK903880. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | SAUR196620:MW1324-MONOMER. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR011439. DUF1542. IPR011490. Extracell_matric-bd_Ebh. IPR020840. Extracell_matrix-bd_GA. IPR002988. G-related_albumin-bd. IPR005877. Gpos_YSIRK. IPR009063. Ig/albumin-bd. [Graphical view] | ||||||||||||
| Pfam | PF07564. DUF1542. 7 hits. PF07554. FIVAR. 53 hits. PF01468. GA. 47 hits. PF04650. YSIRK_signal. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| SMART | SM00844. GA. 48 hits. [Graphical view] | ||||||||||||
| SUPFAM | SSF46997. Bac_Ig/alb_bind. 94 hits. | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01168. YSIRK_signal. 1 hit. | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | EBH_STAAW | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q8NWQ6 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with