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UniProtKB/Swiss-Prot Q8N1Q1 (CAH13_HUMAN)
Last modified
June 16, 2009.
Version 57.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (4) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Carbonic anhydrase 13 EC=4.2.1.1 Alternative name(s): Carbonic anhydrase XIII Short name=CA-XIII Carbonate dehydratase XIII | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 262 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Reversible hydration of carbon dioxide. |
| Catalytic activity | H2CO3 = CO2 + H2O. |
| Cofactor | Zinc By similarity. |
| Tissue specificity | Expressed in thymus, small intestine, spleen, prostate, ovary, colon and testis. Ref.3 |
| Sequence similarities | Belongs to the alpha-carbonic anhydrase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Ligand | Metal-binding Zinc |
| Molecular function | Lyase |
| Technical term | 3D-structure |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | one-carbon compound metabolic process Inferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Molecular function | carbonate dehydratase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC zinc ion bindingInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 262 | 262 | Carbonic anhydrase 13 | PRO_0000077440 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 95 | 1 | Zinc; catalytic By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 97 | 1 | Zinc; catalytic By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 120 | 1 | Zinc; catalytic By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 10 – 12 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 14 – 17 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 18 – 20 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 22 – 25 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 26 – 28 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 36 – 38 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 48 – 51 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 54 – 56 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 57 – 62 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 64 – 71 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 74 – 82 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 89 – 98 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 107 – 110 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 116 – 125 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 126 – 128 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 132 – 135 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 141 – 151 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 156 – 158 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 159 – 162 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 163 – 168 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 174 – 176 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 182 – 185 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 192 – 197 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 208 – 215 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 217 – 219 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 221 – 228 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 230 – 234 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AK095314 mRNA. Translation: BAC04528.1. BC052602 mRNA. Translation: AAH52602.1. | |||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00394767. | ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_940986.1. | ||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.127189 | ||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||
2-D gel databases | |||||||||||||||||||||||||
| OGP | Q8N1Q1. | ||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | Q8N1Q1. | ||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q8N1Q1. | ||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSG00000185015. Homo sapiens. [Contig view] | ||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 377677. | ||||||||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:377677. | ||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||
| GeneCards | GC08P086345. | ||||||||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0007627. | ||||||||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:14914. CA13. | ||||||||||||||||||||||||
| MIM | 611436. gene. | ||||||||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA134925234. | ||||||||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | Q8N1Q1. | ||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | Q8N1Q1. | ||||||||||||||||||||||||
| OMA | Q8N1Q1. MSRLSWG. | ||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||
| BRENDA | 4.2.1.1. 247. | ||||||||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q8N1Q1. | ||||||||||||||||||||||||
| Bgee | Q8N1Q1. | ||||||||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_CA13. | ||||||||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000185015. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR001148. Carbonic_anhydrase_a-class_cat. IPR018338. Carbonic_anhydrase_a-class_CS. IPR018443. Carbonic_anhydrase_CA13. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.10.200.10. Euk_COanhd. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR18952:SF31. Carbonic_anhydrase_CA13. 1 hit. PTHR18952. Euk_COanhd. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00194. Carb_anhydrase. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| ProDom | PD000865. Euk_COanhd. 1 hit. [Graphical view] [Entries sharing at least one domain] | ||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00162. ALPHA_CA_1. 1 hit. PS51144. ALPHA_CA_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||||||||
| NextBio | 100682. | ||||||||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | CAH13_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q8N1Q1 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 8 Human chromosome 8: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


