Q8K2I1 (FNTB_MOUSE) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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April 3, 2013.
Version 83.
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| Protein names | Recommended name: Protein farnesyltransferase subunit beta Short name=FTase-beta EC=2.5.1.58 Alternative name(s): CAAX farnesyltransferase subunit beta Ras proteins prenyltransferase subunit beta | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Mus musculus (Mouse) [Reference proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 10090 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Glires › Rodentia › Sciurognathi › Muroidea › Muridae › Murinae › Mus › Mus![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 437 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes the transfer of a farnesyl moiety from farnesyl pyrophosphate to a cysteine at the fourth position from the C-terminus of several proteins. The beta subunit is responsible for peptide-binding By similarity. |
| Catalytic activity | Farnesyl diphosphate + protein-cysteine = S-farnesyl protein + diphosphate. |
| Cofactor | Binds 1 zinc ion per subunit By similarity. |
| Subunit structure | Heterodimer of an alpha and a beta subunit By similarity. |
| Sequence similarities | Belongs to the protein prenyltransferase subunit beta family. Contains 5 PFTB repeats. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 437 | 437 | Protein farnesyltransferase subunit beta | PRO_0000119762 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 123 – 164 | 42 | PFTB 1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 174 – 215 | 42 | PFTB 2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 222 – 263 | 42 | PFTB 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 270 – 312 | 43 | PFTB 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repeat | 332 – 374 | 43 | PFTB 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 297 | 1 | Zinc By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 299 | 1 | Zinc By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 362 | 1 | Zinc By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 24 – 26 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 28 – 33 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 43 – 65 | 23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 75 – 85 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 91 – 96 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 100 – 113 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 120 – 133 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 138 – 143 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 150 – 163 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 166 – 171 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 174 – 184 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 191 – 194 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 201 – 214 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 219 – 224 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 225 – 232 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 237 – 239 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 249 – 262 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 265 – 267 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 270 – 279 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 283 – 285 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 286 – 291 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 300 – 303 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 305 – 307 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 308 – 317 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 332 – 342 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 360 – 374 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 390 – 392 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 399 – 401 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 405 – 416 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)." The MGC Project Team Genome Res. 14:2121-2127(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Strain: 129. Tissue: Mammary tumor. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | BC031417 mRNA. Translation: AAH31417.1. | ||||||||||||
| IPI | IPI00169914. | ||||||||||||
| RefSeq | NP_666039.1. NM_145927.2. | ||||||||||||
| UniGene | Mm.151174. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q8K2I1. | ||||||||||||
| SMR | Q8K2I1. Positions 17-423. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||
| PhosphoSite | Q8K2I1. | ||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||
| PRIDE | Q8K2I1. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| Ensembl | ENSMUST00000041008; ENSMUSP00000035498; ENSMUSG00000033373. | ||||||||||||
| GeneID | 110606. | ||||||||||||
| KEGG | mmu:110606. | ||||||||||||
| UCSC | uc007nyu.1. mouse. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CTD | 2342. | ||||||||||||
| MGI | MGI:1861305. Fntb. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| GeneTree | ENSGT00550000075042. | ||||||||||||
| HOGENOM | HOG000190594. | ||||||||||||
| HOVERGEN | HBG008173. | ||||||||||||
| InParanoid | Q8K2I1. | ||||||||||||
| KO | K05954. | ||||||||||||
| OMA | HPVYNIC. | ||||||||||||
| OrthoDB | EOG4KKZ33. | ||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||
| ArrayExpress | Q8K2I1. | ||||||||||||
| Bgee | Q8K2I1. | ||||||||||||
| CleanEx | MM_FNTB. | ||||||||||||
| Genevestigator | Q8K2I1. | ||||||||||||
| GermOnline | ENSMUSG00000033373. Mus musculus. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR026872. FTB. IPR001330. Prenyltrans. IPR008930. Terpenoid_cyclase/PrenylTrfase. [Graphical view] | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR11774:SF6. PTHR11774:SF6. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF00432. Prenyltrans. 2 hits. [Graphical view] | ||||||||||||
| SUPFAM | SSF48239. Terp_cyc_toroid. 1 hit. | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other | |||||||||||||
| BindingDB | Q8K2I1. | ||||||||||||
| ChEMBL | CHEMBL2631. | ||||||||||||
| ChiTaRS | FNTB. mouse. | ||||||||||||
| NextBio | 364317. | ||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | FNTB_MOUSE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q8K2I1 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| MGD cross-references Mouse Genome Database (MGD) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
