Q8IX04 (UEVLD_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 3 Short name=UEV-3 Alternative name(s): EV and lactate/malate dehydrogenase domain-containing protein | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 471 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Possible negative regulator of polyubiquitination. Ref.1 |
| Subunit structure | Homodimer. |
| Tissue specificity | Colon, colon carcinoma cell lines, normal cervical epithelium, carcinomas of the uterine cervix and peripheral blood leukocytes. Ref.1 |
| Sequence similarities | In the N-terminal section; belongs to the ubiquitin-conjugating enzyme family. UEV subfamily. In the C-terminal section; belongs to the LDH/MDH superfamily. Contains 1 UEV (ubiquitin E2 variant) domain. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Ubl conjugation pathway |
| Coding sequence diversity | Alternative splicing |
| Ligand | NAD |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | cellular carbohydrate metabolic process Inferred from electronic annotation. Source: InterPro cellular protein modification processInferred from electronic annotation. Source: InterPro protein transportInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Molecular_function | nucleotide binding Inferred from electronic annotation. Source: InterPro oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptorInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Alternative products
| This entry describes 7 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 Ref.3 (identifier: Q8IX04-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 Ref.1 (identifier: Q8IX04-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 376-379: AMEL → DIMI 380-471: Missing. | ||||||
| Isoform 3 Ref.6 (identifier: Q8IX04-3) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 43-64: Missing. 376-379: AMEL → DIMI 380-471: Missing. | ||||||
| Isoform 4 (identifier: Q8IX04-4) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-38: Missing. 376-379: AMEL → DIMI 380-471: Missing. | ||||||
| Isoform 5 (identifier: Q8IX04-5) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 205-215: GIADRLVLLDL → VESRSVTQAGV 216-471: Missing. | ||||||
| Isoform 6 (identifier: Q8IX04-6) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 43-64: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. | ||||||
| Isoform 7 (identifier: Q8IX04-7) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 65-164: Missing. 239-295: Missing. 354-470: VLTWSGQEEV...SIHSLQQQLK → GI | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 471 | 471 | Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 3 | PRO_0000278651 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 2 – 145 | 144 | UEV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 191 – 219 | 29 | NAD By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 38 | 38 | Missing in isoform 4. | VSP_023346 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 43 – 64 | 22 | Missing in isoform 3 and isoform 6. Ref.6 | VSP_023347 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 65 – 164 | 100 | Missing in isoform 7. | VSP_045986 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 205 – 215 | 11 | GIADRLVLLDL → VESRSVTQAGV in isoform 5. | VSP_023348 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 216 – 471 | 256 | Missing in isoform 5. | VSP_023349 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 239 – 295 | 57 | Missing in isoform 7. | VSP_045987 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 354 – 470 | 117 | VLTWS…QQQLK → GI in isoform 7. | VSP_045988 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 376 – 379 | 4 | AMEL → DIMI in isoform 2, isoform 3 and isoform 4. | VSP_023350 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 380 – 471 | 92 | Missing in isoform 2, isoform 3 and isoform 4. | VSP_023351 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 148 | 1 | D → G in BAG59405. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 248 | 1 | V → A in BAG59405. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 366 | 1 | H → L in AAN32950. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 366 | 1 | H → L in BAA91985. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 184 – 188 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 192 – 204 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 208 – 213 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 218 – 220 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 223 – 229 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 234 – 238 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 240 – 243 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 247 – 251 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 262 – 283 | 22 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 284 – 286 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 288 – 291 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 293 – 295 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 296 – 307 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 311 – 313 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 314 – 316 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 320 – 332 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 339 – 342 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 343 – 348 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 350 – 352 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 354 – 358 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 366 – 377 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 380 – 382 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 387 – 402 | 16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 407 – 414 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 426 – 434 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 437 – 441 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 450 – 468 | 19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
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Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AF503350 mRNA. Translation: AAN32950.1. CR616778 mRNA. No translation available. AK001930 mRNA. Translation: BAA91985.1. AK296835 mRNA. Translation: BAG59405.1. AK314521 mRNA. Translation: BAG37116.1. AC027544 Genomic DNA. No translation available. AC112694 Genomic DNA. No translation available. CH471064 Genomic DNA. Translation: EAW68380.1. BC011011 mRNA. Translation: AAH11011.2. BC064566 mRNA. Translation: AAH64566.1. CD109744 mRNA. No translation available. | ||||||||||||||||||
| IPI | IPI00185072. IPI00217342. IPI00440160. IPI00746183. IPI00827694. IPI01010780. IPI01014900. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001035787.1. NM_001040697.2. NP_001248311.1. NM_001261382.1. NP_001248312.1. NM_001261383.1. NP_001248313.1. NM_001261384.1. NP_001248314.1. NM_001261385.1. NP_001248315.1. NM_001261386.1. NP_060784.3. NM_018314.4. | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.407991. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q8IX04. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| IntAct | Q8IX04. 7 interactions. | ||||||||||||||||||
| STRING | 9606.ENSP00000379500. | ||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q8IX04. | ||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||
| DMDM | 126253820. | ||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||
| PaxDb | Q8IX04. | ||||||||||||||||||
| PRIDE | Q8IX04. | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000300038; ENSP00000300038; ENSG00000151116. ENST00000320750; ENSP00000323353; ENSG00000151116. ENST00000379387; ENSP00000368697; ENSG00000151116. ENST00000396197; ENSP00000379500; ENSG00000151116. ENST00000535484; ENSP00000441092; ENSG00000151116. ENST00000541984; ENSP00000437538; ENSG00000151116. ENST00000543987; ENSP00000442974; ENSG00000151116. | ||||||||||||||||||
| GeneID | 55293. | ||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:55293. | ||||||||||||||||||
| UCSC | uc001mot.3. human. uc001mou.3. human. uc001mov.3. human. uc010rdh.2. human. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CTD | 55293. | ||||||||||||||||||
| GeneCards | GC11M018554. | ||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:30866. UEVLD. | ||||||||||||||||||
| HPA | HPA047134. | ||||||||||||||||||
| MIM | 610985. gene. | ||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_Q8IX04. | ||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA147357188. | ||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| eggNOG | COG0039. | ||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000213793. | ||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG000462. | ||||||||||||||||||
| InParanoid | Q8IX04. | ||||||||||||||||||
| OMA | SNRAMEL. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q8IX04. | ||||||||||||||||||
| Bgee | Q8IX04. | ||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_UEVLD. | ||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q8IX04. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| Gene3D | 3.10.110.10. 1 hit. 3.40.50.720. 1 hit. 3.90.110.10. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| InterPro | IPR001557. L-lactate/malate_DH. IPR022383. Lactate/malate_DH_C. IPR001236. Lactate/malate_DH_N. IPR015955. Lactate_DH/Glyco_Ohase_4_C. IPR016040. NAD(P)-bd_dom. IPR016135. UBQ-conjugating_enzyme/RWD. IPR008883. UEV_N. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF02866. Ldh_1_C. 1 hit. PF00056. Ldh_1_N. 1 hit. PF05743. UEV. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00086. LLDHDRGNASE. | ||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF56327. Lactate_DH/Glyco_hydro_4_C. 1 hit. SSF54495. UBQ-conjugat/RWD-like. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00183. UBIQUITIN_CONJUGAT_1. False negative. PS50127. UBIQUITIN_CONJUGAT_2. False negative. PS51322. UEV. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q8IX04. | ||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 55293. | ||||||||||||||||||
| NextBio | 59482. | ||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | UEVLD_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q8IX04 Secondary accession number(s): B2RB69 Q9NUX7 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 11 Human chromosome 11: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
