Q8A0N1 (Q8A0N1_BACTN) Unreviewed, UniProtKB/TrEMBL
Last modified
May 1, 2013.
Version 61.
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| Protein names | Submitted name: Putative alpha-1,2-mannosidase EMBL AAO79095.1 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Bacteroides thetaiotaomicron (strain ATCC 29148 / DSM 2079 / NCTC 10582 / E50 / VPI-5482) [Reference proteome] [HAMAP] EMBL AAO79095.1 | ||
| Taxonomic identifier | 226186 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Bacteroidetes › Bacteroidia › Bacteroidales › Bacteroidaceae › Bacteroides › ![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 755 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Ligand | Calcium PDB 2WVX PDB 2WZS PDB 2WW3 PDB 2WVZ PDB 2WW0 Metal-binding PDB 2WVX PDB 2WZS PDB 2WW3 PDB 2WVZ PDB 2WW0 |
| Technical term | 3D-structure PDB 2WVX PDB 2WZS PDB 2WW3 PDB 2WVZ PDB 2WW0 PDB 2WW1 Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | carbohydrate metabolic process Inferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Molecular_function | carbohydrate binding Inferred from electronic annotation. Source: InterPro catalytic activityInferred from electronic annotation. Source: InterPro metal ion bindingInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||
Sites | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Metal binding | 533 | 1 | Calcium 1 PDB 2WVX | ||||||
| Metal binding | 600 | 1 | Calcium 1; via carbonyl oxygen PDB 2WVX | ||||||
| Metal binding | 601 | 1 | Calcium 2 PDB 2WZS PDB 2WVZ PDB 2WW0 | ||||||
| Metal binding | 602 | 1 | Calcium 1 PDB 2WVX | ||||||
| Metal binding | 602 | 1 | Calcium 2 PDB 2WZS PDB 2WVZ PDB 2WW0 | ||||||
| Metal binding | 644 | 1 | Calcium 1 PDB 2WVX | ||||||
| Metal binding | 644 | 1 | Calcium 2 PDB 2WZS PDB 2WVZ PDB 2WW0 | ||||||
Sequences
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References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "A genomic view of the human-Bacteroides thetaiotaomicron symbiosis." Xu J., Bjursell M.K., Himrod J., Deng S., Carmichael L.K., Chiang H.C., Hooper L.V., Gordon J.I. Science 299:2074-2076(2003) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 29148 / DSM 2079 / NCTC 10582 / E50 / VPI-5482. |
| [2] | "Mechanistic insights into a Ca2+-dependent family of alpha-mannosidases in a human gut symbiont." Zhu Y., Suits M.D., Thompson A.J., Chavan S., Dinev Z., Dumon C., Smith N., Moremen K.W., Xiang Y., Siriwardena A., Williams S.J., Gilbert H.J., Davies G.J. Nat. Chem. Biol. 6:125-132(2010) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.90 ANGSTROMS) OF 20-755 IN COMPLEX WITH CALCIUM. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AE015928 Genomic DNA. Translation: AAO79095.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_812901.1. NC_004663.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q8A0N1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | 226186.BT_3990. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EnsemblBacteria | AAO79095; AAO79095; BT_3990. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 1075311. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | bth:BT_3990. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PATRIC | 21063014. VBIBacThe70966_4055. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HOG000122165. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | QVIHEIR. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtClustDB | CLSK823064. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc | BTHE226186:GJXV-4067-MONOMER. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | 2.70.98.10. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR008928. 6-hairpin_glycosidase-like. IPR005887. Alpha_mannosidase. IPR014718. Glyco_hydro-type_carb-bd_sub. IPR012939. Glyco_hydro_92. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF07971. Glyco_hydro_92. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF48208. Glyco_trans_6hp. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01180. aman2_put. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q8A0N1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | Q8A0N1_BACTN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q8A0N1 | ||||||||
| Entry history |
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| Entry status | Unreviewed (UniProtKB/TrEMBL) | ||||||||

Clusters with
