##gff-version 3 Q86TM6 UniProtKB Chain 1 617 . . . ID=PRO_0000280548;Note=E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin Q86TM6 UniProtKB Topological domain 1 4 . . . Note=Cytoplasmic;Ontology_term=ECO:0000305;evidence=ECO:0000305 Q86TM6 UniProtKB Transmembrane 5 25 . . . Note=Helical;Ontology_term=ECO:0000255;evidence=ECO:0000255 Q86TM6 UniProtKB Topological domain 26 41 . . . Note=Lumenal;Ontology_term=ECO:0000305;evidence=ECO:0000305 Q86TM6 UniProtKB Transmembrane 42 62 . . . Note=Helical;Ontology_term=ECO:0000255;evidence=ECO:0000255 Q86TM6 UniProtKB Topological domain 63 98 . . . Note=Cytoplasmic;Ontology_term=ECO:0000305;evidence=ECO:0000305 Q86TM6 UniProtKB Transmembrane 99 119 . . . Note=Helical;Ontology_term=ECO:0000255;evidence=ECO:0000255 Q86TM6 UniProtKB Topological domain 120 140 . . . Note=Lumenal;Ontology_term=ECO:0000305;evidence=ECO:0000305 Q86TM6 UniProtKB Transmembrane 141 161 . . . Note=Helical;Ontology_term=ECO:0000255;evidence=ECO:0000255 Q86TM6 UniProtKB Topological domain 162 169 . . . Note=Cytoplasmic;Ontology_term=ECO:0000305;evidence=ECO:0000305 Q86TM6 UniProtKB Transmembrane 170 190 . . . Note=Helical;Ontology_term=ECO:0000255;evidence=ECO:0000255 Q86TM6 UniProtKB Topological domain 191 224 . . . Note=Lumenal;Ontology_term=ECO:0000305;evidence=ECO:0000305 Q86TM6 UniProtKB Transmembrane 225 245 . . . Note=Helical;Ontology_term=ECO:0000255;evidence=ECO:0000255 Q86TM6 UniProtKB Topological domain 246 617 . . . Note=Cytoplasmic;Ontology_term=ECO:0000305;evidence=ECO:0000305 Q86TM6 UniProtKB Zinc finger 291 330 . . . Note=RING-type%3B atypical;Ontology_term=ECO:0000255;evidence=ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU00175 Q86TM6 UniProtKB Region 1 251 . . . Note=Involved in FAM8A1 interaction;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:28827405;Dbxref=PMID:28827405 Q86TM6 UniProtKB Region 1 84 . . . Note=Necessary and sufficient for SEL1L interaction;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:28827405;Dbxref=PMID:28827405 Q86TM6 UniProtKB Region 236 270 . . . Note=Interaction with p53/TP53;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:17170702;Dbxref=PMID:17170702 Q86TM6 UniProtKB Region 337 375 . . . Note=Disordered;Ontology_term=ECO:0000256;evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite Q86TM6 UniProtKB Region 393 453 . . . Note=Disordered;Ontology_term=ECO:0000256;evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite Q86TM6 UniProtKB Region 480 535 . . . Note=HAF-H domain%3B necessary to form higher-order Hrd1 complexes;Ontology_term=ECO:0000303;evidence=ECO:0000303|PubMed:28827405;Dbxref=PMID:28827405 Q86TM6 UniProtKB Region 535 617 . . . Note=Disordered;Ontology_term=ECO:0000256;evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite Q86TM6 UniProtKB Compositional bias 339 375 . . . Note=Pro residues;Ontology_term=ECO:0000256;evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite Q86TM6 UniProtKB Compositional bias 411 441 . . . Note=Polar residues;Ontology_term=ECO:0000256;evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite Q86TM6 UniProtKB Compositional bias 535 566 . . . Note=Polar residues;Ontology_term=ECO:0000256;evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite Q86TM6 UniProtKB Compositional bias 567 581 . . . Note=Pro residues;Ontology_term=ECO:0000256;evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite Q86TM6 UniProtKB Compositional bias 598 617 . . . Note=Basic and acidic residues;Ontology_term=ECO:0000256;evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite Q86TM6 UniProtKB Binding site 291 291 . . . Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0007744;evidence=ECO:0000269|PubMed:30345569,ECO:0007744|PDB:6A3Z;Dbxref=PMID:30345569 Q86TM6 UniProtKB Binding site 294 294 . . . Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0007744;evidence=ECO:0000269|PubMed:30345569,ECO:0007744|PDB:6A3Z;Dbxref=PMID:30345569 Q86TM6 UniProtKB Binding site 307 307 . . . Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0007744;evidence=ECO:0000269|PubMed:30345569,ECO:0007744|PDB:6A3Z;Dbxref=PMID:30345569 Q86TM6 UniProtKB Binding site 309 309 . . . Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0007744;evidence=ECO:0000269|PubMed:30345569,ECO:0007744|PDB:6A3Z;Dbxref=PMID:30345569 Q86TM6 UniProtKB Binding site 312 312 . . . Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0007744;evidence=ECO:0000269|PubMed:30345569,ECO:0007744|PDB:6A3Z;Dbxref=PMID:30345569 Q86TM6 UniProtKB Binding site 315 315 . . . Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0007744;evidence=ECO:0000269|PubMed:30345569,ECO:0007744|PDB:6A3Z;Dbxref=PMID:30345569 Q86TM6 UniProtKB Binding site 326 326 . . . Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0007744;evidence=ECO:0000269|PubMed:30345569,ECO:0007744|PDB:6A3Z;Dbxref=PMID:30345569 Q86TM6 UniProtKB Binding site 329 329 . . . Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0007744;evidence=ECO:0000269|PubMed:30345569,ECO:0007744|PDB:6A3Z;Dbxref=PMID:30345569 Q86TM6 UniProtKB Modified residue 613 613 . . . Note=Phosphoserine;Ontology_term=ECO:0007744,ECO:0007744,ECO:0007744;evidence=ECO:0007744|PubMed:18691976,ECO:0007744|PubMed:20068231,ECO:0007744|PubMed:23186163;Dbxref=PMID:18691976,PMID:20068231,PMID:23186163 Q86TM6 UniProtKB Alternative sequence 127 177 . . . ID=VSP_023777;Note=In isoform 2. Missing;Ontology_term=ECO:0000303;evidence=ECO:0000303|PubMed:11347906;Dbxref=PMID:11347906 Q86TM6 UniProtKB Alternative sequence 411 411 . . . ID=VSP_023778;Note=In isoform 2 and isoform 3. Missing;Ontology_term=ECO:0000303,ECO:0000303,ECO:0000303,ECO:0000303;evidence=ECO:0000303|PubMed:11347906,ECO:0000303|PubMed:12459480,ECO:0000303|PubMed:14593114,ECO:0000303|PubMed:17974005;Dbxref=PMID:11347906,PMID:12459480,PMID:14593114,PMID:17974005 Q86TM6 UniProtKB Mutagenesis 294 294 . . . Note=No effect on interaction with FAM8A1%2C HERPUD1%2C OS9%2C SEL1L and UBE2J1. C->A;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:28827405;Dbxref=PMID:28827405 Q86TM6 UniProtKB Mutagenesis 329 329 . . . Note=Abolishes E3 ligase activity. C->S;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:12459480;Dbxref=PMID:12459480 Q86TM6 UniProtKB Mutagenesis 503 503 . . . Note=Loss of interaction with FAM8A1%2C HERPUD1%2C OS9 and UBE2J1%2C impaired degradation of immature core-glycosylated basigin/CD147. R->L;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:28827405;Dbxref=PMID:28827405 Q86TM6 UniProtKB Sequence conflict 145 145 . . . Note=M->I;Ontology_term=ECO:0000305;evidence=ECO:0000305 Q86TM6 UniProtKB Sequence conflict 545 545 . . . Note=E->G;Ontology_term=ECO:0000305;evidence=ECO:0000305 Q86TM6 UniProtKB Helix 281 285 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:6A3Z Q86TM6 UniProtKB Turn 286 289 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:6A3Z Q86TM6 UniProtKB Turn 292 295 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:6A3Z Q86TM6 UniProtKB Beta strand 299 304 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:6A3Z Q86TM6 UniProtKB Beta strand 310 312 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:6A3Z Q86TM6 UniProtKB Helix 313 319 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:6A3Z Q86TM6 UniProtKB Turn 320 322 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:6A3Z Q86TM6 UniProtKB Turn 327 329 . . . Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:6A3Z