Q86SR1 (GLT10_HUMAN) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
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May 1, 2013.
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| Protein names | Recommended name: Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 EC=2.4.1.41 Alternative name(s): Polypeptide GalNAc transferase 10 Short name=GalNAc-T10 Short name=pp-GaNTase 10 Protein-UDP acetylgalactosaminyltransferase 10 UDP-GalNAc:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Reference proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 603 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes the initial reaction in O-linked oligosaccharide biosynthesis, the transfer of an N-acetyl-D-galactosamine residue to a serine or threonine residue on the protein receptor. Has activity toward Muc5Ac and EA2 peptide substrates. |
| Catalytic activity | UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine + polypeptide = UDP + N-acetyl-alpha-D-galactosaminyl-polypeptide. Ref.1 |
| Cofactor | Manganese By similarity. Calcium By similarity. |
| Pathway | |
| Subcellular location | Golgi apparatus membrane; Single-pass type II membrane protein By similarity. |
| Tissue specificity | Widely expressed. Expressed at high level in small intestine, and at intermediate levels in stomach, pancreas, ovary, thyroid gland and spleen. Weakly expressed in other tissues. Ref.1 |
| Domain | There are two conserved domains in the glycosyltransferase region: the N-terminal domain (domain A, also called GT1 motif), which is probably involved in manganese coordination and substrate binding and the C-terminal domain (domain B, also called Gal/GalNAc-T motif), which is probably involved in catalytic reaction and UDP-Gal binding By similarity. The ricin B-type lectin domain binds to GalNAc and contributes to the glycopeptide specificity By similarity. |
| Sequence similarities | Belongs to the glycosyltransferase 2 family. GalNAc-T subfamily. Contains 1 ricin B-type lectin domain. |
| Caution | According to experiments made in rat, this enzyme is unable to transfer GalNAc onto serine or threonine residue on the protein receptor, but instead requires the prior addition of a GalNAc on a peptide before adding additional GalNAc moieties, thereby acting as a glycopeptide transferase. |
| Sequence caution | The sequence BAB14676.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Golgi apparatus Membrane |
| Coding sequence diversity | Alternative splicing |
| Domain | Signal-anchor Transmembrane Transmembrane helix |
| Ligand | Calcium Lectin Manganese Metal-binding |
| Molecular function | Glycosyltransferase Transferase |
| PTM | Disulfide bond Glycoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | O-glycan processing Traceable author statement. Source: Reactome post-translational protein modificationTraceable author statement. Source: Reactome |
| Cellular_component | Golgi membrane Traceable author statement. Source: Reactome integral to membraneInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular_function | metal ion binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase activityInferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Alternative products
| This entry describes 4 isoforms produced by alternative splicing. [Align] [Select] | ||||||
| Isoform 1 (identifier: Q86SR1-1) This isoform has been chosen as the 'canonical' sequence. All positional information in this entry refers to it. This is also the sequence that appears in the downloadable versions of the entry. | ||||||
| Isoform 2 (identifier: Q86SR1-2) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 190-251: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. | ||||||
| Isoform 3 (identifier: Q86SR1-3) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 354-366: WMCGGRMEDIPCS → SQLSRRPVLGTAS 367-603: Missing. | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. | ||||||
| Isoform 4 (identifier: Q86SR1-4) The sequence of this isoform differs from the canonical sequence as follows: 1-329: Missing. 330-352: WELGGYDPGLEIWGGEQYEISFK → MLAWRDGELEAETSSSLFLLAMQ 389-389: N → VRT | ||||||
| Note: No experimental confirmation available. |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 603 | 603 | Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 | PRO_0000059122 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 1 – 11 | 11 | Cytoplasmic Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 12 – 31 | 20 | Helical; Signal-anchor for type II membrane protein; Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 32 – 603 | 572 | Lumenal Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 458 – 590 | 133 | Ricin B-type lectin | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 144 – 253 | 110 | Catalytic subdomain A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 311 – 373 | 63 | Catalytic subdomain B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 373 – 384 | 12 | Flexible loop | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 237 | 1 | Manganese | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 239 | 1 | Manganese | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 370 | 1 | Manganese | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 185 | 1 | Substrate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 237 | 1 | Substrate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 124 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 146 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 593 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 135 ↔ 365 | Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 356 ↔ 432 | Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 471 ↔ 488 | Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 523 ↔ 538 | Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 563 ↔ 578 | Ref.7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 1 – 329 | 329 | Missing in isoform 4. | VSP_011207 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 190 – 251 | 62 | Missing in isoform 2. | VSP_011209 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 330 – 352 | 23 | WELGG…EISFK → MLAWRDGELEAETSSSLFLL AMQ in isoform 4. | VSP_011208 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 354 – 366 | 13 | WMCGG…DIPCS → SQLSRRPVLGTAS in isoform 3. | VSP_011212 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 367 – 603 | 237 | Missing in isoform 3. | VSP_011213 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative sequence | 389 | 1 | N → VRT in isoform 4. | VSP_011214 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Experimental info | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 518 | 1 | H → Y in BAC56890. Ref.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence conflict | 518 | 1 | H → Y in BAB14676. Ref.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 77 – 84 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 91 – 93 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 100 – 103 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 106 – 109 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 115 – 119 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 133 – 136 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 140 – 143 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 147 – 155 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 158 – 171 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 174 – 176 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 177 – 184 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 190 – 192 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 194 – 200 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 206 – 210 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 217 – 227 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 230 – 235 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 238 – 242 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 248 – 256 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 260 – 269 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 271 – 273 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 285 – 288 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 294 – 297 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 301 – 303 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 319 – 325 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 326 – 331 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 341 – 344 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 345 – 355 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 359 – 370 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 386 – 397 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 399 – 401 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 402 – 406 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 410 – 412 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 421 – 430 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 435 – 441 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 446 – 449 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 458 – 465 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 466 – 468 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 478 – 480 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 495 – 497 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 503 – 505 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 507 – 509 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 511 – 514 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 521 – 525 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 528 – 532 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 534 – 537 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 540 – 543 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 548 – 550 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 551 – 553 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 554 – 556 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 558 – 560 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 563 – 566 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 568 – 570 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 573 – 576 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 587 – 591 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 594 – 597 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 598 – 601 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
References
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Web resources
| GGDB GlycoGene database |
| Functional Glycomics Gateway - GTase Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 |
| Functional Glycomics Gateway - GTase Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AB078145 mRNA. Translation: BAC56890.1. AJ505950 mRNA. Translation: CAD44532.1. AK023782 mRNA. Translation: BAB14676.1. Different initiation. AK127135 mRNA. Translation: BAG54441.1. AL096739 mRNA. Translation: CAB46378.1. AK074132 mRNA. Translation: BAB84958.1. BC007224 mRNA. Translation: AAH07224.2. BC072450 mRNA. Translation: AAH72450.1. | ||||||||||||||||||
| IPI | IPI00303783. IPI00375205. IPI00456478. IPI00456479. | ||||||||||||||||||
| PIR | T12552. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_938080.1. NM_198321.3. | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.740431. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q86SR1. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein family/group databases | |||||||||||||||||||
| CAZy | CBM13. Carbohydrate-Binding Module Family 13. GT27. Glycosyltransferase Family 27. | ||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q86SR1. | ||||||||||||||||||
Polymorphism databases | |||||||||||||||||||
| DMDM | 51315962. | ||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||
| PaxDb | Q86SR1. | ||||||||||||||||||
| PRIDE | Q86SR1. | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| DNASU | 55568. | ||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000297107; ENSP00000297107; ENSG00000164574. ENST00000377661; ENSP00000366889; ENSG00000164574. ENST00000425427; ENSP00000415210; ENSG00000164574. | ||||||||||||||||||
| GeneID | 55568. | ||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:55568. | ||||||||||||||||||
| UCSC | uc003lvg.1. human. uc003lvh.3. human. uc010jid.3. human. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CTD | 55568. | ||||||||||||||||||
| GeneCards | GC05P153550. | ||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:19873. GALNT10. | ||||||||||||||||||
| HPA | HPA007525. | ||||||||||||||||||
| MIM | 608043. gene. | ||||||||||||||||||
| neXtProt | NX_Q86SR1. | ||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA134870832. | ||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| eggNOG | NOG239675. | ||||||||||||||||||
| HOVERGEN | HBG051699. | ||||||||||||||||||
| InParanoid | Q86SR1. | ||||||||||||||||||
| KO | K00710. | ||||||||||||||||||
| OMA | HSRQKKT. | ||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG4CC40V. | ||||||||||||||||||
| PhylomeDB | Q86SR1. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_17015. Metabolism of proteins. | ||||||||||||||||||
| UniPathway | UPA00378. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q86SR1. | ||||||||||||||||||
| Bgee | Q86SR1. | ||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q86SR1. | ||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000164574. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR001173. Glyco_trans_2. IPR000772. Ricin_B_lectin. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00535. Glycos_transf_2. 1 hit. PF00652. Ricin_B_lectin. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| SMART | SM00458. RICIN. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF50370. RicinB_like. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50231. RICIN_B_LECTIN. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||
| ChiTaRS | GALNT10. human. | ||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q86SR1. | ||||||||||||||||||
| GenomeRNAi | 55568. | ||||||||||||||||||
| NextBio | 60056. | ||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | GLT10_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q86SR1 Secondary accession number(s): B3KXC9 Q9Y4M4 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Chordata Protein Annotation Program | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 5 Human chromosome 5: entries, gene names and cross-references to MIM |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
