##gff-version 3
Q6IAA8	UniProtKB	Initiator methionine	1	1	.	.	.	Note=Removed;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:25255805,ECO:0000269|PubMed:25807930,ECO:0000269|PubMed:32686708,ECO:0000269|PubMed:34999170;Dbxref=PMID:25255805,PMID:25807930,PMID:32686708,PMID:34999170	
Q6IAA8	UniProtKB	Chain	2	161	.	.	.	ID=PRO_0000274292;Note=Ragulator complex protein LAMTOR1	
Q6IAA8	UniProtKB	Region	1	43	.	.	.	Note=Disordered;Ontology_term=ECO:0000256;evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	
Q6IAA8	UniProtKB	Region	121	161	.	.	.	Note=Interaction with LAMTOR2 and LAMTOR3;Ontology_term=ECO:0000250;evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q6P791	
Q6IAA8	UniProtKB	Compositional bias	9	24	.	.	.	Note=Basic and acidic residues;Ontology_term=ECO:0000256;evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	
Q6IAA8	UniProtKB	Modified residue	27	27	.	.	.	Note=Phosphoserine;Ontology_term=ECO:0007744,ECO:0007744;evidence=ECO:0007744|PubMed:20068231,ECO:0007744|PubMed:23186163;Dbxref=PMID:20068231,PMID:23186163	
Q6IAA8	UniProtKB	Modified residue	42	42	.	.	.	Note=Phosphoserine;Ontology_term=ECO:0007744;evidence=ECO:0007744|PubMed:23186163;Dbxref=PMID:23186163	
Q6IAA8	UniProtKB	Modified residue	56	56	.	.	.	Note=Phosphoserine;Ontology_term=ECO:0007744;evidence=ECO:0007744|PubMed:23186163;Dbxref=PMID:23186163	
Q6IAA8	UniProtKB	Modified residue	98	98	.	.	.	Note=Phosphoserine;Ontology_term=ECO:0007744;evidence=ECO:0007744|PubMed:23186163;Dbxref=PMID:23186163	
Q6IAA8	UniProtKB	Modified residue	141	141	.	.	.	Note=Phosphoserine;Ontology_term=ECO:0007744;evidence=ECO:0007744|PubMed:23186163;Dbxref=PMID:23186163	
Q6IAA8	UniProtKB	Lipidation	2	2	.	.	.	Note=N-myristoyl glycine;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:25255805,ECO:0000269|PubMed:25807930,ECO:0000269|PubMed:32686708,ECO:0000269|PubMed:34999170;Dbxref=PMID:25255805,PMID:25807930,PMID:32686708,PMID:34999170	
Q6IAA8	UniProtKB	Lipidation	3	3	.	.	.	Note=S-palmitoyl cysteine;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:31001086,ECO:0000269|PubMed:34999170,ECO:0000269|PubMed:35893977;Dbxref=PMID:31001086,PMID:34999170,PMID:35893977	
Q6IAA8	UniProtKB	Lipidation	4	4	.	.	.	Note=S-palmitoyl cysteine;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:31001086,ECO:0000269|PubMed:34999170,ECO:0000269|PubMed:35893977;Dbxref=PMID:31001086,PMID:34999170,PMID:35893977	
Q6IAA8	UniProtKB	Cross-link	20	20	.	.	.	Note=Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin);Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:36476874;Dbxref=PMID:36476874	
Q6IAA8	UniProtKB	Cross-link	31	31	.	.	.	Note=Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin);Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:36476874;Dbxref=PMID:36476874	
Q6IAA8	UniProtKB	Cross-link	60	60	.	.	.	Note=Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin);Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:36476874;Dbxref=PMID:36476874	
Q6IAA8	UniProtKB	Cross-link	103	103	.	.	.	Note=Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin);Ontology_term=ECO:0000250;evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q9CQ22	
Q6IAA8	UniProtKB	Cross-link	104	104	.	.	.	Note=Glycyl lysine isopeptide (Lys-Gly) (interchain with G-Cter in ubiquitin);Ontology_term=ECO:0000250;evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q9CQ22	
Q6IAA8	UniProtKB	Natural variant	73	73	.	.	.	ID=VAR_030250;Note=S->L;Dbxref=dbSNP:rs1053443	
Q6IAA8	UniProtKB	Mutagenesis	2	2	.	.	.	Note=Abolished N-myristoylation and subsequent palmitoylation. G->A;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:34999170;Dbxref=PMID:34999170	
Q6IAA8	UniProtKB	Mutagenesis	3	4	.	.	.	Note=Abolished palmitoylation and recruitment to lysosomes%2C leading to impaired activation of the mTORC1 complex. CC->SS;Ontology_term=ECO:0000269,ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:31001086,ECO:0000269|PubMed:35893977;Dbxref=PMID:31001086,PMID:35893977	
Q6IAA8	UniProtKB	Mutagenesis	3	3	.	.	.	Note=Decreased palmitoylation. C->A;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:34999170;Dbxref=PMID:34999170	
Q6IAA8	UniProtKB	Mutagenesis	3	3	.	.	.	Note=Does not affect interaction with ZDHHC3. C->S;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:35893977;Dbxref=PMID:35893977	
Q6IAA8	UniProtKB	Mutagenesis	4	4	.	.	.	Note=Decreased palmitoylation. C->A;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:34999170;Dbxref=PMID:34999170	
Q6IAA8	UniProtKB	Mutagenesis	4	4	.	.	.	Note=Does not affect interaction with ZDHHC3. C->S;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:35893977;Dbxref=PMID:35893977	
Q6IAA8	UniProtKB	Mutagenesis	119	119	.	.	.	Note=Impaired assembly of the Ragulator complex. L->R;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:29123114;Dbxref=PMID:29123114	
Q6IAA8	UniProtKB	Mutagenesis	132	132	.	.	.	Note=Impaired assembly of the Ragulator complex. V->D;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:29123114;Dbxref=PMID:29123114	
Q6IAA8	UniProtKB	Mutagenesis	148	149	.	.	.	Note=Impaired assembly of the Ragulator complex. VD->AA;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:28935770;Dbxref=PMID:28935770	
Q6IAA8	UniProtKB	Mutagenesis	151	153	.	.	.	Note=Impaired recruiment of Rag GTPases (RRAGA and RRAGC) to the lysosomal membrane. KEE->AAA;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:28935770;Dbxref=PMID:28935770	
Q6IAA8	UniProtKB	Mutagenesis	154	158	.	.	.	Note=Does not affect interaction with RRAGA and RRAGC in vitro. LVVQF->DDDQD;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:29285400;Dbxref=PMID:29285400	
Q6IAA8	UniProtKB	Mutagenesis	154	156	.	.	.	Note=Impaired recruiment of Rag GTPases (RRAGA and RRAGC) to the lysosomal membrane. LVV->AAA;Ontology_term=ECO:0000269;evidence=ECO:0000269|PubMed:28935770;Dbxref=PMID:28935770	
Q6IAA8	UniProtKB	Sequence conflict	50	50	.	.	.	Note=E->V;Ontology_term=ECO:0000305;evidence=ECO:0000305	
Q6IAA8	UniProtKB	Sequence conflict	60	60	.	.	.	Note=K->R;Ontology_term=ECO:0000305;evidence=ECO:0000305	
Q6IAA8	UniProtKB	Sequence conflict	69	69	.	.	.	Note=S->P;Ontology_term=ECO:0000305;evidence=ECO:0000305	
Q6IAA8	UniProtKB	Helix	50	64	.	.	.	Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5X6V	
Q6IAA8	UniProtKB	Helix	68	70	.	.	.	Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:7UXC	
Q6IAA8	UniProtKB	Turn	75	77	.	.	.	Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:6EHR	
Q6IAA8	UniProtKB	Helix	78	95	.	.	.	Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:5X6V	
Q6IAA8	UniProtKB	Helix	98	102	.	.	.	Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:6B9X	
Q6IAA8	UniProtKB	Helix	115	120	.	.	.	Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:6B9X	
Q6IAA8	UniProtKB	Helix	126	142	.	.	.	Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:6B9X	
Q6IAA8	UniProtKB	Helix	143	145	.	.	.	Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:6B9X	
Q6IAA8	UniProtKB	Beta strand	154	156	.	.	.	Ontology_term=ECO:0007829;evidence=ECO:0007829|PDB:6EHR