Q6FF54 (Y353_ACIAD) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 49.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: UPF0301 protein ACIAD0353 | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Acinetobacter sp. (strain ADP1) [Complete proteome] [HAMAP] | ||
| Taxonomic identifier | 62977 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Gammaproteobacteria › Pseudomonadales › Moraxellaceae › Acinetobacter![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 184 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Sequence similarities | Belongs to the UPF0301 (AlgH) family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| None. [Check GOA] | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 184 | 184 | UPF0301 protein ACIAD0353 HAMAP-Rule MF_00758 | PRO_0000258792 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 9 – 12 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 20 – 24 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 26 – 33 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 36 – 41 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 45 – 49 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 50 – 56 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 68 – 71 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 74 – 86 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 90 – 97 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 100 – 103 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 107 – 113 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 120 – 130 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 134 – 140 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 145 – 148 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 151 – 154 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 159 – 161 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 162 – 169 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 170 – 172 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Unique features revealed by the genome sequence of Acinetobacter sp. ADP1, a versatile and naturally transformation competent bacterium." Barbe V., Vallenet D., Fonknechten N., Kreimeyer A., Oztas S., Labarre L., Cruveiller S., Robert C., Duprat S., Wincker P., Ornston L.N., Weissenbach J., Marliere P., Cohen G.N., Medigue C. Nucleic Acids Res. 32:5766-5779(2004) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ADP1. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | CR543861 Genomic DNA. Translation: CAG67303.1. | ||||||||||||
| RefSeq | YP_045125.1. NC_005966.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q6FF54. | ||||||||||||
| SMR | Q6FF54. Positions 5-179. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| STRING | 62977.ACIAD0353. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| EnsemblBacteria | CAG67303; CAG67303; ACIAD0353. | ||||||||||||
| GeneID | 2881155. | ||||||||||||
| KEGG | aci:ACIAD0353. | ||||||||||||
| PATRIC | 20738652. VBIAciSp98416_0311. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| CMR | Search... | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | COG1678. | ||||||||||||
| HOGENOM | HOG000281193. | ||||||||||||
| KO | K07735. | ||||||||||||
| OMA | VETGRGF. | ||||||||||||
| ProtClustDB | CLSK830456. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | ASP62977:GJVV-335-MONOMER. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| HAMAP | MF_00758. UPF0301. | ||||||||||||
| InterPro | IPR003774. DUF179. [Graphical view] | ||||||||||||
| Pfam | PF02622. DUF179. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other | |||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q6FF54. | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | Y353_ACIAD | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q6FF54 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| Uncharacterized protein families (UPF) List of uncharacterized protein family (UPF) entries |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
