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UniProtKB/Swiss-Prot Q5ZLR5 (UCRI_CHICK)
Last modified
February 9, 2010.
Version 45.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (2) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial EC=1.10.2.2 Alternative name(s): Ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit Rieske iron-sulfur protein Short name=RISP Complex III subunit 5 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Gallus gallus (Chicken) | ||||
| Taxonomic identifier | 9031 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Archosauria › Dinosauria › Saurischia › Theropoda › Coelurosauria › Aves › Neognathae › Galliformes › Phasianidae › Phasianinae › Gallus |
Protein attributes
| Sequence length | 272 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Component of the ubiquinol-cytochrome c reductase complex (complex III or cytochrome b-c1 complex), which is a respiratory chain that generates an electrochemical potential coupled to ATP synthesis By similarity. |
| Catalytic activity | QH2 + 2 ferricytochrome c = Q + 2 ferrocytochrome c + 2 H+. |
| Cofactor | Binds 1 2Fe-2S cluster per subunit By similarity. |
| Subunit structure | The bc1 complex contains 11 subunits: 3 respiratory subunits (cytochrome b, cytochrome c1 and Rieske/UQCRFS1), 2 core proteins (UQCRC1/QCR1 and UQCRC2/QCR2) and 6 low-molecular weight proteins (UQCRH/QCR6, UQCRB/QCR7, UQCRQ/QCR8, UQCR10/QCR9 and UQCR11/QCR10) By similarity. |
| Subcellular location | Mitochondrion inner membrane By similarity. |
| Miscellaneous | The Rieske protein is a high potential 2Fe-2S protein. |
| Sequence similarities | Contains 1 Rieske domain. |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Transit peptide | 1 – 76 | 76 | Mitochondrion By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 77 – 272 | 196 | Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial | PRO_0000342403 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 185 – 270 | 86 | Rieske | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 215 | 1 | Iron-sulfur (2Fe-2S) By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 217 | 1 | Iron-sulfur (2Fe-2S); via pros nitrogen By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 234 | 1 | Iron-sulfur (2Fe-2S) By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 237 | 1 | Iron-sulfur (2Fe-2S); via pros nitrogen By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 220 ↔ 236 | By similarity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 78 – 80 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 87 – 89 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 92 – 94 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 102 – 108 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 112 – 136 | 25 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 150 – 152 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 154 – 156 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 162 – 164 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 173 – 176 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 179 – 184 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 199 – 202 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 208 – 212 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 247 – 249 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 269 – 271 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Full-length cDNAs from chicken bursal lymphocytes to facilitate gene function analysis." Caldwell R.B., Kierzek A.M., Arakawa H., Bezzubov Y., Zaim J., Fiedler P., Kutter S., Blagodatski A., Kostovska D., Koter M., Plachy J., Carninci P., Hayashizaki Y., Buerstedde J.-M. Genome Biol. 6:R6.1-R6.9(2005) [PubMed: 15642098] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA]. Strain: CB. Tissue: Bursa of Fabricius. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AJ719669 mRNA. Translation: CAG31328.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IPI | IPI00571043. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001005843.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniGene | Gga.5791 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | Q5ZLR5. Positions 1-55. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | Q5ZLR5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRIDE | Q5ZLR5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | ENSGALT00000007087; ENSGALP00000007075; ENSGALG00000004452; Gallus gallus. [Genome view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 415752. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | gga:415752. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CTD | 415752. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | veNOG04796. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG668715. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOVERGEN | Q5ZLR5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InParanoid | Q5ZLR5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | DYRRAEV. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG9XH2KK. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | Q5ZLR5. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR011070. Globular_prot_asu/bsu. IPR017941. Rieske_2Fe-2S. IPR014349. Rieske_Fe-S_prot. IPR005805. Rieske_Fe-S_prot_C. IPR015248. Ubiqinol_cyt_c_Rdtase_N. IPR006317. Ubiquinol_cyt_c_Rdtase_Fe-S-su. IPR004192. Ubiquinol_cyt_Rdtase_TM. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:2.102.10.10. Rieske_reg. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR10134. Rieske. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00355. Rieske. 1 hit. PF09165. Ubiq-Cytc-red_N. 1 hit. PF02921. UCR_TM. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00162. RIESKE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01416. Rieske_proteo. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS51296. RIESKE. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | UCRI_CHICK | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q5ZLR5 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


