Q5SJE8 (TAL_THET8) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
January 25, 2012.
Version 51.
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| Protein names | Recommended name: Probable transaldolase EC=2.2.1.2 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) | ||||
| Taxonomic identifier | 300852 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Deinococcus-Thermus › Deinococci › Thermales › Thermaceae › Thermus |
Protein attributes
| Sequence length | 223 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Transaldolase is important for the balance of metabolites in the pentose-phosphate pathway By similarity. HAMAP MF_00494 |
| Catalytic activity | Sedoheptulose 7-phosphate + D-glyceraldehyde 3-phosphate = D-erythrose 4-phosphate + D-fructose 6-phosphate. HAMAP MF_00494 |
| Pathway | Carbohydrate degradation; pentose phosphate pathway; D-glyceraldehyde 3-phosphate and beta-D-fructose 6-phosphate from D-ribose 5-phosphate and D-xylulose 5-phosphate (non-oxidative stage): step 2/3. HAMAP MF_00494 |
| Subcellular location | Cytoplasm By similarity HAMAP MF_00494. |
| Sequence similarities | Belongs to the transaldolase family. Type 3B subfamily. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Pentose shunt |
| Cellular component | Cytoplasm |
| Molecular function | Transferase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | pentose-phosphate shunt Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Cellular component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | sedoheptulose-7-phosphate:D-glyceraldehyde-3-phosphate glyceronetransferase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 223 | 223 | Probable transaldolase HAMAP MF_00494 | PRO_1000126370 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 92 | 1 | By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2 – 6 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 10 – 18 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 29 – 38 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 45 – 58 | 14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 63 – 66 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 72 – 77 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 81 – 85 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 89 – 96 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 101 – 108 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 113 – 118 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 121 – 129 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 134 – 138 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 143 – 145 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 152 – 162 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 168 – 172 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 177 – 185 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 190 – 193 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 195 – 201 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 205 – 208 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Complete genome sequence of Thermus thermophilus HB8." Masui R., Kurokawa K., Nakagawa N., Tokunaga F., Koyama Y., Shibata T., Oshima T., Yokoyama S., Yasunaga T., Kuramitsu S. Submitted (NOV-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: HB8 / ATCC 27634 / DSM 579. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AP008226 Genomic DNA. Translation: BAD70889.1. | ||||||||||||
| RefSeq | YP_144332.1. NC_006461.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q5SJE8. | ||||||||||||
| SMR | Q5SJE8. Positions 1-211. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| STRING | Q5SJE8. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| GeneID | 3168258. | ||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus TTHA1066 in contig AP008226_GR. | ||||||||||||
| KEGG | ttj:TTHA1066. | ||||||||||||
| NMPDR | fig|300852.3.peg.1203. | ||||||||||||
| PATRIC | 23957092. VBITheThe93045_1046. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | COG0176. | ||||||||||||
| HOGENOM | HBG533000. | ||||||||||||
| OMA | KVNVTLC. | ||||||||||||
| PhylomeDB | Q5SJE8. | ||||||||||||
| ProtClustDB | PRK01362. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | TTHE300852:TTHA1066-MONOMER. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| HAMAP | MF_00494. Transaldolase_3b. [Tree] | ||||||||||||
| InterPro | IPR013785. Aldolase_TIM. IPR001585. Transaldolase. IPR004731. Transaldolase_3A/3B. IPR022999. Transaldolase_3B. IPR018225. Transaldolase_AS. [Graphical view] | ||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.20.20.70. Aldolase_TIM. 1 hit. | ||||||||||||
| KO | K00616. | ||||||||||||
| PANTHER | PTHR10683. Transaldolase. 1 hit. | ||||||||||||
| Pfam | PF00923. Transaldolase. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00875. Fsa_talC_mipB. 1 hit. | ||||||||||||
| PROSITE | PS01054. TRANSALDOLASE_1. 1 hit. PS00958. TRANSALDOLASE_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | TAL_THET8 | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q5SJE8 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with