Q5SID6 (COMB_THET8) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
January 25, 2012.
Version 38.
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| Protein names | Recommended name: Probable 2-phosphosulfolactate phosphatase EC=3.1.3.71 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) | ||||
| Taxonomic identifier | 300852 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Deinococcus-Thermus › Deinococci › Thermales › Thermaceae › Thermus |
Protein attributes
| Sequence length | 237 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | (2R)-2-phospho-3-sulfolactate + H2O = (2R)-3-sulfolactate + phosphate. HAMAP MF_00490 |
| Cofactor | Magnesium By similarity. HAMAP MF_00490 |
| Sequence similarities | Belongs to the ComB family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Ligand | Magnesium |
| Molecular function | Hydrolase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | coenzyme M biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Molecular function | 2-phosphosulfolactate phosphatase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC magnesium ion bindingInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 237 | 237 | Probable 2-phosphosulfolactate phosphatase HAMAP MF_00490 | PRO_1000014477 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2 – 8 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 16 – 22 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 24 – 26 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 27 – 36 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 40 – 44 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 48 – 52 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 60 – 63 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 79 – 84 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 90 – 95 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 99 – 107 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 111 – 116 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 121 – 131 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 133 – 140 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 149 – 164 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 172 – 183 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 187 – 192 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 195 – 202 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 208 – 212 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 222 – 228 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 231 – 236 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Complete genome sequence of Thermus thermophilus HB8." Masui R., Kurokawa K., Nakagawa N., Tokunaga F., Koyama Y., Shibata T., Oshima T., Yokoyama S., Yasunaga T., Kuramitsu S. Submitted (NOV-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: HB8 / ATCC 27634 / DSM 579. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AP008226 Genomic DNA. Translation: BAD71261.1. | ||||||||||||
| RefSeq | YP_144704.1. NC_006461.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q5SID6. | ||||||||||||
| SMR | Q5SID6. Positions 1-237. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| STRING | Q5SID6. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| GeneID | 3168156. | ||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus TTHA1438 in contig AP008226_GR. | ||||||||||||
| KEGG | ttj:TTHA1438. | ||||||||||||
| NMPDR | fig|300852.3.peg.1749. | ||||||||||||
| PATRIC | 23957833. VBITheThe93045_1412. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | COG2045. | ||||||||||||
| HOGENOM | HBG633644. | ||||||||||||
| OMA | VMSTTNG. | ||||||||||||
| PhylomeDB | Q5SID6. | ||||||||||||
| ProtClustDB | PRK14100. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | TTHE300852:TTHA1438-MONOMER. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| HAMAP | MF_00490. ComB. [Tree] | ||||||||||||
| InterPro | IPR005238. 2-PSlactate_phosphatase. IPR022995. Pase_ComB. [Graphical view] | ||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.90.1560.10. 2-PSlactate_phosphatase. 1 hit. | ||||||||||||
| KO | K05979. | ||||||||||||
| Pfam | PF04029. 2-ph_phosp. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| SUPFAM | SSF142823. SSF142823. 1 hit. | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | COMB_THET8 | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q5SID6 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with