Q58761 (KPRS_METJA) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
November 16, 2011.
Version 72.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Ribose-phosphate pyrophosphokinase Short name=RPPK EC=2.7.6.1 Alternative name(s): Phosphoribosyl pyrophosphate synthase Short name=P-Rib-PP synthase Short name=PRPP synthase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440) (Methanococcus jannaschii) | ||||
| Taxonomic identifier | 243232 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Archaea › Euryarchaeota › Methanococci › Methanococcales › Methanocaldococcaceae › Methanocaldococcus |
Protein attributes
| Sequence length | 284 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | ATP + D-ribose 5-phosphate = AMP + 5-phospho-alpha-D-ribose 1-diphosphate. HAMAP MF_00583_A |
| Cofactor | Binds 1 magnesium ion per subunit By similarity. HAMAP MF_00583_A |
| Pathway | Metabolic intermediate biosynthesis; 5-phospho-alpha-D-ribose 1-diphosphate biosynthesis; 5-phospho-alpha-D-ribose 1-diphosphate from D-ribose 5-phosphate (route I): step 1/1. HAMAP MF_00583_A |
| Subcellular location | Cytoplasm By similarity HAMAP MF_00583_A. |
| Sequence similarities | Belongs to the ribose-phosphate pyrophosphokinase family. |
| Sequence caution | The sequence AAB99374.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Nucleotide biosynthesis |
| Cellular component | Cytoplasm |
| Ligand | ATP-binding Magnesium Metal-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Kinase Transferase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | nucleoside metabolic process Inferred from electronic annotation. Source: InterPro nucleotide biosynthetic processInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Cellular component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | ATP binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW kinase activityInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW magnesium ion bindingInferred from electronic annotation. Source: InterPro ribose phosphate diphosphokinase activityInferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 284 | 284 | Ribose-phosphate pyrophosphokinase HAMAP MF_00583_A | PRO_0000141238 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 205 – 218 | 14 | Binding of phosphoribosylpyrophosphate Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 123 | 1 | Magnesium Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 125 | 1 | Magnesium Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2 – 5 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 10 – 19 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 27 – 31 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 37 – 41 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 47 – 53 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 59 – 74 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 75 – 77 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 80 – 84 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 104 – 115 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 117 – 123 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 127 – 132 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 137 – 140 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 143 – 150 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 151 – 153 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 158 – 163 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 164 – 166 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 167 – 177 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 181 – 184 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 198 – 200 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 208 – 214 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 216 – 218 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 219 – 230 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 235 – 242 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 249 – 256 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 259 – 264 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 272 – 274 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 277 – 281 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Complete genome sequence of the methanogenic archaeon, Methanococcus jannaschii." Bult C.J., White O., Olsen G.J., Zhou L., Fleischmann R.D., Sutton G.G., Blake J.A., FitzGerald L.M., Clayton R.A., Gocayne J.D., Kerlavage A.R., Dougherty B.A., Tomb J.-F., Adams M.D., Reich C.I., Overbeek R., Kirkness E.F., Weinstock K.G. Venter J.C.Science 273:1058-1073(1996) [PubMed: 8688087] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | L77117 Genomic DNA. Translation: AAB99374.1. Different initiation. | ||||||||||||||||||
| PIR | E64470. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_248369.1. NC_000909.1. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q58761. | ||||||||||||||||||
| SMR | Q58761. Positions 1-284. | ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| GeneID | 1452269. | ||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus MJ1366 in contig L77117_GR. | ||||||||||||||||||
| KEGG | mja:MJ_1366. | ||||||||||||||||||
| NMPDR | fig|243232.1.peg.1406. | ||||||||||||||||||
| TIGR | MJ1366. | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG519284. | ||||||||||||||||||
| OMA | TGREPIS. | ||||||||||||||||||
| ProtClustDB | PRK00934. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| BioCyc | MJAN243232:MJ_1366-MONOMER. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| HAMAP | MF_00583_A. RibP_PPkinase_A. [Tree] | ||||||||||||||||||
| InterPro | IPR000836. PRibTrfase. IPR005946. Rib-P_diPkinase. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| KO | K00948. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00156. Pribosyltran. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01251. RibP_PPkin. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00114. PRPP_SYNTHASE. False negative. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | KPRS_METJA | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q58761 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| Methanococcus jannaschii Methanococcus jannaschii: entries and gene names |
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with