Q58504 (KHSE_METJA) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
November 16, 2011.
Version 91.
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| Protein names | Recommended name: Homoserine kinase Short name=HK Short name=HSK EC=2.7.1.39 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Methanocaldococcus jannaschii (strain ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440) (Methanococcus jannaschii) | ||||
| Taxonomic identifier | 243232 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Archaea › Euryarchaeota › Methanococci › Methanococcales › Methanocaldococcaceae › Methanocaldococcus |
Protein attributes
| Sequence length | 296 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes the ATP-dependent phosphorylation of L-homoserine to L-homoserine phosphate By similarity. HAMAP MF_00384 |
| Catalytic activity | ATP + L-homoserine = ADP + O-phospho-L-homoserine. HAMAP MF_00384 |
| Pathway | Amino-acid biosynthesis; L-threonine biosynthesis; L-threonine from L-aspartate: step 4/5. HAMAP MF_00384 |
| Subcellular location | Cytoplasm Potential HAMAP MF_00384. |
| Sequence similarities | Belongs to the GHMP kinase family. Homoserine kinase subfamily. |
| Sequence caution | The sequence AAB99107.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Amino-acid biosynthesis Threonine biosynthesis |
| Cellular component | Cytoplasm |
| Ligand | ATP-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Kinase Transferase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | threonine biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Cellular component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | ATP binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW homoserine kinase activityInferred from electronic annotation. Source: EC |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 296 | 296 | Homoserine kinase HAMAP MF_00384 | PRO_0000156641 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide binding | 86 – 96 | 11 | ATP Potential | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2 – 12 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 14 – 20 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 21 – 40 | 20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 42 – 47 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 55 – 57 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 59 – 71 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 76 – 82 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 89 – 91 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 93 – 108 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 115 – 130 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 138 – 143 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 145 – 151 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 152 – 155 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 156 – 160 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 167 – 171 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 179 – 185 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 188 – 191 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 192 – 210 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 214 – 221 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 228 – 232 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 238 – 244 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 245 – 248 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 249 – 254 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 261 – 265 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 267 – 269 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 270 – 280 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 284 – 289 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
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References
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| [1] | "Complete genome sequence of the methanogenic archaeon, Methanococcus jannaschii." Bult C.J., White O., Olsen G.J., Zhou L., Fleischmann R.D., Sutton G.G., Blake J.A., FitzGerald L.M., Clayton R.A., Gocayne J.D., Kerlavage A.R., Dougherty B.A., Tomb J.-F., Adams M.D., Reich C.I., Overbeek R., Kirkness E.F., Weinstock K.G. Venter J.C.Science 273:1058-1073(1996) [PubMed: 8688087] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 43067 / DSM 2661 / JAL-1 / JCM 10045 / NBRC 100440. |
| [2] | "Structure and mechanism of homoserine kinase: prototype for the GHMP kinase superfamily." Zhou T., Daugherty M., Grishin N.V., Osterman A.L., Zhang H. Structure 8:1247-1257(2000) [PubMed: 11188689] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.1 ANGSTROMS). |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | L77117 Genomic DNA. Translation: AAB99107.1. Different initiation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | G64437. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_248097.1. NC_000909.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q58504. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | Q58504. Positions 1-296. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 1452001. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus MJ1104 in contig L77117_GR. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | mja:MJ_1104. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NMPDR | fig|243232.1.peg.1134. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGR | MJ1104. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG646290. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | GSAHADN. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtClustDB | PRK01212. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc | MetaCyc:MONOMER-14633. MJAN243232:MJ_1104-MONOMER. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HAMAP | MF_00384. Homoser_kinase. [Tree] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR006204. GHMP_kinase. IPR013750. GHMP_kinase_C. IPR006203. GHMP_knse_ATP-bd_CS. IPR000870. Homoserine_kinase. IPR020568. Ribosomal_S5_D2-typ_fold. IPR014721. Ribosomal_S5_D2-typ_fold_subgr. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.30.230.10. Ribosomal_S5_D2-type_fold. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K00872. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF08544. GHMP_kinases_C. 1 hit. PF00288. GHMP_kinases_N. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIRSF | PIRSF000676. Homoser_kin. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PRINTS | PR00958. HOMSERKINASE. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF54211. Ribosomal_S5_D2-typ_fold. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00191. ThrB. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00627. GHMP_KINASES_ATP. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | KHSE_METJA | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q58504 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| Methanococcus jannaschii Methanococcus jannaschii: entries and gene names |
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with