Q56312 (CHEY_THEMA) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 95.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Chemotaxis protein CheY | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / MSB8 / DSM 3109 / JCM 10099) [Reference proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 243274 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Thermotogae › Thermotogales › Thermotogaceae › Thermotoga › ![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 120 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Involved in the transmission of sensory signals from the chemoreceptors to the flagellar motors. CheY seems to regulate the clockwise (CW) rotation By similarity. |
| Cofactor | Binds 1 magnesium ion per subunit. |
| Subcellular location | |
| Post-translational modification | Phosphorylated by CheA By similarity. |
| Sequence similarities | Contains 1 response regulatory domain. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Biological process | Chemotaxis Flagellar rotation Two-component regulatory system |
| Cellular component | Cytoplasm |
| Ligand | Magnesium Metal-binding |
| PTM | Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | chemotaxis Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW ciliary or flagellar motilityInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW intracellular signal transductionInferred from electronic annotation. Source: GOC regulation of transcription, DNA-dependentInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Cellular_component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular_function | metal ion binding Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW phosphorelay response regulator activityInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 120 | 120 | Chemotaxis protein CheY | PRO_0000081055 | ||||||||||||||||||||||||||
Regions | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Domain | 1 – 119 | 119 | Response regulatory | |||||||||||||||||||||||||||
Sites | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 9 | 1 | Magnesium | |||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 10 | 1 | Magnesium | |||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 54 | 1 | Magnesium | |||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 56 | 1 | Magnesium; via carbonyl oxygen | |||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 54 | 1 | 4-aspartylphosphate | |||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 4 – 8 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 12 – 24 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 28 – 35 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 36 – 46 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 49 – 54 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 58 – 60 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 62 – 72 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 78 – 82 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 87 – 95 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 100 – 105 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 108 – 118 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Thermostable chemotaxis proteins from the hyperthermophilic bacterium Thermotoga maritima." Swanson R.V., Sanna M.G., Simon M.I. J. Bacteriol. 178:484-489(1996) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA], CHARACTERIZATION. |
| [2] | "Evidence for lateral gene transfer between Archaea and Bacteria from genome sequence of Thermotoga maritima." Nelson K.E., Clayton R.A., Gill S.R., Gwinn M.L., Dodson R.J., Haft D.H., Hickey E.K., Peterson J.D., Nelson W.C., Ketchum K.A., McDonald L.A., Utterback T.R., Malek J.A., Linher K.D., Garrett M.M., Stewart A.M., Cotton M.D., Pratt M.S. Fraser C.M.Nature 399:323-329(1999) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 43589 / MSB8 / DSM 3109 / JCM 10099. |
| [3] | "Crystal structures of CheY from Thermotoga maritima do not support conventional explanations for the structural basis of enhanced thermostability." Usher K.C., de la Cruz A.F.A., Dahlquist F.W., Swanson R.V., Simon M.I., Remington S.J. Protein Sci. 7:403-412(1998) [PubMed] [Europe PMC] [Abstract] Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (1.9 ANGSTROMS). |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | U30501 Genomic DNA. Translation: AAA96389.1. AE000512 Genomic DNA. Translation: AAD35782.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | B72346. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_228509.1. NC_000853.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q56312. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | Q56312. Positions 2-119. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IntAct | Q56312. 1 interaction. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | 243274.TM0700. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EnsemblBacteria | AAD35782; AAD35782; TM_0700. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 898367. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | tma:TM0700. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PATRIC | 23936318. VBITheMar51294_0712. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG0784. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K03413. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | PFQAPKV. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtClustDB | CLSK875308. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR011006. CheY-like_superfamily. IPR001789. Sig_transdc_resp-reg_receiver. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF00072. Response_reg. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00448. REC. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF52172. CheY_like. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS50110. RESPONSE_REGULATORY. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q56312. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | CHEY_THEMA | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q56312 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
