Q53W92 (SURE_THET8) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
January 25, 2012.
Version 41.
History...
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize order
Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: 5'-nucleotidase surE EC=3.1.3.5 Alternative name(s): Nucleoside 5'-monophosphate phosphohydrolase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Encoded on | Plasmid pTT27 | ||||
| Organism | Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) | ||||
| Taxonomic identifier | 300852 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Deinococcus-Thermus › Deinococci › Thermales › Thermaceae › Thermus |
Protein attributes
| Sequence length | 244 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Nucleotidase that shows phosphatase activity on nucleoside 5'-monophosphates By similarity. HAMAP MF_00060 |
| Catalytic activity | A 5'-ribonucleotide + H2O = a ribonucleoside + phosphate. HAMAP MF_00060 |
| Cofactor | Binds 1 divalent metal cation per subunit By similarity. |
| Subcellular location | Cytoplasm Potential HAMAP MF_00060. |
| Sequence similarities | Belongs to the surE nucleotidase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cytoplasm |
| Ligand | Metal-binding Nucleotide-binding |
| Molecular function | Hydrolase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Plasmid Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Cellular component | cytoplasm Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | 5'-nucleotidase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC metal ion bindingInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW nucleotide bindingInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 244 | 244 | 5'-nucleotidase surE HAMAP MF_00060 | PRO_0000235662 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 8 | 1 | Divalent metal cation By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 9 | 1 | Divalent metal cation By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 39 | 1 | Divalent metal cation By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 96 | 1 | Divalent metal cation By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 2 – 6 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 14 – 24 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 27 – 34 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 51 – 55 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 67 – 72 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 74 – 84 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 90 – 98 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 102 – 107 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 109 – 119 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 123 – 129 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 138 – 154 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 160 – 164 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 171 – 174 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 186 – 190 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 196 – 200 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 203 – 206 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 213 – 218 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 221 – 227 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| [1] | "Complete genome sequence of Thermus thermophilus HB8." Masui R., Kurokawa K., Nakagawa N., Tokunaga F., Koyama Y., Shibata T., Oshima T., Yokoyama S., Yasunaga T., Kuramitsu S. Submitted (NOV-2004) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: HB8 / ATCC 27634 / DSM 579. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | AP008227 Genomic DNA. Translation: BAD71866.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | YP_145309.1. NC_006462.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q53W92. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | Q53W92. Positions 1-243. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| STRING | Q53W92. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 3169602. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus TTHB070 in contig AP008227_GR. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | ttj:TTHB070. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NMPDR | fig|300852.3.peg.2057. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PATRIC | 23959066. VBITheThe93045_2014. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| eggNOG | COG0496. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG600532. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | GHEIWHS. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PhylomeDB | Q53W92. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtClustDB | CLSK738894. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc | TTHE300852:TTHB070-MONOMER. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HAMAP | MF_00060. SurE. [Tree] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR002828. SurE-like_Pase/nucleotidase. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.40.1210.10. SurE-like_Pase/nucleotidase. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K03787. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF01975. SurE. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF64167. SurE-like_Pase/nucleotidase. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00087. SurE. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | SURE_THET8 | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q53W92 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with