Q51507 (PCHB_PSEAE) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
January 25, 2012.
Version 78.
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| Protein names | Recommended name: Salicylate biosynthesis protein pchB | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / PAO1 / 1C / PRS 101 / LMG 12228) | ||||
| Taxonomic identifier | 208964 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Gammaproteobacteria › Pseudomonadales › Pseudomonadaceae › Pseudomonas |
Protein attributes
| Sequence length | 101 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Function | Has isochorismate-pyruvate lyase activity. Probably involved in the conversion of isochorismate to salicylate and pyruvate. |
| Pathway | |
| Sequence similarities | Contains 1 chorismate mutase domain. |
| Sequence caution | The sequence CAA57968.1 differs from that shown. Reason: Erroneous initiation. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Molecular function | Lyase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | chorismate metabolic process Inferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Molecular function | lyase activity Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 101 | 101 | Salicylate biosynthesis protein pchB | PRO_0000119198 | |||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||
| Domain | 4 – 94 | 91 | Chorismate mutase | ||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||
| Turn | 4 – 6 | 3 | |||||||||||||||
| Helix | 10 – 39 | 30 | |||||||||||||||
| Helix | 51 – 67 | 17 | |||||||||||||||
| Helix | 72 – 94 | 23 | |||||||||||||||
Sequences
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | "Structural genes for salicylate biosynthesis from chorismate in Pseudomonas aeruginosa." Serino L., Reimmann C., Baur H., Beyeler M., Visca P., Haas D. Mol. Gen. Genet. 249:217-228(1995) [PubMed: 7500944] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 15692 / PAO1 / 1C / PRS 101 / LMG 12228. |
| [2] | "Complete genome sequence of Pseudomonas aeruginosa PAO1, an opportunistic pathogen." Stover C.K., Pham X.-Q.T., Erwin A.L., Mizoguchi S.D., Warrener P., Hickey M.J., Brinkman F.S.L., Hufnagle W.O., Kowalik D.J., Lagrou M., Garber R.L., Goltry L., Tolentino E., Westbrock-Wadman S., Yuan Y., Brody L.L., Coulter S.N., Folger K.R. Olson M.V.Nature 406:959-964(2000) [PubMed: 10984043] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. Strain: ATCC 15692 / PAO1 / 1C / PRS 101 / LMG 12228. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | X82644 Genomic DNA. Translation: CAA57968.1. Different initiation. AE004091 Genomic DNA. Translation: AAG07618.1. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIR | A83117. S58228. S60202. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_252920.1. NC_002516.2. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q51507. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMR | Q51507. Positions 1-100. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GeneID | 881846. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus PA4230 in contig AE004091_GR. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG | pae:PA4230. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PATRIC | 19843150. VBIPseAer58763_4431. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PseudoCAP | PA4230. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG704249. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OMA | NGWPARI. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtClustDB | PRK07075. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc | MetaCyc:MONOMER-15305. PAER208964:PA4230-MONOMER. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InterPro | IPR002701. Chorismate_mutase. IPR020822. Chorismate_mutase_type_II. IPR008241. Isochorismate_pyruvate-lyase. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:1.20.59.10. Chorismate_mutase. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KO | K04782. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pfam | PF01817. CM_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PIRSF | PIRSF029775. Isochor_pyr_lyas. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMART | SM00830. CM_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SUPFAM | SSF48600. Chorismate_mut. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01803. CM-like. 1 hit. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PROSITE | PS51168. CHORISMATE_MUT_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | PCHB_PSEAE | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q51507 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with