Q46803 (YGEW_ECOLI) Reviewed, UniProtKB/Swiss-Prot
Last modified
May 1, 2013.
Version 89.
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Names·Attributes·General annotation·Ontologies·Sequence annotation·Sequences·References·Cross-refs·Entry info·DocumentsCustomize orderNames and origin
| Protein names | Recommended name: Uncharacterized protein YgeW | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Escherichia coli (strain K12) [Reference proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 83333 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Gammaproteobacteria › Enterobacteriales › Enterobacteriaceae › Escherichia › ![]() |
Protein attributes
| Sequence length | 396 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level |
General annotation (Comments)
| Sequence similarities | Belongs to the ATCase/OTCase family. |
| Sequence caution | The sequence AAA83051.1 differs from that shown. Reason: Frameshift at positions 18 and 373. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Reference proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological_process | 'de novo' pyrimidine nucleobase biosynthetic process Inferred from electronic annotation. Source: InterPro cellular amino acid metabolic processInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Molecular_function | amino acid binding Inferred from electronic annotation. Source: InterPro aspartate carbamoyltransferase activityInferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 396 | 396 | Uncharacterized protein YgeW | PRO_0000113263 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 2 – 13 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 19 – 21 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 27 – 29 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 32 – 50 | 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 62 – 68 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 77 – 85 | 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 88 – 91 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 105 – 111 | 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 116 – 123 | 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 133 – 146 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 155 – 160 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 166 – 180 | 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 181 – 183 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 184 – 186 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 190 – 194 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 206 – 215 | 10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 216 – 218 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 221 – 225 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 234 – 247 | 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 250 – 255 | 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 257 – 261 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 265 – 269 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 275 – 286 | 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 290 – 305 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 306 – 309 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 314 – 318 | 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 321 – 323 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 339 – 342 | 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 344 – 346 | 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 347 – 362 | 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 364 – 376 | 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 380 – 390 | 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | U28375 Genomic DNA. Translation: AAA83051.1. Frameshift. U00096 Genomic DNA. Translation: AAT48152.1. AP009048 Genomic DNA. Translation: BAE76936.1. | ||||||||||||
| PIR | F65070. | ||||||||||||
| RefSeq | YP_026185.1. NC_000913.2. YP_491072.1. NC_007779.1. | ||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||
| ProteinModelPortal | Q46803. | ||||||||||||
| SMR | Q46803. Positions 1-396. | ||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||
| STRING | 511145.b2870. | ||||||||||||
Protocols and materials databases | |||||||||||||
| StructuralBiologyKnowledgebase | Search... | ||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||
| EnsemblBacteria | AAT48152; AAT48152; b2870. BAE76936; BAE76936; BAE76936. | ||||||||||||
| GeneID | 12932516. 945826. | ||||||||||||
| KEGG | ecj:Y75_p2803. eco:b2870. | ||||||||||||
| PATRIC | 32121150. VBIEscCol129921_2963. | ||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||
| EchoBASE | EB2865. | ||||||||||||
| EcoGene | EG13053. ygeW. | ||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||
| eggNOG | COG0078. | ||||||||||||
| HOGENOM | HOG000022686. | ||||||||||||
| OMA | AHPEGYE. | ||||||||||||
| ProtClustDB | PRK07200. | ||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||
| BioCyc | EcoCyc:G7489-MONOMER. ECOL316407:JW5463-MONOMER. | ||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||
| Genevestigator | Q46803. | ||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||
| InterPro | IPR006132. Asp/Orn_carbamoyltranf_P-bd. IPR006130. Asp/Orn_carbamoylTrfase. IPR002082. Asp_carbamoyltransf. IPR006131. Asp_carbamoyltransf_Asp/Orn-bd. IPR017702. Carbamoyltransferase_YgeW. [Graphical view] | ||||||||||||
| Pfam | PF00185. OTCace. 1 hit. PF02729. OTCace_N. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||
| PRINTS | PR00100. AOTCASE. PR00101. ATCASE. | ||||||||||||
| SUPFAM | SSF53671. Asp/Orn_carbamoyltranf. 1 hit. | ||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR03316. ygeW. 1 hit. | ||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||
Other | |||||||||||||
| EvolutionaryTrace | Q46803. | ||||||||||||
Entry information
| Entry name | YGEW_ECOLI | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q46803 Secondary accession number(s): Q2M9X0, Q6BF62 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation program | Prokaryotic Protein Annotation Program | ||||||||
Relevant documents
| Escherichia coli Escherichia coli (strain K12): entries and cross-references to EcoGene |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with
