Reviewed,
UniProtKB/Swiss-Prot Q3JRF0 (MSRB_BURP1)
Last modified
February 9, 2010.
Version 30.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (2) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Peptide methionine sulfoxide reductase msrB EC=1.8.4.12 Alternative name(s): Peptide-methionine (R)-S-oxide reductase | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Burkholderia pseudomallei (strain 1710b) [Complete proteome] [HAMAP] | ||||
| Taxonomic identifier | 320372 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Bacteria › Proteobacteria › Betaproteobacteria › Burkholderiales › Burkholderiaceae › Burkholderia › pseudomallei group |
Protein attributes
| Sequence length | 143 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Catalytic activity | Peptide-L-methionine + thioredoxin disulfide + H2O = peptide-L-methionine (R)-S-oxide + thioredoxin. HAMAP MF_01400 |
| Cofactor | Binds 1 zinc ion per subunit. The zinc ion is important for the structural integrity of the protein. HAMAP MF_01400 |
| Sequence similarities | Belongs to the msrB Met sulfoxide reductase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Ligand | Metal-binding Zinc |
| Molecular function | Oxidoreductase |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | oxidation reduction Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Molecular function | peptide-methionine (R)-S-oxide reductase activity Inferred from electronic annotation. Source: EC peptide-methionine-(S)-S-oxide reductase activityInferred from electronic annotation. Source: HAMAP zinc ion bindingInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 143 | 143 | Peptide methionine sulfoxide reductase msrB HAMAP MF_01400 | PRO_0000338617 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Active site | 128 | 1 | Nucleophile By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 55 | 1 | Zinc HAMAP MF_01400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 58 | 1 | Zinc HAMAP MF_01400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 104 | 1 | Zinc HAMAP MF_01400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 107 | 1 | Zinc HAMAP MF_01400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 16 – 22 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 25 – 33 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 43 – 46 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 50 – 55 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 56 – 58 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 61 – 64 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 65 – 67 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 73 – 75 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 77 – 80 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 86 – 92 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 99 – 104 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 105 – 107 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 110 – 116 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 120 – 123 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 126 – 129 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 131 – 133 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 134 – 138 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
| « Hide 'large scale' references | |
| [1] | Woods D.E., Nierman W.C. Submitted (SEP-2005) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA]. |
| [2] | "Methionine-R-sulfoxide reductase from Burkholderia pseudomallei." Seattle structural genomics center for infectious disease (SSGCID) Submitted (MAR-2008) to the PDB data bank Cited for: X-RAY CRYSTALLOGRAPHY (2.1 ANGSTROMS) IN COMPLEX WITH ZINC IONS. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | CP000124 Genomic DNA. Translation: ABA49928.1. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | YP_333853.1. | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| STRING | Q3JRF0. | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| GeneID | 3690705. | ||||||||||||||||||
| GenomeReviews | Gene locus BURPS1710b_2458 in contig CP000124_GR. | ||||||||||||||||||
| KEGG | bpm:BURPS1710b_2458. | ||||||||||||||||||
| TIGR | BURPS1710b_2458. | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| eggNOG | COG0229. | ||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG715255. | ||||||||||||||||||
| OMA | VEVRCNH. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| HAMAP | MF_01400. MsrB. [Tree] | ||||||||||||||||||
| InterPro | IPR002579. Methionine_sulphoxide_MsrB. IPR011057. Mss4-like. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:2.170.150.20. MsrB. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF01641. SelR. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR00357. MsrB. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | MSRB_BURP1 | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q3JRF0 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HAMAP (High-quality Automated and Manual Annotation of microbial Proteomes) | ||||||||
Relevant documents
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


