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UniProtKB/Swiss-Prot Q16790 (CAH9_HUMAN)
Last modified
January 19, 2010.
Version 100.
History...
Clusters with 100%,
90%,
50% identity |
Documents (6) |
Third-party data |
Customize display | text xml rdf/xml gff fasta |
Names and origin
| Protein names | Recommended name: Carbonic anhydrase 9 EC=4.2.1.1 Alternative name(s): Carbonic anhydrase IX Short name=CA-IX Short name=CAIX Carbonate dehydratase IX Membrane antigen MN P54/58N Renal cell carcinoma-associated antigen G250 Short name=RCC-associated antigen G250 pMW1 | ||||
| Gene names |
| ||||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 459 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is further processed into a mature form. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Reversible hydration of carbon dioxide. Participates in pH regulation. May be involved in the control of cell proliferation and transformation. Appears to be a novel specific biomarker for a cervical neoplasia. Ref.10 |
| Catalytic activity | H2CO3 = CO2 + H2O. |
| Cofactor | Zinc By similarity. |
| Subunit structure | Forms oligomers linked by disulfide bonds. Ref.10 |
| Subcellular location | Nucleus. Nucleus › nucleolus. Cell membrane; Single-pass type I membrane protein. Cell projection › microvillus membrane; Single-pass type I membrane protein. Note: Found on the surface microvilli and in the nucleus, particularly in nucleolus. Ref.8 |
| Tissue specificity | Expressed primarily in carcinoma cells lines. Expression is restricted to very few normal tissues and the most abundant expression is found in the epithelial cells of gastric mucosa. |
| Induction | By hypoxia. Ref.10 |
| Post-translational modification | Asn-346 bears high-mannose type glycan structures. |
| Sequence similarities | Belongs to the alpha-carbonic anhydrase family. |
Ontologies
| Keywords | |
|---|---|
| Cellular component | Cell membrane Cell projection Membrane Nucleus |
| Coding sequence diversity | Polymorphism |
| Domain | Signal Transmembrane |
| Ligand | Metal-binding Zinc |
| Molecular function | Lyase |
| PTM | Disulfide bond Glycoprotein Phosphoprotein |
| Technical term | 3D-structure Complete proteome Direct protein sequencing |
| Gene Ontology (GO) | |
| Biological process | one-carbon metabolic process Inferred from electronic annotation. Source: InterPro |
| Cellular component | cell projection Inferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW integral to membraneTraceable author statement. Source: ProtInc nucleolusInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-SubCell |
| Molecular function | carbonate dehydratase activity Traceable author statement. Source: ProtInc zinc ion bindingInferred from electronic annotation. Source: UniProtKB-KW |
| Complete GO annotation... | |
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Signal peptide | 1 – 37 | 37 | Ref.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chain | 38 – 459 | 422 | Carbonic anhydrase 9 | PRO_0000004243 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 38 – 414 | 377 | Extracellular | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Transmembrane | 415 – 435 | 21 | Potential | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Topological domain | 436 – 459 | 24 | Cytoplasmic | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 38 – 112 | 75 | Proteoglycan-like (PG) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 113 – 414 | 302 | Catalytic | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 226 | 1 | Zinc; catalytic By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 228 | 1 | Zinc; catalytic By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metal binding | 251 | 1 | Zinc; catalytic By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 449 | 1 | Phosphotyrosine Ref.9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 115 | 1 | O-linked (GlcNAc...) Ref.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Glycosylation | 346 | 1 | N-linked (GlcNAc...) Ref.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 156 ↔ 336 | Ref.10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Disulfide bond | 174 | Interchain Probable | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 33 | 1 | V → M: dbSNP rs2071676. Ref.1 Ref.5 | VAR_010787 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 326 | 1 | Q → R: dbSNP rs3829078. | VAR_020049 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 149 – 152 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 154 – 156 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 168 – 170 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 171 – 173 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 181 – 183 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 193 – 197 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 202 – 205 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 211 – 213 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 219 – 228 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 239 – 241 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 247 – 256 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 262 – 265 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 273 – 280 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 287 – 293 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 294 – 299 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 305 – 308 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 313 – 316 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 324 – 327 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 341 – 347 | 7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 353 – 361 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 387 – 389 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EMBL GenBank DDBJ | X66839 mRNA. Translation: CAA47315.1. AJ010588 mRNA. Translation: CAB82444.1. AL133410, AL357874 Genomic DNA. Translation: CAI10985.1. AL357874, AL133410 Genomic DNA. Translation: CAI13455.1. CH471071 Genomic DNA. Translation: EAW58359.1. BC014950 mRNA. Translation: AAH14950.1. | ||||||||||||||||||
| IPI | IPI00003966. | ||||||||||||||||||
| PIR | I38013. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_001207.2. | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.63287 | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| PDBe RCSB PDB PDBj |
| ||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| STRING | Q16790. | ||||||||||||||||||
PTM databases | |||||||||||||||||||
| PhosphoSite | Q16790. | ||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||
| PRIDE | Q16790. | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000378357; ENSP00000367608; ENSG00000107159; Homo sapiens. [Genome view] | ||||||||||||||||||
| GeneID | 768. | ||||||||||||||||||
| KEGG | hsa:768. | ||||||||||||||||||
| UCSC | uc003zxo.2. human. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CTD | 768. | ||||||||||||||||||
| GeneCards | GC09P035663. | ||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:1383. CA9. | ||||||||||||||||||
| HPA | CAB005100. CAB017107. | ||||||||||||||||||
| MIM | 603179. gene. | ||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA24384. | ||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| HOGENOM | HBG717384. | ||||||||||||||||||
| HOVERGEN | Q16790. | ||||||||||||||||||
| InParanoid | Q16790. | ||||||||||||||||||
| OMA | FRATQPL. | ||||||||||||||||||
| OrthoDB | EOG92FW3C. | ||||||||||||||||||
| PhylomeDB | Q16790. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| BRENDA | 4.2.1.1. 247. | ||||||||||||||||||
| Pathway_Interaction_DB | hif1_tfpathway. HIF-1-alpha transcription factor network. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q16790. | ||||||||||||||||||
| Bgee | Q16790. | ||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_CA9. | ||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q16790. | ||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000107159. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR001148. Carbonic_anhydrase_a-class_cat. IPR018338. Carbonic_anhydrase_a-class_CS. IPR018429. Carbonic_anhydrase_CA9. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.10.200.10. Euk_COanhd. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR18952:SF18. Carbonic_anhydrase_CA9. 1 hit. PTHR18952. Euk_COanhd. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00194. Carb_anhydrase. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| PROSITE | PS00162. ALPHA_CA_1. 1 hit. PS51144. ALPHA_CA_2. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||
| NextBio | 3106. | ||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | CAH9_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q16790 Secondary accession number(s): Q5T4R1 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 9 Human chromosome 9: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


