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UniProtKB/Swiss-Prot Q16719 (KYNU_HUMAN)
Last modified
November 3, 2009.
Version 85.
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90%,
50% identity |
Documents (7) |
Third-party data |
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Names and origin
| Protein names | Recommended name: Kynureninase EC=3.7.1.3 Alternative name(s): L-kynurenine hydrolase | ||
| Gene names |
| ||
| Organism | Homo sapiens (Human) [Complete proteome] | ||
| Taxonomic identifier | 9606 [NCBI] | ||
| Taxonomic lineage | Eukaryota › Metazoa › Chordata › Craniata › Vertebrata › Euteleostomi › Mammalia › Eutheria › Euarchontoglires › Primates › Haplorrhini › Catarrhini › Hominidae › Homo |
Protein attributes
| Sequence length | 465 AA. |
| Sequence status | Complete. |
| Sequence processing | The displayed sequence is not processed. |
| Protein existence | Evidence at protein level. |
General annotation (Comments)
| Function | Catalyzes the cleavage of L-kynurenine (L-Kyn) and L-3-hydroxykynurenine (L-3OHKyn) into anthranilic acid (AA) and 3-hydroxyanthranilic acid (3-OHAA), respectively. Has a preference for the L-3-hydroxy form. Also has cysteine-conjugate-beta-lyase activity. |
| Catalytic activity | L-kynurenine + H2O = anthranilate + L-alanine. Ref.1 Ref.2 Ref.4 Ref.5 L-3-hydroxykynurenine + H2O = 3-hydroxyanthranilate + L-alanine. Ref.1 Ref.2 Ref.4 Ref.5 |
| Cofactor | Pyridoxal phosphate. |
| Enzyme regulation | |
| Pathway | Cofactor biosynthesis; NAD(+) biosynthesis; quinolinate from L-kynurenine: step 2/3. |
| Subunit structure | Homodimer. Ref.5 |
| Subcellular location | |
| Tissue specificity | Expressed in all tissues tested (heart, brain placenta, lung, liver, skeletal muscle, kidney and pancreas). Highest levels found in placenta, liver and lung. Expressed in all brain regions. Ref.1 Ref.2 |
| Induction | Increased levels in several cerebral and systemic inflammatory conditions. |
| Involvement in disease | Defects in KYNU may be a cause of hydroxykynureninuria [MIM:236800]; also known as kynureninase deficiency. Hydroxykynureninuria is characterized by urinary excretion of large amounts of kynurenine, 3-hydroxykynurenine and xanthurenic acid. This suggests a block in the conversion of kynurenine and 3-hydroxykynurenine to anthranilate and 3-hydroxyanthranilate, respectively, which leads to impaired niacin biosynthesis. Hydroxykynureninuria can be associated with psychomotor retardation and non-progressive encephalopathy. Ref.6 |
| Sequence similarities | Belongs to the kynureninase family. |
| Caution | It has been reported that this enzyme possesses no measurable activity against L-kynurenine and is subject to inhibition by both L-kynurenine and D-kynurenine at pH 7.9 (Ref.4). |
| Biophysicochemical properties | Kinetic parameters: KM=493 µM for L-kynurenine (at pH 7.0) KM=28.3 µM for DL-3-hydroxykynurenine (at pH 7.0) KM=3.0 µM for DL-3-hydroxykynurenine (at pH 7.9) pH dependence: Optimum pH is 8.25 with DL-3-hydroxykynurenine as substrate. |
| Mass spectrometry | Molecular mass is 52400 Da from positions 1 - 465. Determined by MALDI. The reported mass is given to only three significant figures. Ref.4 |
Ontologies
Sequence annotation (Features)
| Feature key | Position(s) | Length | Description | Graphical view | Feature identifier | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecule processing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chain | 1 – 465 | 465 | Kynureninase | PRO_0000218657 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Regions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Region | 165 – 168 | 4 | Pyridoxal phosphate binding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sites | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 137 | 1 | Pyridoxal phosphate; via amide nitrogen By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 138 | 1 | Pyridoxal phosphate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 250 | 1 | Pyridoxal phosphate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 253 | 1 | Pyridoxal phosphate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 275 | 1 | Pyridoxal phosphate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 305 | 1 | Pyridoxal phosphate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Binding site | 333 | 1 | Pyridoxal phosphate | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Amino acid modifications | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 1 | 1 | N-acetylmethionine By similarity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Modified residue | 276 | 1 | N6-(pyridoxal phosphate)lysine | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Natural variations | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 188 | 1 | R → Q: dbSNP rs2304705. | VAR_049724 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 198 | 1 | T → A in hydroxykynureninuria. Ref.6 | VAR_054401 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Natural variant | 412 | 1 | K → E: dbSNP rs9013. Ref.3 | VAR_022092 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Secondary structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Helix Strand Turn | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 9 – 20 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 27 – 36 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 40 – 45 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 51 – 53 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 59 – 61 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 73 – 75 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 83 – 97 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 98 – 102 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 104 – 107 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 109 – 111 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 112 – 116 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 117 – 120 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 121 – 124 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 128 – 130 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 131 – 133 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 137 – 148 | 12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 153 – 155 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 157 – 161 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 166 – 178 | 13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 183 – 186 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 187 – 190 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 201 – 211 | 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 212 – 214 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 215 – 223 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 225 – 227 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 233 – 242 | 10 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 246 – 250 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 252 – 257 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 262 – 265 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 269 – 272 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 274 – 276 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 287 – 290 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 292 – 294 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 295 – 297 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 305 – 307 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 310 – 313 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 326 – 329 | 4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 336 – 352 | 17 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 354 – 375 | 22 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 388 – 390 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 396 – 398 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 403 – 407 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 414 – 419 | 6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 420 – 422 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 426 – 428 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 429 – 431 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Beta strand | 432 – 436 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Turn | 439 – 441 | 3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Helix | 444 – 458 | 15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequences
| ||||||||||||||||||
References
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| [1] | "Isolation and expression of a cDNA clone encoding human kynureninase." Alberati-Giani D., Buchli R., Malherbe P., Broger C., Lang G., Koehler C., Lahm H.-W., Cesura A.M. Eur. J. Biochem. 239:460-468(1996) [PubMed: 8706755] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], SUBCELLULAR LOCATION, TISSUE SPECIFICITY, CATALYTIC ACTIVITY, ENZYME REGULATION, BIOPHYSICOCHEMICAL PROPERTIES. Tissue: Hepatoma. |
| [2] | "Cloning and recombinant expression of rat and human kynureninase." Toma S., Nakamura M., Tone S., Okuno E., Kido R., Breton J., Avanzi N., Cozzi L., Speciale C., Mostardini M., Gatti S., Benatti L. FEBS Lett. 408:5-10(1997) [PubMed: 9180257] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [MRNA], TISSUE SPECIFICITY, CATALYTIC ACTIVITY, ENZYME REGULATION, BIOPHYSICOCHEMICAL PROPERTIES. Tissue: Liver. |
| [3] | "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs." Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., Otsuki T., Sugiyama T., Irie R., Wakamatsu A., Hayashi K., Sato H., Nagai K., Kimura K., Makita H., Sekine M., Obayashi M., Nishi T., Shibahara T., Tanaka T., Ishii S. Sugano S.Nat. Genet. 36:40-45(2004) [PubMed: 14702039] [Abstract] Cited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE MRNA], VARIANT GLU-412. Tissue: Synovium. |
| [4] | "Purification and biochemical characterization of some of the properties of recombinant human kynureninase." Walsh H.A., Botting N.P. Eur. J. Biochem. 269:2069-2074(2002) [PubMed: 11985583] [Abstract] Cited for: MASS SPECTROMETRY, CATALYTIC ACTIVITY, BIOPHYSICOCHEMICAL PROPERTIES. |
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| [6] | "Xanthurenic aciduria due to a mutation in KYNU encoding kynureninase." Christensen M., Duno M., Lund A.M., Skovby F., Christensen E. J. Inherit. Metab. Dis. 30:248-255(2007) [PubMed: 17334708] [Abstract] Cited for: VARIANT HYDROXYKYNURENINURIA ALA-198. |
| + | Additional computationally mapped references. |
Cross-references
Sequence databases | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| U57721 mRNA. Translation: AAC50650.1. AK315343 mRNA. Translation: BAG37742.1. | |||||||||||||||||||
| IPI | IPI00003818. | ||||||||||||||||||
| PIR | G02652. | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NP_003928.1. | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.470126 | ||||||||||||||||||
3D structure databases | |||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||
| ModBase | Search... | ||||||||||||||||||
Protein-protein interaction databases | |||||||||||||||||||
| STRING | Q16719. | ||||||||||||||||||
Proteomic databases | |||||||||||||||||||
| PeptideAtlas | Q16719. | ||||||||||||||||||
| PRIDE | Q16719. | ||||||||||||||||||
Genome annotation databases | |||||||||||||||||||
| Ensembl | ENST00000264170; ENSP00000264170; ENSG00000115919; Homo sapiens. [Genome view] ENST00000375773; ENSP00000364928; ENSG00000115919; Homo sapiens. [Genome view] ENST00000392874; ENSP00000376613; ENSG00000115919; Homo sapiens. [Genome view] ENST00000409512; ENSP00000386731; ENSG00000115919; Homo sapiens. [Genome view] ENST00000410015; ENSP00000387296; ENSG00000115919; Homo sapiens. [Genome view] ENST00000424385; ENSP00000401190; ENSG00000115919; Homo sapiens. [Genome view] | ||||||||||||||||||
| GeneID | 8942. | ||||||||||||||||||
| UCSC | uc002tvl.1. human. | ||||||||||||||||||
Organism-specific databases | |||||||||||||||||||
| CTD | 8942. | ||||||||||||||||||
| GeneCards | GC02P143351. | ||||||||||||||||||
| H-InvDB | HIX0002487. | ||||||||||||||||||
| HGNC | HGNC:6469. KYNU. | ||||||||||||||||||
| MIM | 236800. phenotype. 605197. gene. | ||||||||||||||||||
| Orphanet | 79155. Encephalopathy due to hydroxykynureninuria. | ||||||||||||||||||
| PharmGKB | PA30258. | ||||||||||||||||||
| GenAtlas | Search... | ||||||||||||||||||
Phylogenomic databases | |||||||||||||||||||
| HOGENOM | Q16719. | ||||||||||||||||||
| HOVERGEN | Q16719. | ||||||||||||||||||
| OMA | WQPLSGW. | ||||||||||||||||||
Enzyme and pathway databases | |||||||||||||||||||
| BRENDA | 3.7.1.3. 247. | ||||||||||||||||||
| Reactome | REACT_11193. Metabolism of vitamins and cofactors. REACT_13. Metabolism of amino acids. | ||||||||||||||||||
Gene expression databases | |||||||||||||||||||
| ArrayExpress | Q16719. | ||||||||||||||||||
| Bgee | Q16719. | ||||||||||||||||||
| CleanEx | HS_KYNU. | ||||||||||||||||||
| Genevestigator | Q16719. | ||||||||||||||||||
| GermOnline | ENSG00000115919. Homo sapiens. | ||||||||||||||||||
Family and domain databases | |||||||||||||||||||
| InterPro | IPR000192. Aminotrans_V/Cys_dSase. IPR010111. Kynureninase. IPR015421. PyrdxlP-dep_Trfase_major_sub1. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| Gene3D | G3DSA:3.40.640.10. PyrdxlP-dep_Trfase_major_sub1. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| PANTHER | PTHR14084. Kynureninase. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| Pfam | PF00266. Aminotran_5. 1 hit. [Graphical view] | ||||||||||||||||||
| TIGRFAMs | TIGR01814. kynureninase. 1 hit. | ||||||||||||||||||
| ProtoNet | Search... | ||||||||||||||||||
Other Resources | |||||||||||||||||||
| DrugBank | DB00160. L-Alanine. DB00114. Pyridoxal Phosphate. | ||||||||||||||||||
| NextBio | 33630. | ||||||||||||||||||
| SOURCE | Search... | ||||||||||||||||||
Entry information
| Entry name | KYNU_HUMAN | ||||||||
| Accession | Primary (citable) accession number: Q16719 Secondary accession number(s): B2RCZ5 | ||||||||
| Entry history |
| ||||||||
| Entry status | Reviewed (UniProtKB/Swiss-Prot) | ||||||||
| Annotation project | HPI (Human Proteome Initiative) | ||||||||
| Disclaimer | Any medical or genetic information present in this entry is provided for research, educational and informational purposes only. It is not in any way intended to be used as a substitute for professional medical advice, diagnosis, treatment or care. | ||||||||
Relevant documents
| Human chromosome 2 Human chromosome 2: entries, gene names and cross-references to MIM |
| Human entries with polymorphisms or disease mutations List of human entries with polymorphisms or disease mutations |
| Human polymorphisms and disease mutations Index of human polymorphisms and disease mutations |
| MIM cross-references Online Mendelian Inheritance in Man (MIM) cross-references in UniProtKB/Swiss-Prot |
| PATHWAY comments Index of metabolic and biosynthesis pathways |
| PDB cross-references Index of Protein Data Bank (PDB) cross-references |
| SIMILARITY comments Index of protein domains and families |

Clusters with


